国家自然科学基金(81260100)
- 作品数：4 被引量：2H指数：1
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- 基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析
- 2014年
- 蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视。研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR(Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较。结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观。
- 刘平马玉韬孙学宏张成杜勇
- MTHFR、HCY与BDNF在大鼠胚胎神经管畸形发生中的作用被引量：1
- 2017年
- 目的研究叶酸-同型半胱氨酸代谢途径中关键酶亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)、同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)与脑源性神经营养因子(brain derived neurotrophic factor,BDNF)在大鼠神经管畸形发生中的作用。方法将30只成年雌性SD大鼠随机分为正常对照组(正常组)、神经管畸形组(畸形组)、叶酸干预组(叶酸组),每组各10只。于孕鼠妊娠第15.5天时,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定孕鼠血浆HCY浓度;取大鼠胚胎,免疫组织化学染色分析胚胎神经管组织MTHFR、BDNF表达量、TUNEL染色(过氧化物酶标记测定法)分析胚胎神经管组织细胞凋亡率。结果与正常组相比,畸形组孕鼠血浆HCY浓度升高(P<0.05),胚胎神经管组织中MTHFR、BDNF因子的免疫组织化学染色平均光密度(MOD)值下降(P<0.05),TUNEL染色显示胚胎神经管组织中细胞凋亡率升高(P<0.05),叶酸组孕鼠血浆HCY浓度无明显变化(P>0.05),胚胎神经管组织中MTHFR、BDNF的免疫组化染色MOD值下降(P<0.05),TUNEL染色显示胚胎神经管组织神经细胞凋亡率无明显变化(P>0.05)。与畸形组比,叶酸组孕鼠血浆Hcy浓度降低(P<0.05),胚胎神经管组织中MTHFR、BDNF因子的MOD值升高(P<0.05),TUNEL染色显示神经细胞凋亡率降低(P<0.05)。结论胚胎神经管组织发育中MTHFR表达降低致HCY蓄积,引起BDNF表达下调,细胞凋亡增加,从而导致神经管关闭受阻;叶酸补充后较好地逆转这一过程,从而预防大部分神经管畸形的发生。
- 董磊杜勇邓晓征邢欣然周瑜
- 关键词：神经管畸形叶酸亚甲基四氢叶酸还原酶
- 胎鼠脊髓神经干细胞分离培养及诱导分化
- 2014年
- 目的探讨机械分离法与酶消化法在脊髓源性神经干细胞(NSCs)体外培养的优劣,并观察脊髓源性NSCs体外培养时增殖和分化的特点。方法取妊娠第15天(E15 d)的胎鼠神经管组织,分别采用酶消化法和机械吹打分离法离散细胞,进行无血清培养,并以上述两种方法传代培养。借助免疫细胞化学法对NSCs及分化结果进行鉴定,细胞球计数法检测成球率,测量神经球直径分析细胞增殖能力,MTT法监测细胞生长情况。结果①培养的细胞具有增殖成球生长的特性并且抗巢蛋白免疫荧光阳性、血清可诱导分化出胶质细胞酸性蛋白(GFAP)、神经元特异性希醇化酶(NSE)阳性表达的细胞。②细胞直径:酶消化组(137.74±11.62)μm,机械分离组(143.69±12.20)μm(P>0.05)。③生长曲线结果显示酶消化组NSCs综合生长增殖能力较高,OD值:酶消化组(0.39±0.15),机械分离组为(0.36±0.13)。结论胎鼠脊髓组织中存在具有自我增殖和多分化潜能的NSCs,原代无血清成球培养时采用酶消化法更有利于获得较多NSCs。
- 赵明佐杜勇刘海阳周长城强晓鑫简鹏
- 关键词：神经干细胞无血清培养诱导分化
- 神经管畸形胎鼠中神经干细胞增殖分化及H3K27me3表达的变化被引量：1
- 2016年
- 目的建立全反式维甲酸(all-trans retinoic acid,ATRA)诱导神经管畸形(neural tube defects,NTDs)鼠神经干细胞无血清培养法,了解神经管发育过程中神经干细胞的变化规律及叶酸的干预作用,并观察H3K27me3在NTDs中表达的变化。方法分别取妊娠第15.5天的正常、实验及叶酸干预后的胎鼠神经管分离培养神经干细胞,采用免疫细胞化学鉴定;用神经球计数、直径测量及MTT法检测各组神经干细胞生长情况,免疫细胞化学法分析各组细胞分化情况,Western blot法测定H3K27me3在各组细胞中的表达情况。结果正常组、实验组和叶酸干预组,200倍镜下取5个视野计数神经球数,其平均值分别为(29.4±2.07)、(17.8±2.17)和(23.4±1.52)个,3组间差异有统计学意义(P<0.05);正常组、实验组和叶酸干预组神经干细胞直径的平均值分别为(140.2±4.82)、(106.6±3.85)和(121.8±4.09)μm,3组间差异有统计学意义(P<0.05);正常组、实验组和叶酸干预组神经干细胞诱导分化后Nestin表达量分别为(6±0.9)%、(32±3)%、(21±4)%(P<0.05);实验组中H3K27me3明显高表达。结论 ATRA致NTDs的发生与神经干细胞的数目减少、增殖分化抑制及H3K27me3的高表达密切相关。
- 鲁峰刚杜勇周长城翟思凡
- 关键词：神经管畸形神经干细胞叶酸干预细胞分化
