江苏省自然科学基金(BK2010464)
- 作品数：6 被引量：31H指数：4
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- 相关机构：江苏省农业科学院南京农业大学更多>>
- 发文基金：江苏省农业科技自主创新基金国家大宗蔬菜产业技术体系建设项目江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 甜椒细胞质雄性不育基因的SRAP标记被引量：4
- 2012年
- 为了筛选出甜椒细胞质雄性不育基因的连锁相关序列扩增多态性(SRAP)标记,以甜椒细胞质雄性不育系(CMS)T6A和相应的保持系T6B为材料,利用SRAP分子标记技术,筛选与甜椒不育基因相关的特异片段。对该特异片段进行回收、克隆和测序,并用Blastn和Blastx程序在NCBI数据库中进行同源性检索和相似性比对。128对SRAP引物扩增共获得了3 844条100～1 000 bp的条带,平均每对引物组合可扩增出31条清晰的条带。检测到3个多态性位点,其中仅在不育系中扩出1条稳定的特异条带CMS T6A201。用Blastn程序进行核苷酸同源序列比较,特异片段CMS T6A201的序列与Ty3-gypsy类逆转座子的部分序列高度同源;用Blastx程序与蛋白质数据库进行同源性比对,由该片段推测的氨基酸序列与水稻假拟Ty3-gypsy逆转座子蛋白质、蒺藜苜蓿的反转录酶、水稻gag-pol蛋白质以及马铃薯的假拟gag-pol蛋白质等相似性较高。甜椒细胞质雄性不育系特异片段CMS T6A201的功能可能与逆转座子有关。
- 吴国平袁稳刘金兵刁卫平王述彬潘宝贵戈伟侯喜林
- 关键词：甜椒SRAP标记
- 甜椒胞质雄性不育恢复系SRAP及SCAR标记被引量：5
- 2012年
- 以甜椒胞质雄性不育恢复系5-2R1和相应的保持系5-2为试材,利用SRAP分子标记技术筛选与甜椒恢复基因相关的分子标记。128对SRAP引物共扩增获得了3796条从100bp至800bp大小不同的条带,平均每对引物组合可扩增出30条清晰的条带,检测到4个多态性位点,其中恢复系材料仅有1个。对该特异片段进行回收、克隆和测序,结果表明该片段全长为259bp。经数据库比对分析表明,该片段与线粒体中的NADH脱氢酶第5亚基(GenBank:EF151914.1)具有81%的同源性;同时,该片段与辣椒BAC克隆PEPBAC 158K24(GenBank:FJ597540.1)的部分序列高度同源。根据序列特点设计特异SCAR引物,对恢复系和保持系进行扩增验证,仅在恢复系中扩增出目的条带,表明已成功地将此SRAP标记转化为简单、稳定的SCAR标记。我们推测本研究获得的SCAR标记可能与胞质雄性不育恢复性状连锁。
- 吴国平袁稳刘金兵刁卫平王述彬潘宝贵戈伟侯喜林
- 关键词：甜椒恢复基因SRAPSCAR
- 辣椒细胞质雄性不育系和保持系线粒体DNA差异的SRAP分析被引量：3
- 2012年
- 以辣椒细胞质雄性不育系21A及其保持系21B的线粒体DNA为材料进行SRAP分析,结果表明,从128对引物扩增获得了1 440条100～1 000 bp的条带,多态性位点仅有9个,占0.63%,其中7条多态性条带位于21A中;对多态性条带回收、克隆和测序分析后发现,9个克隆在GenBank中找到了相似的功能,绝大部分与能量代谢有关;利用21A中的多态性序列特点设计SCAR引物,对21A和21B的基因组DNA进行扩增验证,3对引物在21A中扩增出目的条带,表明已成功地将SRAP标记转化为SCAR标记,是新发现的与辣椒细胞质雄性不育基因相关的片段。
- 袁稳吴国平王述彬刁卫平刘金兵潘宝贵戈伟
- 关键词：辣椒细胞质雄性不育SRAP
- 辣椒Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析被引量：10
- 2012年
- 以辣椒属5个栽培种叶片为试材,利用Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守序列设计简并引物,PCR扩增后均获得了260bp左右的目的条带。对C.annuum的扩增产物进行纯化、克隆和测序,经Mega4和DNAstar软件分析后,获得25条逆转录酶序列,核苷酸序列长度变化范围为225～272bp,这些序列存在高度的异质性,主要表现为缺失突变,同源性范围为23.1%～93.2%,核苷酸聚类分为7个组。翻译成氨基酸后,有9条序列存在1～3个不同程度的终止密码子突变,4条序列存在移框突变。将这25条逆转录酶的氨基酸序列与已发表的不同物种同一类型逆转座子的逆转酶序列进行聚类分析,表明辣椒的Ty1-copia型逆转座子与烟草、矮牵牛、马铃薯有很近的关系。
- 刁卫平王述彬刘金兵潘宝贵戈伟
- 关键词：辣椒逆转录酶
- 采用mRNA差异显示技术分离辣椒抗黄瓜花叶病毒病相关基因片断被引量：1
- 2011年
- 为探索辣椒黄瓜花叶病毒(CMV)的抗性相关基因,采用mRNA差异显示技术探讨抗、感辣椒在接种CMV前后基因表达的差异。对获得的87个差异片断进行回收、重扩增和克隆后共获得26个阳性克隆。数据库比对分析结果表明,仅有7个cDNA克隆在GenBank中找到了相似的功能,与能量代谢、转录因子和代谢酶有关,其余cDNA片断在数据库中未发现匹配信息;抗、感病辣椒材料均具有诱导表达特点,抗病材料(Vc16a)差异表达条带的数目比感病材料(SS69)少。研究结果为进一步分离和克隆辣椒抗CMV相关基因提供了试验依据。
- 刁卫平杨学玲王述彬刘金兵潘宝贵戈伟
- 关键词：辣椒MRNA差异显示黄瓜花叶病毒抗病基因
- 辣椒新品种‘苏椒16号’被引量：9
- 2011年
- ‘苏椒16号’是以母本‘05X375’与父本‘05X新55’配制的早熟辣椒一代杂种。果实长灯笼形,青果绿色,成熟果红色,果面光滑,果长15～16cm,平均单果质量62.1g,微辣,产量44000kg.hm-2,商品性好,耐贮运,耐低温。高抗青枯病、疫病,适合在长江中下游地区保护地栽培。
- 王述彬刘金兵潘宝贵刁卫平戈伟
- 关键词：辣椒
