天津市自然科学基金(13JCZDJC29000)
- 作品数：8 被引量：34H指数：3
- 相关作者：陈成彬宋文芹王春国韩春乐韦韬更多>>
- 相关机构：南开大学天津科润蔬菜研究所电子科技大学更多>>
- 发文基金：天津市自然科学基金国家自然科学基金天津市应用基础与前沿技术研究计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 植物染色体分子核型技术研究进展被引量：3
- 2014年
- 近年来,荧光原位杂交及荧光分带等细胞遗传学技术的发展,提供了更多的染色体信息,使科研工作者能从更精细水平上对植物进行核型分析,更好地分辨基因组内各条非同源染色体,以及进行分化程度小的基因组间的比较。这种核型分析技术为研究染色体行为和变异,单个基因及转基因在基因组内的定位等开辟了新的途径。现在阐述以多色荧光原位杂交(mFISH)、基因组原位杂交(GISH)、染色体绘染(chromosome painting,CP)等荧光原位杂交为基础的染色体分子核型基础上,分析了荧光分带技术(fluorochrome banding)在分子核型中的应用,并对染色体分子核型技术在植物基因组功能研究领域的应用进行了展望。
- 张力鹏刘博陈成彬
- 关键词：染色体荧光原位杂交
- 十字花科部分蔬菜HRD基因的克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2014年
- 根据NCBI上得到的拟南芥HRD基因序列,利用同源序列克隆的方法,设计引物,从12种十字花科蔬菜中克隆出其核酸序列,并进行生物信息学分析,旨在验证克隆出的序列与拟南芥HRD基因是否具有同源性.对这些得到的核酸序列从DNA序列、氨基酸序列的相似性、亲/疏水性、2级结构、功能域、3级结构、同源进化树等进行了预测和较为全面的分析.结果显示经PCR扩增,都得到了大小与拟南芥HRD基因基本一致的序列,长度在555bp左右.其基因序列、氨基酸序列比对同源性分别达到93.14%和89.74%;亲/疏水性分析表明该基因编码的蛋白为亲水性蛋白;推导的氨基酸序列中均存在AP2功能结构域,属于十字花科AP2/ERF类家族转录因子基因;同源进化树分析表明它们具有很高的同源性,说明所克隆的序列与拟南芥HRD基因由同一个基因进化而来,是十字花科植物中的保守基因.
- 韩春乐王志航王经强刘驰王斌丁宁陈成彬
- 关键词：十字花科ERF非生物胁迫
- 序列特异性核酸酶及其在植物基因组定向修饰中的应用被引量：3
- 2013年
- 通过对基因组特定区域进行精确定向遗传修饰,一方面可以针对目标序列进行精确突变,获得突变材料,对目标基因功能进行明确鉴定;另一方面可以进行目标序列的精确置换或插入,将外源基因随机导入造成的表达及遗传的不确定性降至最低。传统的基因定向修饰技术仅依赖于细胞自身的同源重组,修饰效率低下,而且还存在位置效应和遗传不稳定等诸多问题。通过引入序列特异性核酸酶(sequence-specific nucleases,SSN),可以在基因组特定位点造成DNA双链断裂(double strand break,DSB),促进依赖于细胞内源"同源重组"及"非同源末端连接"的DNA修复事件的定向发生,实现基因组定向遗传修饰效率的大幅提升。迄今为止,在基因组定向遗传修饰研究及应用领域,已经有多种不同类型的序列特异性核酸酶被有效使用,在多种生物中实现了不同类型的基因组定向遗传修饰。该文首先综述了SSN的结构特征及技术原理,然后对SSN技术在植物基因组定向遗传修饰中的研究进展和应用前景进行了重点介绍。
- 韦韬张勇刘玉郑雪莲邓科君陈成彬宋文芹
- 关键词：DNA修复
- 花椰菜BoPGIP2基因的克隆与表达水平分析被引量：2
- 2016年
- 以3个品系花椰菜为试材,采用同源克隆的方法,克隆了花椰菜BoPGIP2基因,并对表达水平进行分析。结果表明:该基因与油菜的PGIP2基因序列有较高的相似性;ExPASy分析发现BoPGIP2理论分子量为37.02kDa,等电点为8.51,分子式为C_(1672)H_(2604)N_(436O487)S_(13),不稳定系数为34.95,为稳定蛋白,脂肪族指数为92.48,GRAVY值为-0.096,表明其在一级结构上的亲水性、疏水性差异不显著。亚细胞定位预测分析表明,此蛋白属于分泌途径信号肽蛋白;qRTPCR分析发现BoPGIP2基因在花椰菜高抗菌核病品系、中抗菌核病品系中均是茎和叶中相对表达量较高,而在易感菌核病品系中则是根中相对表达量最高,叶和茎中相对表达量较低,这与抗菌核病强弱具有一致性,推测此基因很可能在调节花椰菜的抗菌核病中起着重要作用。
