国家高技术研究发展计划(2006AA02401)
- 作品数：6 被引量：63H指数：4
- 相关作者：周清华刘红雨滑峰万海粟王竞更多>>
- 相关机构：天津医科大学总医院青岛大学医学院附属医院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划天津市科技支撑计划“十一五”国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 高低转移大细胞肺癌细胞株L9981和NL9980间甲基化差异基因的初步研究
- 2010年
- 背景与目的肺癌是人类肿瘤中最容易发生侵袭转移的恶性肿瘤之一。影响肺癌患者预后及生存的最主要因素是远处转移。本文旨在分析具有相似遗传背景和不同转移潜能的人大细胞肺癌细胞株间基因甲基化的差异,为深入研究肿瘤转移机制提供充分的目标基因选择和发现肿瘤相关的新基因的机会。方法应用全基因组甲基化芯片杂交技术分析具有相同遗传背景和不同转移潜能的人大细胞肺癌细胞株L9981和NL9980之间差异甲基化基因,并运用生物信息学的方法分析这些差异基因。结果与NL9980相比,在L9981细胞株中有1552个高甲基化DNA片断共涉及735个基因,其中656个已知基因及79个未知基因。低甲基化DNA片段1787个,涉及809个基因,其中698个已知基因及111个未知基因。这些基因涉及细胞生物进程及其调节、基因表达、信号传导、细胞通讯、细胞运动、细胞粘附及血管生成等。结论抑癌基因及信号通路负向调节基因的高甲基化及癌基因、细胞粘附因子的低甲基化可能与L9981的侵袭性及克隆能力强有关。
- 吕慧闫惠琴王岷李永文万海粟刘红雨吴蘅周清华
- 关键词：DNA甲基化肺肿瘤
- 187例非小细胞肺癌中EGFR基因突变和扩增的检测及其临床意义被引量：39
- 2009年
- 背景与目的现有的研究表明表皮生长因子受体(EGFR)相关信号通路在肺癌的发生和发展中起重要作用。EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)是目前针对EGFR治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的重要分子靶向药物。EGFR的不同存在状态(基因突变和基因扩增)与TKIs的疗效相关。本研究旨在探讨非小细胞肺癌患者中EGFR的存在状态及其临床意义,从而为肺癌病人"个体化分子治疗"提供依据。方法研究对象为187例NSCLC病例。用Real-timePCR技术检测EGFR基因19、21外显子的突变状态;用荧光原位杂交(FISH)技术检测EGFR基因的扩增情况,并进一步分析EGFR基因的突变和扩增与患者临床病理生理特征的关系。结果FISH结果显示,47.6%(98/187)的肺癌患者存在EGFR基因的扩增,而EGFR基因的扩增与患者的年龄、性别、组织学类型、吸烟状态及是否存在转移无关(P>0.05);Real-timePCR结果显示:20.3%(38/187)的肺癌患者存在EGFR外显子19、21的突变。EGFR基因突变率在女性(32.3%vs14.4%男性)、腺癌(35.5%vs9.9%非腺癌)、不吸烟(38.2%vs10.1%吸烟)患者中明显高(P<0.05)。EGFR基因扩增与基因突变之间具有一定的相关性,在早期肺癌、腺癌及非吸烟的女性患者中,EGFR基因外显子突变常同时伴有EGFR基因的扩增。有EGFR基因突变或/和基因扩增的患者生存期均高于无EGFR基因异常者,但是没有统计学差异(P>0.05)。有EGFR基因突变的患者易对TKIs治疗有效。结论EGFR基因突变率在不同的NSCLC患者中不同,其中,在女性、腺癌和不吸烟患者中突变率高;EGFR基因扩增与患者的性别、组织类型、吸烟状态等临床特征无明显关系,与患者预后的相关性有待进一步研究。
- 刘红雨李颖陈钢王竞李永文王玉丽韦森朱大兴邱小明王伟强宋作庆陈军周清华
- 关键词：肺肿瘤表皮生长因子受体基因突变基因扩增
- 诱导痰、胸水和纤维支气管镜活组织端粒酶活性的联合检测对肺癌的诊断价值被引量：8
- 2010年
