国家自然科学基金(81071011)
- 作品数：7 被引量：18H指数：2
- 相关作者：蔡彦宁陈彪林庆玲丁晖王丹慧更多>>
- 相关机构：首都医科大学宣武医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 钙蛋白酶抑制蛋白基因座多态性与散发性帕金森病晚期发作的关联性分析被引量：4
- 2013年
- 目的探讨中国汉族人群中钙蛋白酶抑制蛋白（CAST）基因座单核苷酸多态性与散发性帕金森病（PD）的晚期发作之间的关联性。方法取370名PD晚发患者和390名无神经系统疾病健康对照，取外周血提取DNA，使用基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪（MALDI-TOF-MS）对CAST基因的24个标签单核苷酸多态性（SNPs）进行基因分型，用x^2-检验、logistic回归模型以及以贝叶斯算法（Bayesianalgorithm）为基础的PHASE软件进行统计学分析。结果在共显性基因模式中，未发现任何SNP与PD显著相关（P〉0．05）；用年龄和性别校准后，进一步进行Logistic回归分析显示，在显性基因模式和隐性基因模式中均未发现任何CAST的基因多态性与PD有相关性（P〉0．05）。连锁不平衡分析发现4个强连锁不平衡区域，未发现任何单倍型与PD发病密切相关（P〉0．05）。结论在中国汉族人群中，CAST与散发性PD的晚期发作无显著关联性。
- 张燕莉王丹慧丁晖陈彪蔡彦宁左晓虹
- 关键词：钙蛋白酶抑制蛋白单核苷酸多态性
- 小鼠外周组织时钟基因启动子区甲基化分析被引量：2
- 2012年
- 目的应用一种简单快速经济的方法检测8个主要时钟基因PER1、PER2、CRY1、CRY2、CLOCK、NPAS2、BMAL1和BMAL2启动子区甲基化状态,检测小鼠外周组织肝、心、肾、胸腺、睾丸时钟基因启动子区甲基化状态。方法用偏重亚硫酸氢钠和对苯二酚对基因组DNA进行修饰。修饰后的DNA为模板,两套不同的引物对:甲基化特异性引物对和非甲基化特异性引物对扩增小鼠肝、心、肾、胸腺、睾丸组织时钟基因启动子区。PCR产物进行电泳和测序。结果扩增产物与预期片段大小相符合。PCR产物经过直接测序进一步证实小鼠外周组织时钟基因启动子区均为非甲基化状态。结论建立了一种检测小鼠时钟基因启动子区甲基化的新方法,借此证明成年小鼠5个外周组织8个时钟基因启动子区均呈非甲基化状态。
- 林庆玲蔡彦宁袁艳鹏左晓虹
- 关键词：时钟基因启动子甲基化特异性PCR
- 帕金森病患者外周血白细胞中时钟基因Bmal1和Bmal2的表达被引量：2
- 2011年
- 目的研究帕金森病患者时钟基因的表达，探讨帕金森病的分子时钟机制。方法实验对象为17例帕金森病（PD）患者（9例男性，8例女性）和16例正常人对照（9例男性，7例女性），分别在夜间21：00、00：00、06：00和09：00四个时间点取血样，用实时定量RT—PCR检测时钟基因Bmal1和Bmal2的mRNA表达水平。结果PD患者中，Bmal1在21：00、00：00、06：00的表达水平与正常对照差异具有显著性：21：00[（22．17±4．09），（51．14±8．31），P=0．003]；00：00[（30．30±5．45），（100．00±24．71），P=0．008]；06：00[（19．02±3．33），（65．61±14．11），P=0．002]。Bmal2在21：00、00：00的表达水平与正常对照差异有显著性：21：00[（48．09±7．40），（84．96±9．34），P=0．005]；00：00[（65．85±7．88），（100．00±11．78），P=0．025]。结论PD患者的周围分子时钟发生了改变。PD患者时钟基因Bmal1和Bmal2在外周血的相对表达水平明显减低，为疾病监控和研究疾病对药物的反应性提供分子基础。
- 林庆玲蔡彦宁袁艳鹏左晓虹陈彪
- 关键词：BMAL1昼夜节律白细胞帕金森病
- 异柠檬酸脱氢酶1基因突变焦磷酸测序检测方法的建立被引量：2
- 2014年
- 目的建立异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)基因突变的焦磷酸测序检测方法,确定该方法的检测灵敏度。分析焦磷酸测序法与直接测序法对于鉴定IDH1突变的差异。方法构建携带野生型和突变型IDH1基因的质粒,使用质粒优化焦磷酸测序方法。使用已知比例的野生型和突变型质粒作为模版,确定突变的检测灵敏度。针对96例胶质瘤患者手术切除标本的基因组DNA,分别使用直接测序法和焦磷酸测序法,鉴定IDH1基因突变类型,并比较。结果使用焦磷酸测序能够检测到低至2%的IDH1突变。直接测序检出突变阳性率为32.3%、焦磷酸测序检出突变阳性率为74.0%。结论焦磷酸测序法检测IDH1基因突变灵敏可靠,适合临床分子诊断。
- 王丹慧蔡彦宁张燕莉高杰杨彩侠
- 关键词：突变
- 帕金森病患者外周血白细胞中时钟基因Bmal1和Bma12的表达
- 研究帕金森病患者时钟基因的表达,探讨帕金森病的分子时钟机制。实验对象为17例帕金森病（PD）患者（9例男性,8例女性）和16例正常人对照（9例男性,7例女性）,分别在21:00、00:00、06:00和09:00四个时间...
