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国家自然科学基金(30370013)

作品数:10 被引量:52H指数:5
相关作者:高培基张怀强刘波王禄山武彬更多>>
相关机构:山东大学山东省农业科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:生物学自然科学总论医药卫生化学工程更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 6篇生物学
  • 2篇自然科学总论
  • 1篇化学工程
  • 1篇医药卫生

主题

  • 2篇延迟期
  • 2篇细菌
  • 2篇GROWTH
  • 1篇动态过程
  • 1篇短肽
  • 1篇对硝基苯
  • 1篇真菌
  • 1篇制浆
  • 1篇生长速率
  • 1篇生物制浆
  • 1篇天然纤维
  • 1篇天然纤维材料
  • 1篇热稳定
  • 1篇热稳定性
  • 1篇外切纤维素酶
  • 1篇微生物群体
  • 1篇吸附法
  • 1篇细菌群体
  • 1篇纤维
  • 1篇纤维材料

机构

  • 7篇山东大学
  • 1篇山东省农业科...

作者

  • 7篇高培基
  • 3篇张怀强
  • 2篇武彬
  • 2篇王禄山
  • 2篇刘波
  • 1篇刘淑艳
  • 1篇张颍舒
  • 1篇金建玲
  • 1篇卢雪梅
  • 1篇卢丽丽
  • 1篇张为灿
  • 1篇刘玉庆
  • 1篇阎雪岚
  • 1篇段新源
  • 1篇刘洁
  • 1篇赵越
  • 1篇杨炜华

传媒

  • 3篇中国科学(C...
  • 2篇Scienc...
  • 1篇应用与环境生...
  • 1篇科学通报
  • 1篇自然科学进展
  • 1篇纤维素科学与...

