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江苏省农业科学院科研基金(6110530)
作品数:
2
被引量:13
H指数:2
相关作者:
汤日圣
张大栋
马鸿翔
吉晓佳
杨永华
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相关机构:
江苏省农业科学院
江苏沿海地区农业科学研究所
南京大学
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发文基金:
江苏省农业科学院科研基金
江苏省自然科学基金
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相关领域:
生物学
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文献类型
2篇
中文期刊文章
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2篇
生物学
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海蓬子
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盐胁迫
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抑制消减杂交
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杂交
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生物信息学
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生物信息学分...
1篇
片段
1篇
消减杂交
1篇
胁迫
1篇
基因
1篇
基因片段
1篇
RNA分离
1篇
CDNA文库
机构
2篇
江苏省农业科...
1篇
南京大学
1篇
江苏沿海地区...
作者
2篇
马鸿翔
2篇
张大栋
2篇
汤日圣
1篇
周春霖
1篇
任丽娟
1篇
王茂文
1篇
杨永华
1篇
吉晓佳
传媒
2篇
江苏农业学报
年份
2篇
2006
共
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海蓬子盐胁迫初期抑制消减杂交cDNA文库的构建
被引量:9
2006年
为提高缩叶肉质盐生植物海蓬子总RNA和mRNA的质量,将改良CTAB法与Tripure试剂盒方法相结合,从300mg海蓬子发芽后20d的幼苗中成功分离和纯化了高纯度的总RNA和mRNA。并以无NaCl处理为Driver,以200mmol/LNaCl处理24h、48h、72h的幼苗为Tester,通过cDNA双链的合成及两次PCR扩增,富集到两组处理中差异表达的大小在200~1300bp的cDNA序列,pGEM-T的连接和蓝白斑筛选表明杂交文库滴度和重组率分别达到2,6×10^7和96%,共收集阳性克隆12000个,形成了抑制消减杂交的质粒cDNA文库。随机挑取酶切质粒的电泳分析表明,载体中均有插入片段。两种RNA提取方法的结合有效提高了多汁多色素海蓬子RNA的质量,高效抑制消减杂交文库的建立为进一步分析基因的差异表达及分离抗盐基因奠定了基础。
张大栋
马鸿翔
吉晓佳
周春霖
王茂文
汤日圣
杨永华
关键词:
CDNA文库
RNA分离
海蓬子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析
被引量:5
2006年
从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609 bp的DNA序列,编码1个202 aa的开放阅读框,Northern B loting显示该基因在检测子(200 mmol/L NaC l)中的表达显著增强。生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟南芥和水稻的同源性分别为6 e-68和1 e-58;在核酸水平上,该片段与拟南芥的同源性为3 e-24。保守区分析显示,该片段含有DnaJ-like基因完整的J功能域(J-Dom ain,66 aa),功能域在蛋白质水平与GenBank两种相关类型的J功能域的同源性分别为1 e-11和9 e-15。这为该基因的克隆及研究其在植物逆境胁迫中的作用奠定了基础。
张大栋
周春霖
任丽娟
王茂文
汤日圣
马鸿翔
关键词:
生物信息学分析
海蓬子
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