国家质检总局科技计划项目(2008IK242)
- 作品数：3 被引量：15H指数：3
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- 应用焦磷酸测序鉴定马铃薯感染的马铃薯Y病毒株系被引量：6
- 2013年
- 为了检验是否可以通过焦磷酸测序法进行短序列测序,来鉴别马铃薯Y病毒(PVY)株系,从NCBI库中选取了代表9个PVY株系的全基因组序列30个,通过比对P1和CP蛋白的氨基酸序列,分别找出一个差异区段,针对这2个区域设计了反转录引物、PCR引物和测序引物。分别从黑龙江省克山县和讷河市各采集了一份马铃薯病叶样品,通过提取总RNA,反转录,再进行PCR扩增获得扩增产物,并对扩增产物进行了焦磷酸测序。测序结果显示,尽管2份马铃薯病叶症状不同,但均感染了PVY(N-Wi株系)(PVYN-Wi)。上述研究表明,利用本试验设计的引物,通过焦磷酸测序法进行短序列测序,可以鉴定马铃薯感染的PVY株系。
- 刘洪义梁五生刘忠梅张洪祥杨立群
- 关键词：马铃薯马铃薯Y病毒焦磷酸测序
- 黑龙江省部分地区马铃薯Y病毒株系检测被引量：8
- 2014年
- 从黑龙江省克山、讷河、五大连池和北安大田种植的马铃薯上采集马铃薯病叶,提取总RNA,利用之前验证过的引物,进行反转录、PCR扩增,以及焦磷酸测序,以鉴定感染的马铃薯Y病毒(PVY)株系。结果表明,克山有2个样品分别感染PVYN:O和PVYN-Wi;讷河有2个样品感染PVYN-Wi;五大连池有2个样品分别感染PVYN:O和PVYN-Wi;北安有1个样品感染PVYN-Wi。结合之前报道的9份黑龙江省马铃薯病样的PVY株系鉴定结果,表明黑龙江省大田种植的马铃薯至少存在PVYN-Wi、PVYN:O、PVYNTN和PVYN4种PVY株系侵染;而且,由于PVYN-Wi侵染了16份已鉴定病样中的7份,而其余3种株系均仅侵染3份病样,显示PVYN-Wi可能为优势株系。
- 刘洪义梁五生刘忠梅张洪祥杨立群
- 关键词：马铃薯马铃薯Y病毒焦磷酸测序
- 马铃薯Y病毒株系分类及中国大田马铃薯感染的马铃薯Y病毒株系谱研究进展被引量：7
- 2015年
- 为了更科学、合理地检测、检疫马铃薯Y病毒(PVY)株系,和全面掌握侵染中国大田马铃薯的PVY株系情况,总结了PVY株系的分类方法,分析了中国大田马铃薯感染的PVY株系谱。认为目前广泛使用的血清型划分法、基因组重组与否划分法、PTNRD效应划分法、过敏反应互作基因划分法,以及Singh等提出的株系群划分法都无法对PVY株系予以完全合理的划分。提出有必要鉴定PVY基因组中决定马铃薯病理效应的基序并通过对基序测序来鉴定PVY株系,通过对株系间基因组差异区段的短序列测序来鉴定PVY株系是目前最接近基序测序分类法的思路。指出感染中国大田马铃薯的PVY目前有PVYO、PVYN、PVYNTN、PVYN:O、PVYN-Wi和PVYNW这6种株系,隶属于2个株系群PVYO和PVYN,其中PVYN株系和PVYN株系群病样占绝大多数,以非重组株系为主,但重组株系已占一定比例,其发展趋势值得关注。
- 梁五生温雪玮刘洪义刘忠梅
- 关键词：马铃薯Y病毒马铃薯