- 张燕莉林庆玲蔡彦宁袁艳鹏左晓虹陈彪
- 关键词：BMAL1昼夜节律白细胞帕金森病
- 文献传递
- 中国人群PITX3基因多态性与帕金森病的相关性被引量：7
- 2012年
- 目的分析中国人群PITX3基因多态性与帕金森病的相关性。方法使用连接酶检测反应（LDR）法，分析509例晚发性帕金森病（LOPD）患者、290例早发性帕金森病（EOPD）患者和494例正常对照中PITX3基因单核苷酸多态性（SNPs）位点rs2281983、rs4919621和rs3758549基因型。结果PITX3基因SNPs位点rs2281983、rs4919621和rs3758549的基因型和等位基因频率在799例帕金森病患者和494例正常对照组间（基因型频率P值分别为0．494，0．343，0．951；等位基因频率P值分别为0．369，0．297，0．823）、509例LOPD和494例正常对照组间（基因型频率P值分别为0．522，0．350，0．630；等位基因频率P值分别为0．413，0．328，0．571）、290例EOPD和494例正常对照组间（基因型频率P值分别为0．499，0．492，0．552；等位基因频率P值分别为0．321，0．301，0．931）、509例LOPD和290例EOPD间（基因型频率P值分别为0．577，0．710，0．127；等位基因频率P值分别为0．346，0．472，0．077）均差异无统计学意义。三个SNPs位点与PD无关联。结论中国人群中，PITX3基因多态性不是帕金森病的易感因素。
- 林庆玲蔡彦宁王丹慧丁晖顾朱勤马敬红陈彪
- 关键词：早发性帕金森病单核苷酸多态性
- 中国人群pitx3基因多态性与晚发散发性帕金森病的相关研究被引量：2
- 2011年
- 目的分析pitx3基因多态性与晚发散发性帕金森病的遗传关联。方法使用连接酶检测反应(LDR)法,分析509例晚发散发性帕金森病(Parkinson's disease,PD)患者和494例正常对照者中pitx3基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs2281983、rs4919621和rs3758549。随机选取10%样品直接测序进行验证。结果 pitx3基因SNP位点rs2281983、rs4919621和rs3758549的基因频率在晚发散发性帕金森病患者和正常对照组间差异无统计学意义。3个SNP位点与晚发散发性PD无关联。结论中国人群中,pitx3不是晚发散发性帕金森病的易感因素。
- 林庆玲蔡彦宁丁晖顾朱勤马敬红陈彪
- 关键词：单核苷酸多态性
- 帕金森病患者时钟基因启动子区甲基化分析被引量：1
- 2011年
- 目的分析帕金森病(Parkinson's disease,PD)患者和正常老年对照组时钟基因启动子区甲基化水平,探讨帕金森病患者时钟基因异常表达的机制。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)法,检测206例帕金森病患者和181例正常老年对照者的7种时钟基因启动子甲基化水平。结果 7种时钟基因中,cry1和npas2启动子区存在明显甲基化。另5种时钟基因启动子(per1、per2、cry2、clock、bmal1)未发现明显甲基化。PD患者中npas2甲基化频率明显下降。结论 PD患者时钟基因的异常表达可能与时钟基因启动子区甲基化的改变有关。
- 林庆玲蔡彦宁丁晖顾朱勤马敬红陈彪
- 关键词：帕金森病启动子区甲基化时钟基因
