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利用单线虫多重PCR技术快速制备DNA分子量标准被引量：1: 2012年; 基于单只线虫6对染色体及多重PCR技术建立一种特异性扩增特定长度核酸片段的方法,进而探索其在常规核酸分子量标准制备中的应用。利用多重PCR引物设计及特异性评估软件以秀丽线虫6对染色体为模板,分别设计扩增不同长度核酸片段的特异性引物对,并直接对单只秀丽线虫进行多重PCR扩增,采用20g/L琼脂糖凝胶电泳进行分离鉴定并采集图像,通过系统研究优化获得特异性高的1～6重PCR扩增产物,产物大小经鉴定与预期目的条带一致,6重PCR扩增产物条带与常规分子量标准DL 2 000相应条带完全吻合,说明采用该方法能够有效制备特定片段大小的分子量标准。; 韩荣荣吴永红屈武斌刘虎岐张成岗; 关键词：多重PCR 秀丽线虫染色体DNA

扩容性血液稀释对缺血再灌注大鼠脑损伤的保护作用: 2011年; 【目的】探讨扩容性血液稀释对缺血再灌注大鼠脑损伤的影响。【方法】以健康成年雄性SD大鼠为试验动物,制备缺血再灌注脑损伤模型。于脑缺血2 h后,以生理盐水为血液稀释剂,在再灌注时通过尾静脉注射生理盐水对模型大鼠进行扩容性血液稀释,生理盐水注射剂量分别为0.5,1.0,2.0 mL/只,于再灌注6,9,12,24 h时取大鼠脑样本,制备切片,用2,3,5-三苯基四氮唑(TTC)染色,然后以图像分析方法计算TTC染色面积和脑梗死体积。【结果】生理盐水血液稀释对缺血再灌注大鼠脑损伤具有保护作用,随着生理盐水注射剂量的增加,SD大鼠脑梗死体积呈降低的趋势,注射2.0 mL生理盐水组脑梗死体积显著低于对照组。【结论】扩容性血液稀释能显著降低大鼠缺血再灌注模型脑梗死面积,对大鼠脑缺血再灌注损伤具有一定的保护作用。; 朱瑞萌刘虎岐张成岗; 关键词：血液稀释脑缺血再灌注脑梗死

多重PCR在质粒拷贝数检测中的应用被引量：4: 2011年; 聚合酶链式反应(PCR)作为常规分子克隆技术已在分子生物学的各个领域得到广泛应用。然而,多重PCR技术应用于质粒拷贝数检测的研究尚未见报道。为深入探索多重PCR在质粒拷贝数测定中的应用,首先利用构建的多重PCR引物设计及评估体系分别针对细菌基因组DNA和质粒载体DNA序列设计多重PCR引物;然后以转化有不同质粒载体的大肠杆菌菌液为模板进行多重PCR反应;最后利用凝胶成像仪采集图像后进行积分光密度分析以获得质粒的相对拷贝数。结果显示通过多重PCR得到的质粒相对拷贝数与Real-time PCR和Southern blot的检测结果基本一致,说明多重PCR可用于质粒拷贝数的定性检测。利用多重PCR技术建立了一种便捷的质粒拷贝数检测方法,为在宿主细胞中快速确定克隆载体或表达载体的相对含量提供了参考。; 李媛任长虹吴永红叶巧石锦平屈武斌郑晓飞刘虎岐张成岗; 关键词：质粒拷贝数多重PCR 菌液实时定量PCR SOUTHERN BLOT

不均一性核糖核蛋白(hnRNP)在中枢神经系统中的作用被引量：3: 2010年; 不均一性核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNP)是一类可参与mRNA前体剪接、mRNA转运和降解等多种功能的RNA结合蛋白。目前发现hnRNP家族蛋白也参与了神经细胞、神经胶质细胞的生长调控过程,并且与多种中枢神经系统疾病的发生发展密切相关。该文对hnRNP的结构、功能及其在中枢神经系统中的作用进行综述,旨在为理解神经系统疾病的分子机制提供新线索。; 刘一沉任长虹王航雁张成岗; 关键词：神经细胞神经胶质细胞中枢神经系统神经系统疾病

外显子芯片的数据分析和可变剪接预测的新算法被引量：2: 2009年; 可变剪接(alternative splicing)是产生高等真核生物蛋白质多样性的重要分子调控机制之一,众多研究表明,可变剪接可以改变蛋白质的结构和功能从而导致多种人类疾病。外显子芯片是Affymetrix公司开发的全基因组范围内检测外显子表达的高通量芯片系统,可通过检测外显子的差异表达来推断可变剪接事件。和传统的3′基因表达芯片相比,外显子芯片不仅探针(probe)设计的密度大,而且覆盖了全转录本中所有已知和预测的外显子。外显子芯片的数据分析包含基因和外显子两个水平的分析流程以及可变剪接预测部分。由于使用常规的芯片分析方法并不能有效地预测可变剪接事件,因此本文就现有的外显子芯片分析方法和流程进行综述,并着重介绍可变剪接事件预测的新算法。; 杭兴宜邓明华孙志贤张成岗; 关键词：可变剪接基因表达

DNA解链温度(Tm)不同预测方法的比较被引量：3: 2011年; 目的寻找最优的DNA解链温度(Tm)预测方法。方法使用12种Tm值预测方法计算来自文献中348个实测数据的Tm值,将每种方法预测值与实验标准值的差值进行四分位法作图,并计算各方法残差平方和的自然对数,排序后比较12种预测方法的优劣。结果使用最邻近法并结合SantaLucia 1998热力学参数表和Schildkraut1965盐浓度校正公式所预测的Tm值最接近实测数据。结论最邻近法是最准确的Tm值预测方法,而且当PCR引物的GC含量越接近于50%时,其预测准确率越高。; 张艳春屈武斌卢一鸣周扬张成岗; 关键词：引物探针热力学

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