年份

  • 1篇2008
  • 2篇2007
  • 1篇2006
  • 3篇2005
  • 2篇2004
10 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
细菌群体异质性对生长动态过程的影响及其表征被引量:14
2007年
在经典的表征群体生长的Logistic方程中,假定群体中每个个体都是同质的.解方程时的初值仅限定为N(to)=No,因此,对N0相同而生理状态不同的接种物的生长动态不能区分.事实上,在菌群生长的任一时刻,只有一定比例的细胞在进行分裂(设为θ),这样,dN/dt不仅由N,而且实际上由N和θ共同决定.因此,解方程的初值条件还应加入θ(to)=θo,而这又被在构建生长方程时所忽略,但这一附加条件使Logistic方程的求解甚为复杂.基于细菌生长过程的瞬时生长速率Vinst的时间过程曲线都呈Gauss分布形状这一特点,在用瞬时生长速率成功地表征限制性条件下区分群体生长阶段的基础上,进一步用Gauss分布近似函数表达式{Yi=ae[-0.5(xi-x0)/b)^2])以求得异质性群体的生长参数,这些参数可真实地表征不同生理状态细菌群体的生长动态,为微生物学基础研究和在生物工程等方面的应用提供了一个新方法.在此基础上提出了一个估算细菌群体生长延迟期和群体倍增时间的新方法.
张怀强卢丽丽阎雪岚高培基
关键词:LOGISTIC方程延迟期
A novel approach for estimating growth phases and parameters of bacterial population in batch culture被引量:4
2006年
Using mathematical analysis, a new method has been developed for studying the growth kinetics of bacterial populations in batch culture. First, sampling data were smoothed with the spline interpolation method. Second, the instantaneous rates were derived by numerical differential tech-niques and finally, the derived data were fitted with the Gaussian function to obtain growth parameters. We named this the Spline-Numerical-Gaussian or SNG method. This method yielded more accurate estimates of the growth rates of bacterial populations and new parameters. It was possible to divide the growth curve into four different but continuous phases based on changes in the instantaneous rates. The four phases are the accelerating growth phase, the constant growth phase, the decelerat-ing growth phase and the declining phase. Total DNA content was measured by flow cytometry and varied depending on the growth phase. The SNG system provides a very powerful tool for describing the kinetics of bacterial population growth. The SNG method avoids the unrealistic assumptions generally used in the traditional growth equations.
ZHANG Huaiqiang LIU Yuqing LIU Bo GAO Peiji
关键词:NUMERICALDIFFERENTIALGROWTHGROWTHBACTERIAL
对硝基苯纤维二糖苷(PNPC)结合于外切纤维素酶Ⅰ(CBHI)时分子构型和构象变化的研究被引量:3
2008年
以固定浓度的外切纤维素酶Ⅰ(1,4-β-D-glucan cellobiohydrolaseⅠ,CBHI),对不同浓度的对硝基苯纤维二糖苷(p-nitrophenol-D-cellobioside,PNPC)在4℃下进行结合.以紫外线光谱、荧光光谱的变化和等温滴定量热法(isothermal titration calorimitry,ITC)分别确定酶的饱和结合位点数(saturation binding point,SBP).然后,对在4℃和SBP条件下,结合时形成的"PNPC-CBHI"复合物进行PNPC分子构型变化和CBHI分子构象变化的分析.结果表明,在水解反应不能进行的条件下,CBHI结合PNPC的反应是一个由负焓变(??H)控制的不可逆的放热过程.结合可导致PNPC的构型转变为PNP(对硝基苯)分子构型,而CBHI的构象变化可循环发生."PNPC-CBHI"复合物与CBHI和PNPC之间不存在可逆性的平衡过程,在酶分子不断循环进行的结合/解离过程中,由CBHI构象变化提供的能量,使PNPC分子不断转化为PNP分子构型,结合复合物解离出PNP与纤维二糖后,再生的CBHI才可与PNPC结合.并对这一结果应用于解释酶催化机理的普适性进行了讨论.
武彬王禄山高培基
应用美兰吸附法测定纤维素表面积的讨论被引量:5
2004年
以Prism4.0软件包将不同纤维材料吸附美兰的数据拟合Scatchard方程、Klotz-Hunston方程、Langmuir方程的一般形式和单点双曲线吸附方程,据此研究了由美兰等染料分子在纤维基质表面上的吸附从而推算基质的表面积的方法机理和局限性。分析表明Langmuir模型和单点双曲线模型的拟合得到的饱和吸附量为外推值,会导致测量结果失真;而用Sigmoidal dose-response(Variable slope)模型拟合时,则能给出真实吸附量。研究结果还显示,由纤维素分子链自由羟基所介导的美兰吸附不会发挥主导作用,而红外ATR结果和美兰的脱吸附试验表明美兰在纤维素表面上的吸附应为物理吸附,所以根据美兰分子平卧于纤维表面面积162 ?,计算纤维表面积,得到了四种纤维材料的比表面积。但由于真实界面浓度的确定方法仍存在矛盾,也缺少一个直观的检测标准,因此文章中给出的数值仍为一相对的比较值。
武彬王禄山张为灿赵越高培基
关键词:附方纤维素ATR表面积分子链
中温纤维分解真菌尖镰孢Fusarium oxysporum中一种新的耐热内切葡聚糖酶被引量:2
2005年
FusariumoxysporumL19是一株典型的中温真菌,从其培养液中分离到一种新的耐热内切葡聚糖酶(EGt).用传统的酶动力学方法,以CMC-Na为底物,30min的反应时间确定其最适反应温度为75℃;热稳定性指数衰减拟合曲线显示70℃半衰期为15.1min;该酶不作用于对硝基苯纤维二糖苷(pNPC).EGt对大多数金属离子及化学试剂不敏感,N-溴代琥珀酰亚胺(NBS)的蛋白质侧链修饰表明,Trp处于其活性中心.N-末端氨基酸序列为SYRVPAANGFPNPDASQEKQ,基因测序以及广范的序列比对分析显示,EGt与已知的内切葡聚糖酶没有同源性.这是首次从中温真菌Fusariumoxysporum中分离到耐热纤维素酶,多种同工酶的表达可能有助于其适应复杂的生存环境.
