福建省科技重点项目(2011Y0040)
- 作品数：4 被引量：3H指数：1
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- 发文基金：福建省科技重点项目福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 加权贝叶斯线性B细胞表位特征提取方法
- 2015年
- 特征提取方法对线性B细胞表位预测起到非常重要的作用,但贝叶斯特征提取方法忽略了氨基酸之间的相互关系.为了更准确地描述表位序列的关系,提出一种基于氨基酸对量表加权的贝叶斯特征提取方法,该方法对单个氨基酸在序列分布的基础上充分考虑了氨基酸之间的关系,并使用支持向量机作为分类器进行分类.在El-Manzalawy,Saha数据集上的测试表明改进的贝叶斯特征提取方法.相比传统的贝叶斯特征提取方法,提取精度有一定的提升.
- 刘威郭红
- 关键词：贝叶斯支持向量机
- 基于Haar特征和级联结构的CISH细胞检出
- 2012年
- 目的提出一种基于Haar特征和Gentle Adaboost级联结构的CISH细胞自动检出方法。方法根据乳腺癌CISH图像染色导致的细胞边缘模糊,不利于细胞的检出的问题。首先,对待检测图像进行光照补偿,减小光照对细胞检测造成的影响;然后,利用针对CISH细胞的Haar特征训练的级联强分类器快速检测细胞位置;最后,利用CISH细胞的结构特征对图像进行后处理,定位细胞的具体轮廓。结果实现乳腺癌CISH细胞的检出。结论实验结果表明,该算法检测速度快,并且具有较低误检率和漏检率,能够较好的应用于CISH细胞的快速检出。
- 王晖刘秉瀚
- 关键词：细胞检测HAAR特征级联结构
- 基于随机游走的FISH细胞检出及HER2状态判别
- 2013年
- 目的针对肿瘤FISH图像细胞边缘模糊和粘连等问题,提出一种基于自动随机游走的细胞检出及HER2基因状态判别方法。方法首先,在RGB颜色空间中的分割细胞、信号点等区域;然后,改进极限腐蚀算法,自动获取细胞种子区域,并提取有效种子点进行自动随机游走分割,较好地实现了FISH细胞的检出;最后,依据细胞内红绿信号点数比值对HER2基因状态作出判别。结论实验结果表明,本文方法细胞检出效果理想,能较好地实现粘连、重叠细胞的分离,FISHHER2基因状态判别敏感度、特异性、准确率均达到90%以上。
- 刘秉瀚李月娇王伟智
- 关键词：随机游走
- 基于混合核函数SVM的蛋白质相互作用预测方法被引量：3
- 2014年
- 针对蛋白质相互作用的预测问题,提出一种以余弦核和线性差值累加核为基核的对偶混合核函数SVM的蛋白质相互作用预测方法.该方法充分考虑了蛋白质的结构域特征,同时根据蛋白质相互作用数据应具有顺序无关的特点,将"对偶"思想引入SVM核函数中.对两个真实的蛋白质相互作用数据集Yeast PPI和Human PPI的测试结果表明,提出的方法与其它方法相比能够有效地提高蛋白质相互作用预测的准确率.
- 蔡丹莉郭红
- 关键词：蛋白质相互作用结构域混合核函数
