四川省教育厅自然科学科研项目(2006D004)
- 作品数：3 被引量：21H指数：3
- 相关作者：李明洲李学伟朱砺李强肖华胜更多>>
- 相关机构：四川农业大学国家工程研究中心更多>>
- 发文基金：四川省教育厅自然科学科研项目四川省教育厅青年基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 猪背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达和主成分分析被引量：11
- 2008年
- 骨骼肌细胞和脂肪细胞在分化生长速度上相对竞争的平衡点是猪肉质和胴体性状的决定因素.利用Oligo功能分类芯片检测了瘦肉型的长白猪和脂肪型的太湖猪在初生、1、2、3、4和5月龄间背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的动态表达变化.差异表达分析结果显示,在初生至5月龄的品种间分别有15、16、11、13、18和20个基因的表达差异倍数大于2倍.品种内的方差分析表明,长白猪分别有18和22个基因,太湖猪分别有3和7个基因在月龄间的表达差异达极显著(P<0.01)和显著水平(P<0.05).主成分分析结果显示,先降后升是两品种内最具代表性的基因表达模式,且长白猪和太湖猪分别有7和6个基因的表达模式明显偏离其他基因,提示其可能受到了重要的调控.此外,5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证结果均与芯片结果呈正相关趋势.以上结果筛选出了对于猪肉质和胴体性状可能具有重要影响,值得深入研究的一些候选基因,为深入研究生长发育过程中参与肌纤维生长和脂肪酸合成关键基因的表达变化规律和互作调控机制提供了基础数据.
- 李明洲李学伟朱砺滕晓坤肖华胜李强陈磊
- 关键词：基因芯片基因差异表达主成分分析
- 利用功能分类基因芯片研究不同品种猪脂肪中特定基因的发育性变化被引量：3
- 2008年
- 利用Oligo功能分类基因芯片检测了瘦肉型的长白猪和脂肪型的太湖猪在1、2、3、4和5月龄间背部皮下脂肪中脂肪沉积代谢和细胞生长调控相关基因的动态表达变化。差异表达分析结果显示1～5月龄的品种间分别有10、6、11、8和19个基因的表达差异倍数大于2倍,且长白猪有25个基因在不同月龄间的表达差异达显著水平(P<0.05)。其中血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)、组织蛋白酶K(CTSK)、异柠檬酸脱氢酶2(NADP^+)(IDH2)、脂蛋白脂酶(LPL)、苹果酸酶1(MEI)、硬酯酰辅酶A去饱和酶(SCD)和解藕联蛋白2(UCP2)这7个基因不仅在同月龄的品种间和品种内的不同月龄间差异表达,主成分分析结果也显示其表达模式明显偏离其他基因,提示受到了特殊的调控。聚类分析结果显示1～5月龄间长白猪中正调控脂肪酸代谢基因的表达量逐渐上调,太湖猪中参与细胞生长调控基因的表达量平缓波动且变化幅度相对较小。另外,5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证结果均与芯片结果呈正相关趋势。结果成功筛选出了对猪胴体和肉质性状可能具有重要影响并值得深入研究的一些候选基因,初步揭示了相关基因的表达变化规律,为了解生长发育过程中脂肪酸合成与水解的动态平衡过程提供了基础数据。
- 李明洲李学伟朱砺姜延志唐国庆
- 关键词：脂肪基因表达谱
- 脂肪型和瘦肉型猪肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达分析和调控网络构建被引量：8
- 2008年
- 骨骼肌细胞和脂肪细胞在生长发育过程中受到的微效多基因间的互作调控机制是决定猪胴体和肉质等相关数量性状的分子基础.利用包含140个与猪肌肉生长和脂肪沉积密切相关基因的Oligo功能分类芯片检测了脂肪型的太湖猪和瘦肉型的长白猪在初生及生后5月龄间背最长肌中这些基因的动态表达变化,发现长白猪分别有18和22个基因,太湖猪分别有3和7个基因在月龄间的表达差异达极显著(P<0.01)和显著水平(P<0.05).聚类结果显示先降后升、逐渐上升和逐渐下降、逐渐上升分别是长白猪和太湖猪在初生至5月龄间最具代表性的基因表达模式(P<0.01),其中正调控肌纤维生长和脂肪酸合成的基因主要表现为逐渐上调,而抑制细胞增殖和正调控脂肪酸β氧化的基因则主要表现为逐渐下降.基于动态Bayes模型构建的基因调控网络从一定程度上揭示了两品种在肌肉生长和脂肪沉积等生理生化活动方面的明显差异,可从中挖掘相关性状潜在的关键特征基因.此外,对5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证显示两种检测方法所获结果的相关系数平均高达0.876±0.095.以上结果筛选出了对于猪胴体和肉质性状可能具有重要影响和具有深入研究价值的基因,为阐明肌肉生长和脂肪沉积的分子互作机制奠定了基础.
- 李明洲李学伟朱砺滕晓坤肖华胜帅素容陈磊李强郭玉姣
- 关键词：肌肉生长脂肪沉积基因差异表达基因调控网络
