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北京市自然科学基金(7052020)

作品数:3 被引量:7H指数:2
相关作者:朱汝南钱渊赵林清邓洁王芳更多>>
相关机构:首都儿科研究所首都儿科研究所附属儿童医院更多>>
发文基金:北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇医药卫生

主题

  • 3篇人偏肺病毒
  • 3篇偏肺病毒
  • 1篇蛋白
  • 1篇原核表达
  • 1篇逆转
  • 1篇逆转录
  • 1篇逆转录PCR
  • 1篇逆转录聚合酶...
  • 1篇转录
  • 1篇酶链反应
  • 1篇聚合酶
  • 1篇聚合酶链反应
  • 1篇基因
  • 1篇基因特征
  • 1篇基因型
  • 1篇基质
  • 1篇基质蛋白
  • 1篇合酶
  • 1篇肺病
  • 1篇编码基因

机构

  • 3篇首都儿科研究...
  • 1篇首都儿科研究...

作者

  • 3篇赵林清
  • 3篇钱渊
  • 3篇朱汝南
  • 2篇王芳
  • 2篇邓洁
  • 1篇丁雅馨
  • 1篇孙宇
  • 1篇黄荣研
  • 1篇曹守春
  • 1篇李国华
  • 1篇廖斌

传媒

  • 2篇病毒学报
  • 1篇中华检验医学...

年份

  • 1篇2010
  • 1篇2007
  • 1篇2006
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
北京地区两株人偏肺病毒M蛋白基因的原核表达及抗原活性分析被引量:1
2007年
Human metapneumovirus(hMPV) is a recently identified respiratory virus more like human respiratory syncytial virus in clinical symptoms.Matrix protein(M) is one of the most important structural proteins.For further studying of hMPV,the full length of M genes from the recombinant plasmid pUCm-M1816 and pUCm-M1817 were cloned by PCR and sub-cloned into the pET30a(+) vector,which is a prokaryotic expression vector,after dual-enzyme digestion with Bam HI and Xho I.The positive recombinated plasmids were transformed into E.coli BL21(DE3) and expressed under the inducing of IPTG.Target proteins were characterized by SDSPAGE and Western blotting.In this article,we’ve successfully constructed the recombinated plasmids pET30a-M1816 and pET30a-M1817 which have correct open reading frames confirmed by dual-enzyme digestion analysis and sequencing. The fusion proteins with 6·His-N were highly produced after inducing by 1mmol/L IPTG at 37℃.A unique protein band with approximate 27.6 kD was characterized by SDS-PAGE.Most of the target protein existed in inclusion body.Western blot analysis showed that the target protein has specific binding reaction to rabbit antiserum against polypeptides of the matrix protein of hMPV.So the M genes were highly expressed in the prokaryotic system and the expressed M proteins have specific antigenic activities.It can be used for further studying of hMPV infections in Beijing.
曹守春钱渊李国华朱汝南赵林清丁雅馨
关键词:人偏肺病毒原核表达
人偏肺病毒基因型双重逆转录PCR检测方法的建立被引量:2
2010年
目的建立一种鉴别不同基因型hMPV的RT—PCR方法。方法根据不同基因型的hMPVG蛋白基因序列设计合成A、B基因型的特异性引物,在一次双重PCR反应中根据扩增产物大小鉴别不同基因型。用该方法鉴别37份hMPV阳性的临床标本的基因型。结果用hMPVG蛋白编码基因的分型引物进行PCR反应,对已知的hMPV阳性标本直接进行分型得到的扩增产物大小易于区分;对常见的呼吸道病毒无非特异扩增,显示引物特异性良好。对37份临床标本进行基因分型结果显示,20份A基因型分型结果与M基因测序分型结果一致,17份经M基因测序分型为B基因型的阳性标本中有14份与M基因测序分型结果一致,3份未得到扩增产物从而不能分型,总符合率为91.9%[(20+14)/37]。结论成功建立了一种可以鉴别不同基因型的hMPV的RT—PCR方法。
王芳朱汝南钱渊邓洁孙宇赵林清廖斌黄荣研
关键词:变性肺病毒基因型逆转录聚合酶链反应
北京地区人偏肺病毒膜表面糖蛋白G编码基因和特征的分析被引量:4
2006年
为了解北京地区人偏肺病毒(hMPV)膜表面糖蛋白G编码基因的特征,提取2003年和2004年各6份hMPV阳性的临床呼吸道标本中的RNA,经用随机引物合成cDNA后,用特异性引物扩增G蛋白全基因,克隆至pBST载体中并进行测序。用生物软件与GenBank中hMPV的基因序列进行比较和种系进化分析。12株hMPV可以分为两个主要的进化簇1和2。每个进化簇还可以再分为不同的亚进化簇。3株(2003年)hMPV属于进化簇1;9株(3株2003年和6株2004年)hMPV属于进化簇2。这12株hMPV G蛋白基因的核苷酸长度在624~711nt,使用了两种不同的终止密码,编码的氨基酸长度为208~236aa,蛋白质分子量为22.9~25.8kD。与进化簇2相比,进化簇1的3株hMPV都出现了3个核苷酸的缺失,但未改变读码框架。同一进化簇内的hMPV G蛋白基因核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.7%~100%和91.8%~100%,不同进化簇间的核苷酸和氨基酸的同源性分别为56.3%~57.4%和34.3%~38.2%。疏水性分析表明这12株hMPV G蛋白是典型的Ⅱ型跨膜锚定蛋白,分别与两个进化簇代表株的疏水图一致。这些hMPV的G蛋白氨基酸的替换集中在胞外区。它们都含有高百分比的脯氨酸(P)、丝氨酸(S)和苏氨酸(T),含有相当数量的位于胞外区的O-连接糖基化化点。这些hMPV的G蛋白的N连接糖基化位点数目和位置不尽相同。通过对G蛋白基因的分析显示,2003年和2004年北京地区流行的hMPV分属于两种不同的进化簇。基因分析品示hMPV的G蛋白是高精基化的膜表面蛋白,具有与同属于副粘病毒科、肺病毒亚科的人呼吸道合胞病毒(hRSV)的G蛋白相似的基因特征,推测其功能和在感染免疫中的作用相当于hRSV的G蛋白,但有待进一步深入研究予以证实。
朱汝南钱渊赵林清邓洁王芳
关键词:人偏肺病毒基因特征
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