国家高技术研究发展计划(2006AA10Z183)
- 作品数:3 被引量:3H指数:1
- 相关作者:李林严建兵李建生李青李慧更多>>
- 相关机构:中国农业大学河北农业大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 玉米油脂代谢相关基因的全基因组挖掘、表达谱及与籽粒油份QTL共定位分析被引量:2
- 2009年
- 油脂是植物中广泛存在且参与众多生物学过程的一类物质,具有重要的生物学功能.本研究从拟南芥和水稻油脂代谢基因出发,基于序列相似和功能域相同原则,克隆并注释了1003个玉米油脂代谢相关基因,其中,774个从GenBank中直接注释,229个为新克隆基因.电子表达谱分析发现97个基因在玉米籽粒、根、叶或分生组织中特异高表达.整合已发表籽粒油分相关QTL,在玉米基因组中发现70个控制籽粒油份的QTL富集区(分布于34%的基因组区域),其中59个QTL富集区内存在油脂代谢候选基因147个.在玉米籽粒中特异高表达的13个脂肪酸合成代谢基因都落在QTL富集区.本研究挖掘的油脂代谢相关基因信息,电子表达谱数据及整合的油份QTL结果,为玉米油份QTL的进一步精细定位和克隆、玉米籽粒油份形成的分子生物学基础研究提供了有益信息.
- 李林李慧李骥英徐淑兔杨小红李建生严建兵
- 关键词:电子克隆数量性状位点
- 玉米和水稻全基因组控制重组频率QTL的遗传定位分析被引量:1
- 2009年
- 【目的】尝试利用分子标记和QTL定位技术直接定位影响重组频率的QTL,探索物种遗传变异难易的分子基础。【方法】分别借助3张玉米和3张水稻分子标记连锁图,以所有染色体上标记的交换次数为性状进行分析。【结果】分别定位了7个和11个影响玉米和水稻重组频率的QTL。以玉米和水稻高密度分子标记连锁图IBM302和Genetic98每条染色体上标记的交换次数为性状,分别在玉米和水稻上定位了12个和57个QTL。【结论】影响重组频率的基因真实存在。培育高重组频率材料将有助于加速基因的定位和克隆、比较图位克隆基因和遗传育种进程。
- 李林李青王立博张祖新李建生严建兵
- 关键词:数量性状基因座分子育种图位克隆
- 玉米CACTA型转座子携带宿主基因片段转移新功能的发现与特性分析
- 2009年
- 携带宿主基因片段转座子的转座对基因组扩增、新基因产生具有重要作用.本研究以参与玉米维生素E合成的基因HGGT为例,采用生物信息学方法,寻找携带宿主基因片段转座子,并分析其特性.通过BLAST搜索和基因注释,发现了3个携带HGGT基因不同部位片段的ENSPM2_ZM转座子.利用公共数据库,在玉米自交系B73基因组中发现了另外66个能携带宿主基因片段的转座子.这69个转座子分布在10条染色体上,平均长度为3689bp.其中,有9个转座子携带了2个来源的宿主基因片段.通过比对玉米EST数据库,发现至少13个转座子可以转录,且2个携带不同来源宿主基因片段的转座子具有融合转录的特征.
- 李青李林戴景瑞李建生严建兵
- 关键词:基因片段玉米