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国家自然科学基金(30900925)

作品数：1 被引量：1H指数：1
相关作者：李午佼颜瑾王运生更多>>
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文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇线虫
  • 1篇根结线虫
  • 1篇分泌
  • 1篇分泌蛋白
  • 1篇北方根结线虫

机构

  • 1篇湖南农业大学

作者

  • 1篇王运生
  • 1篇颜瑾
  • 1篇李午佼

传媒

  • 1篇湖南农业大学...

年份

  • 1篇2011
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
南方和北方根结线虫分泌蛋白组预测与比较分析被引量：1
2011年
通过SignalP 3.0、TargetP 1.1、KohGPI、TMHMM 2.0等系列软件对南方和北方根结线虫分泌蛋白组进行预测。结果表明,南方和北方根结线虫预测分泌蛋白数为2 622和1 696个,分别占总基因数的13.65%和12.95%。经BlastP(E<1e-10)分析,分别有754个和466个能在KOG(eukaryotic orthologous groups)库中找到相似蛋白,其功能主要包括能量代谢与转运、信号传导、转录活性调控等。基因本体(GO)分析结果表明,南方和北方根结线虫的预测分泌蛋白数目在核定位信号和转录活性调控上存在显著差异。用MEME/MAST搜索并分析根结线虫分泌信号肽保守的模体(Motif),得到54个南、北方根结线虫分泌信号肽共有的模体。
李午佼颜瑾王运生
关键词：根结线虫分泌蛋白
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