- 赵风治王雪莹王欣蕾马昕玮江汉民陈成彬
- 关键词：花椰菜基因克隆核盘菌
- 六个金银花栽培品种的核型分析被引量：4
- 2017年
- 以6个金银花栽培品种的茎尖组织为试材,采用常规压片法进行染色体制片和核型分析,为良种选育提供细胞学基础。结果表明:6个金银花品种的染色体基数均为x=9,其中"九丰1号"是经大毛花加倍而成的同源四倍体,其核型公式为2n=4x=36=4m+24sm+8st(3SAT),属3A型,其余品种均为二倍体。"小鸡爪"的核型公式为2n=2x=18=4m+8sm+6st(2SAT),属3A型;"鸡爪花"的核型公式为2n=2x=18=2m+8sm+8st(4SAT),属3B型;"大毛花"的核型公式为2n=2x=18=2m+14sm+2st,属3A型;"四季金银花"的核型公式为2n=2x=18=2m+10sm+6st(4SAT),属3A型;菰腺忍冬的核型公式为2n=2x=18=4m+14sm,属2A型。核型不对称系数表明菰腺忍冬在进化上较为原始。"小鸡爪""大毛花""九丰1号""四季金银花"都属3A类型,表明这4个品种在进化上亲缘关系最为密切。
- 张力鹏郏书行徐仲凯朱哲凡罗思陈成彬
- 关键词：金银花染色体制片核型分析
- 花椰菜查尔酮合酶基因的克隆及功能分析被引量：6
- 2016年
- 基于同源序列克隆技术,从花椰菜中克隆了查尔酮合酶(chalcone synthase;CHS)基因cDNA全长,将该基因成功转入花椰菜,经过Basta抗性筛选,PCR鉴定,得到7株花椰菜转基因过表达阳性植株.转基因花椰菜的核盘菌胁迫分析显示,与对照花椰菜相比,在病原胁迫的不同时期,转基因植株中BoCHS基因的表达量显著上升,且随着胁迫时间的增加,该基因表达量均增高,且在36 h时达到最大值,表明转基因花椰菜通过过量表达CHS来增强自身对菌核病的抗性,使植株对菌核病的抗性明显增强.与查尔酮合酶在油菜、向日葵、烟草等中的抗病作用一致,表明花椰菜BoCHS基因也是抗菌核病的重要基因.
- 赵风治马钰婕韦韬江汉民王春国宋文芹孙德岭陈成彬
- 关键词：花椰菜菌核病查尔酮合酶转基因
- 黄秋葵查尔酮合成酶基因AeCHS的克隆与表达分析被引量：17
- 2014年
- 采用同源序列克隆和RT-PCR技术,首次克隆得到黄秋葵查尔酮合成酶基因(CHS)cDNA全长序列。序列分析表明,该序列全长1175 bp,包括一个1170 bp的完整ORF,编码389个氨基酸,命名为AeCHS。生物信息学分析表明,本研究所获得的AeCHS氨基酸序列与同科植物黄蜀葵和陆地棉的同源性较高,分别达99.23%和97.44%,AeCHS推断的氨基酸序列含有CHS蛋白的标签序列GFGPG以及4个保守活性位点Cys164、Phe215、His303、Asn336。实时荧光定量PCR分析黄秋葵果实、花、叶片不同发育时期AeCHS基因的表达量,结果表明AeCHS基因在上述植物材料中表现出不同的表达模式:花>果实>叶片,具体到不同植物组织,AeCHS基因在生长6 d的果实、盛开的花朵以及植株顶端第4片叶子中的表达量较高。
- 王旭韩春乐周亚楠王春国宋文芹陈成彬
- 关键词：查尔酮合成酶基因克隆荧光定量PCR
- 黑杨DNA甲基转移酶基因片段的分离及表达分析
- 2013年
- 利用同源序列克隆技术，分离了三倍体黑杨中4类（MET、CMT、DRM、DNMT2）8个特异甲基转移酶片段，其中，5个片段与二倍体同源性达到100％，3个片段发生了剪切变化。通过实时定量PCR技术检测8个甲基转移酶在不同倍性、不同部位、不同生长时期间表达模式的差异，通过对5个不同部位基因表达的检测，表明不同倍性黑杨在相同的部位可能由不同种类的甲基转移酶参与主要的甲基化调控。通过分析植株从分化早期的茎尖到分化晚期的叶和茎整个生长过程中基因表达的情况，发现随着时间的推移，MET家族（PnDl和PnD2）基因可能是拮抗调节，CMT（PnD3和PnD4）家族基因可能是协同调节；而隶属于DNMT2家族的PnD6基因在各部位的表达都比较弱，唯独三倍体茎尖有很高的表达。由于茎尖是生长旺盛的部位，PnD6有可能是影响三倍体速生的重要基因。这些结果可能暗示，DNA甲基转移酶基因可能参与了黑杨发育过程中叶片形态发生的过程。
- 陈成彬王彬胡宝全王春国宋文芹
- 关键词：黑杨多倍体DNA甲基转移酶
