云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金(ZK11SB01)
- 作品数：1 被引量：18H指数：1
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- 全基因组预测希金斯炭疽菌与禾谷炭疽菌的分泌蛋白
- 希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)与禾谷炭疽菌[Colletotrichum graminicola(Cesati)Wilson]均是农业生产上重要的病原菌,给农业生产造成了...
- 韩长志
- 关键词：分泌蛋白信号肽亚细胞定位
- 文献传递
- 禾谷炭疽菌RGS蛋白生物信息学分析被引量：18
- 2014年
- 【目的】明确禾谷炭疽菌中存在的典型RGS,及其信号肽、跨膜区、二级结构特征,明确该菌RGS与其他病菌之间的关系,最终为深入开展RGS定位、功能研究打下坚实的理论基础,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导。【方法】基于酿酒酵母中已经报道的4个典型RGS序列,利用BLASTp以及关键词对禾谷炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,以及通过SMART保守结构域分析。同时,通过对禾谷炭疽菌中典型RGS氨基酸序列进行细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生物信息学分析,此外,通过对禾谷炭疽菌中的典型RGS与其他物种中的同源序列进行遗传关系比较分析。【结果】明确禾谷炭疽菌存在6个典型的RGS,上述RGS在蛋白质二级结构中均含有较高比例的α螺旋结构,而在信号肽方面,除CgRGS6含有明显的信号肽序列外,其他RGS则没有;6个RGS中3个定位在细胞核中,其他则定位在质膜、内质网、线粒体上。【结论】禾谷炭疽菌中的RGS与C.higginsianum、C.gloeosporioides Cg-14/Nara gc5、C.orbiculare等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列,以及较近的亲缘关系。
- 韩长志
- 关键词：信号肽炭疽菌属