- 背景与目的已有的研究表明,端粒酶的异常活化与肺癌的发生、发展及转归密切相关,端粒酶是目前已知广谱的肿瘤分子标记物,是诊断和治疗肺癌的重要分子标志物之一。本研究旨在探讨诱导痰、胸水和纤维支气管镜活检组织中端粒酶活性的联合检测对肺癌的诊断价值。方法对80例肺癌伴胸水患者和50例肺部良性病变伴胸水患者,应用TRAP-PCR-ELISA方法分别检测其诱导痰、胸水和纤维支气管镜活检组织中端粒酶的活性。结果肺癌伴胸水患者诱导痰、胸水和纤维支气管镜活组织中端粒酶的活性均明显高于肺部良性病变伴胸水患者(P<0.001),不同病理类型的肺癌患者间三种标本的端粒酶活性差异无统计学意义(P>0.05)。诱导痰、胸水和纤维支气管镜活组织中端粒酶活性的检测对肺癌的诊断敏感性分别为62.5%(50/80)、46.3%(37/80)和60.0%(48/80);特异性分别为72.0%(36/50)、66.0%(33/50)和70.0%(35/50);准确性分别为66.2%(86/130)、53.8%(70/130)和63.8%(83/130);三项联合检测的敏感性、特异性和准确性分别为85.0%(68/80)、78.0%(39/50)和82.3%(107/130),其中敏感性与单独诱导痰、胸水和纤维支气管镜活组织的敏感性差异有统计学意义(P<0.01)。结论诱导痰、胸水和纤维支气管镜活组织端粒酶活性的联合检测具有更高的敏感性,可以提高肺癌的诊断率。
- 李红梅滑峰赵诚刘光振周清华
- 关键词：端粒酶
- 新一代基因测序技术及其在肿瘤研究中的应用被引量：10
- 2010年
- 基因测序技术的进步,为分子生物学的发展,起到了巨大的推动作用。传统的基因测序技术的重要代表,是所谓的Sanger测序法,这是一种以末端终止法为原理建立起来的技术[1]。20世纪90年代开始启动的人类基因组计划,
- 陈琛万海粟周清华
- 关键词：基因测序技术人类基因组计划肿瘤分子生物学测序法
- 同源序列对CYP2A13基因SNP研究的影响被引量：1
- 2010年
- 背景与目的已有研究表明:细胞色素P450酶2A13(cytochrome P4502A13,CYP2A13)在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与疾病关联中起重要作用。细胞色素P450酶是一组同工酶,基因序列间有高度的同源性,可能对SNP分析产生影响。本研究初步探讨同源序列对CYP2A13基因SNP研究的影响。方法应用Taqman探针检测573例人群rs8192789位点的分布,采用BLAST方法分析引物结合序列。对60例样本的CYP2A13序列进行测序,进一步进行了TA克隆测序,应用BLAST方法分析了克隆测序结果。结果rs8192789位点在573例人群中只有3例为TT纯合型,其余均为CT杂合型,BLAST分析为同源序列导致。60例人群CYP2A13部分序列测序结果完全一致,有大量套峰,101氨基酸位点处没有dbSNP数据库中报道的SNP位点。克隆测序为247bp、235bp两个片段。结论CYP2A13的同源序列对SNP研究造成了干扰,部分SNP位点可能是不存在的。
- 滑峰万海粟梅朝蓉郑德杰孙琳琳陈军刘红雨周清华
- 关键词：单核苷酸多态性同源序列
- 髓过氧化物酶基因G-463A多态性与肺癌易感性关系的meta分析被引量：5
- 2010年
- 背景与目的关于髓过氧化物酶基因G-463A多态性与肺癌易感性关系已有广泛研究,但研究结果不一致。本研究利用meta分析的方法探讨髓过氧化物酶基因G-463A多态性与肺癌易感性的相关性。方法全面检索公开发表的关于髓过氧化物酶基因G-463A多态性与肺癌易感性关系的研究,把研究人群分为高加索人群和东亚人群,以病例组与对照组比值比(odds ratio,OR)为效应指标,应用meta分析软件RevMan4.2分别计算两种人群的合并OR值及95%CI,同时给出meta分析森林图和倒漏斗图。结果纳入文献研究20篇,其中高加索人群研究纳入病例5381例,对照5827例;东亚人群研究纳入病例1558例,对照1755例。计算高加索人群及东亚人群髓过氧化物酶基因-463位点AA+AG/GG合并OR值,分别为0.91(95%CI:0.81-1.02)、0.83(95%CI:0.63-1.09),高加索人群有发表偏倚,东亚人群没有发表偏倚。结论髓过氧化物酶基因G-463A多态性与肺癌易感性在高加索人群及东亚人群均不具有明显相关性,东亚人群研究样本量少,有待进一步研究。
- 滑峰王竞谷俊东李书军刘红雨周清华
- 关键词：肺肿瘤髓过氧化物酶多态性META分析
