湖南省卫生厅科研基金(B2010-004)
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 相关作者:陈主初曾谷清易红梁宋平张鹏飞更多>>
- 相关机构:中南大学湖南师范大学南华大学更多>>
- 发文基金:湖南省卫生厅科研基金国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 鼻咽癌细胞株6-10B质膜的分离及其蛋白质表达谱分析被引量:1
- 2013年
- 建立鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)细胞株6-10B的质膜蛋白质表达谱,为鼻咽癌癌变机制研究提供有益数据资料。运用差速离心联合双水相的方法纯化NPC细胞6-10B质膜,Western blot印迹和电镜检测验证质膜纯度,一维凝胶电泳分离质膜蛋白质,液相色谱/串联质谱结合生物信息学鉴定质膜蛋白质,肿瘤差异蛋白质组数据库(dbDEPD)搜索质膜蛋白质与其他肿瘤的相关性。共鉴定到406种非冗余蛋白质,质膜蛋白质和质膜相关蛋白共255个(占62.8%),dbDEPD搜索显示145种质膜蛋白质中的46个与其他肿瘤相关,其中18个质膜蛋白质与其他肿瘤转移相关,进一步分析发现质膜蛋白质CD225、CD104和p63与同属头颈部肿瘤的口腔癌转移相关,提示它们也可能是NPC潜在的转移相关蛋白。本研究建立了NPC细胞株6-10B的质膜蛋白质表达谱数据库,为NPC癌变分子机制研究提供有价值的数据和信息。
- 张鹏飞曾谷清汤参娥易红梁宋平陈主初肖志强
- 关键词:鼻咽癌质膜蛋白质组双水相质谱
- 鼻咽癌5-8F细胞膜蛋白质组初步分析被引量:1
- 2012年
- 细胞膜蛋白是细胞的重要组成部分,作为细胞的"门铃"与"门户",参与细胞内外物质交换、信息转换、细胞生长发育、细胞迁移以及免疫应答等重要生理活动.为鉴定鼻咽癌转移相关膜蛋白,运用差速离心联合双水相方法分离纯化鼻咽癌高转移细胞5-8F的细胞膜,SDS-PAGE分离膜蛋白,液相色谱/电喷雾串联质谱分析(LC-MS/MS)结合生物信息学分析鉴定出316种非冗余蛋白质,其中152种(48.5%)被注释为膜蛋白或膜相关蛋白.通过肿瘤差异蛋白质组数据库(dbDEPD)搜索,发现在114个膜蛋白中有49种膜蛋白与其它肿瘤的发生发展密切相关,其中21个膜蛋白与肿瘤转移相关.进一步分析发现膜蛋白CD104、VDAC2、CD298和SLC25A3与同属头颈部肿瘤的口腔癌转移相关,提示这4个膜蛋白也可能是鼻咽癌潜在的转移相关蛋白.研究结果提供了一个鼻咽癌细胞5-8F包含中高丰度膜蛋白的数据库,为进一步研究头颈部肿瘤鼻咽癌癌变分子机理积累了有价值的资料.
- 张鹏飞曾谷清易红梁宋平陈主初肖志强
- 关键词:鼻咽癌双水相