国家高技术研究发展计划(2003AA203031)
- 作品数：6 被引量：11H指数：2
- 相关作者：郭晓奎杨宏亮姜叙诚李文俊宋卫峰更多>>
- 相关机构：上海第二医科大学上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 问号钩体趋化相关基因特征分析被引量：1
- 2005年
- 目的预测问号钩体黄疸出血群赖型赖株的趋化信号传导途径,并深入分析趋化相关基因。方法使用ProtParamtool,NCBI/Blastp进行蛋白参数分析和结构域分析,使用Clustalw软件进行多序列对比,与大肠埃希菌K-12趋化相关基因进行比较。结果问号钩体趋化相关基因共30个,分为MCPs和che两组基因,功能与大肠埃希菌趋化相关基因相似,并预测出问号钩体趋化信号传导途径。结论问号钩体趋化相关基因较大肠埃希菌、苍白密螺旋体和伯氏疏螺旋体多,提示其趋化传导途径更为复杂,适应宿主的能力也更强,可能是钩体的重要毒力因子之一。
- 霍丽杨宏亮李文俊李振红郭晓奎姜叙诚
- 关键词：钩端螺旋体趋化性信号传导途径生物信息学
- 问号钩端螺旋体全基因组的更新注释被引量：3
- 2004年
- 目的对问号钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中未注释的基因进行重新注释,并寻找可能的新致病基因。方法将钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中功能未知的编码序列(CDSs)在BLASTP/NCBI数据库中比较,初步预测基因功能,对可能的致病基因及其编码产物运用多种生物学软件进行深入分析。结果未知CDSs中有82个与NCBI数据库中的编码蛋白序列有很高的同源性,其中LA0063和LA3291编码金属蛋白酶,可能与致病有关。结论通过钩端螺旋体黄疸出血群赖株全基因组数据库中功能未知的CDSs进行定期比对,可以不断完善该数据库的功能注释,同时可以发现新的致病基因,有助于钩端螺旋体病致病机理的最终阐明。
- 宋卫峰赵蔚郭晓奎
- 关键词：问号钩端螺旋体基因组皮肤破损染色体
- 钩端螺旋体基因组学研究进展被引量：5
- 2005年
- 郭晓奎
- 关键词：钩端螺旋体钩体病基因组学研究苍白密螺旋体自然疫源性疾病伯氏疏螺旋体
- 钩端螺旋体在豚鼠组织中的动态分布和钩体病的病理改变被引量：1
- 2005年
- 杨宏亮姜叙诚朱平李文俊傅爱芬赵伶兹郭晓奎赵国屏
- 关键词：问号钩端螺旋体病理改变钩体病鼠组织透射电镜观察
- 逆向疫苗学及其应用
- 2006年
- 钟怡何平杨宏亮郭晓奎
- 关键词：亚单位疫苗重组蛋白疫苗减毒活疫苗实验室环境牛痘疫苗病毒疫苗
- 问号钩体(Leptospira interrogans)Ⅲ型分泌系统相关基因分析被引量：1
- 2006年
- 根据鼠疫耶尔森菌Ⅲ型分泌系统和大肠杆菌鞭毛系统中已知蛋白,以NCB I/B last软件搜索问号钩体全基因组中与之高度同源的蛋白;用TMHMM-2.0对所得蛋白跨膜区进行分析;用In terpro对所得蛋白结构域进行分析,初步整理出问号钩体Ⅲ型分泌系统组成,发现10个被注释为鞭毛系统的相关基因和Ⅲ型分泌系统有关,并和鼠疫耶尔森菌Ⅲ型分泌系统相关蛋白有较高同源性。6个为跨内膜蛋白,4个为胞内蛋白,并共同组成Ⅲ型分泌系统的内膜孔道,但没能发现组成外膜孔道的蛋白组分。问号钩体Ⅲ型分泌系统与鞭毛组装系统共用相同的部分组分,但钩体Ⅲ型分泌系统和经典Ⅲ型分泌系统有一定程度的差别:它缺乏外膜孔道结构,且分泌产物先进入胞周间隙。
- 丁希喆李文俊杨宏亮郭晓奎姜叙诚