刘淑艳段新源卢雪梅高培基
关键词:FUSARIUMOXYSPORUM热稳定性生物制浆
Effect of the population heterogeneity on growth behavior and its estimation被引量:4
2007年
Different types of the Logistic model are constructed based on a simple assumption that the microbial populations are all composed of homogeneous members and consequently, the condition of design for the initial value of these models has to be rather limited in the case of N(t_0)=N_0. Therefore, these models cannot distinguish the dynamic behavior of the populations possessing the same N0 from heteroge-neous phases. In fact, only a certain ratio of the cells in a population is dividing at any moment during growth progress, termed as θ, and thus, ddNt not only depends on N, but also on θ. So θ is a necessary element for the condition design of the initial value. Unfortunately, this idea has long been neglected in widely used growth models. However, combining together the two factors (N0 and θ ) into the initial value often leads to the complexity in the mathematical solution. This difficulty can be overcome by using instantaneous rates (Vinst) to express growth progress. Previous studies in our laboratory sug-gested that the Vinst curve of the bacterial populations all showed a Guassian function shape and thus, the different growth phases can be reasonably distinguished. In the present study, the Gaussian dis-tribution function was transformed approximately into an analytical form (0.5x ibxYi αe=20) that can be conveniently used to evaluate the growth parameters and in this way the intrinsic growth behavior of a bacterial species growing in heterogeneous phases can be estimated. In addition, a new method has been proposed, in this case, the lag period and the double time for a bacterial population can also be reasonably evaluated. This approach proposed could thus be expected to reveal important insight of bacterial population growth. Some aspects in modeling population growth are also discussed.
ZHANG HuaiQiang, LU LiLi, YAN XueLan & GAO PeiJi State Key Laboratory of Microbial Technology, Shandong University, Jinan 250100, China
关键词:LOGISTICGROWTHRATEGROWTHLAGPHASEDOUBLE
真菌产生的短肽对天然纤维材料的降解作用被引量:7
2004年
实验表明真菌产生的低分子量短肽对纯纤维素材料能起氧化降解作用 .文中证实此类短肽对天然纤维材料也具有同样的降解作用 .还观察到分属于白腐菌、褐腐菌和软腐菌等 3大类 34种共 5 7株纤维分解真菌的胞外培养液都能够产生分子量低于 5 0 0 0且能形成羟基自由基的短肽 .扫描电子显微镜和红外光谱检测表明 ,来自拟康氏木霉的短肽能破坏棉纤维氢键网络 ,解聚、分离出单根微纤维 .它们和纤维素酶协同作用时可明显提高对秸秆、木材等天然纤维材料还原糖的产率 .微热量法研究表明该类短肽对纤维素的作用是吸热反应 .研究工作表明微生物对纤维素的降解是一受热力学控制的动力学过程 ,仅用糖苷键的水解作用不能全面阐明其降解作用机理 .
杨炜华刘洁张颍舒高培基
关键词:短肽真菌降解作用天然纤维纤维素材料
构建限制性条件下微生物群体生长模型时的问题被引量:11
2005年
Logistic生长模型在表征营养限制性生长条件下微生物群体生长时,遇到了种种困难.该模型未能明确给出微生物群体生长的“延迟期”和“代时”两个重要生长动力学参数,也忽视了方程中参数“r”应为平均生长速率,且不具有内禀生长率性质等诸多生物学特点.采用E.coliATCC31343,37℃液体摇瓶培养下获得的实验数据,证实了Logistic模型存在的上述局限性.通过对E.coli以葡萄糖和山梨醇共作碳源时,表现出的“二峰生长”曲线与用Logistic方程拟合结果的比较,表明适合度分析(goodness-fittest)不能作为模型是否适合的唯一判据.并对构建微生物群体生长模型的策略进行了讨论.
张怀强金建玲刘波高培基
关键词:延迟期
分批培养条件下细菌群体生长阶段的区分及生长参数的确定被引量:10
2005年
用样条插值法光滑实测数据后,再用数值微分法对分批培养条件下细菌群体生长过程进行分析,由此提出了区分群体生长阶段的新方法:依据瞬时生长速度和瞬时生长加速度规律性的变化,把细菌群体生长过程区分为加速生长期、恒速生长期、减速生长期和衰亡期四个阶段.进一步应用Gaussian函数方程进行拟合,得到新的生长参数.测定了群体生长过程中DNA含量,对其倍性变化的特点进行了讨论.将新的表征群体生长的建模方法(Spline-Numerical-Gaussian,SNG)与依据Logistic方程划分生长阶段的传统方法作了比较,并对SNG方法的生物学内涵作了进一步讨论.
张怀强刘玉庆刘波高培基
关键词:细菌群体
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