国家自然科学基金(31071109)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
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- Predict Genomic Islands in Bacillus Cereus Genome by using Quadratic Divergence Segmentation Algorithm
- A genomic island(GI) is part of a bacterial genome that has evidence of horizontal origins.Although genes in m...
- Feng-Biao GuoLu-Wen Ning
- 新洋葱伯克霍尔德氏菌AU-1054菌株的三条染色体上必需基因的异常分布
- 绝大部分细菌基因组只包含一条染色体,极少数细菌包含两条甚至三条染色体。在(GenBank数据库中储存的已经完全测序的1000种细菌种,有11个基因组具有三条染色体。这11个菌株属于同一个属(伯霍尔德杆菌,Burkhold...
- 郭锋彪宁绿文黄健林昊张会雄
- 关键词：染色体转位必需基因
- 文献传递
- 强烈的复制链组成偏差——某些专性寄生(共生)菌特有的基因组学特征
- 2011年
- DNA复制是一个不对称的过程。不对称的一个体现是复制链分为前导链和滞后链,前者连续复制而后者的复制却不连续。这种不对称最终导致两条链上核酸组成的不对称。链特异的核酸组成偏差最先发现于棘皮类动物和脊椎动物的线粒体DNA上。随着全基因组的大量测序,越来越多的细菌被发现具有类似的链特异的核酸组成偏差,甚至很多真核生物的染色体基因组也被发现具有类似偏差。在某些细菌中,链特异的组成偏差强烈到足以使前导链和滞后链的基因间具有分离的密码子使用。至今,共有11种细菌被发现具有和复制相关的分离的密码子使用。这11种细菌无一例外都属于专性寄生(共生)菌。对于链组成偏差产生的内在机制以及特定细菌具有强烈链组成偏差的成因,目前学术界尚没有统一的理论解释。文章对这一遗传学及基因组学的重要问题进行了综述和展望。
- 郭锋彪
- 微生物必需基因的理论研究现状被引量：2
- 2012年
- 必需基因是生物体在优化条件下生长不可缺少的基因。近年来,对必需基因的研究已逐渐成为微生物学、基因组学和生物信息学研究领域的热点。文章首先描述了已经实验确定必需基因的微生物物种。然后,对必需基因的理论研究现状进行了综述。从进化保守性和序列组成两方面比较必需基因和非必需基因的差异,到必需基因的理论预测及必需基因在染色体上的分布等。最后,对这一重要研究领域的进展进行了总结和展望。
- 叶远浓郭锋彪
- 关键词：必需基因
