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国家自然科学基金(31101545)

作品数:8 被引量:26H指数:3
相关作者:武涛秦智伟冯卓何红梅周秀艳更多>>
相关机构:东北农业大学更多>>
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相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 8篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 6篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 8篇黄瓜
  • 5篇克隆
  • 5篇基因
  • 4篇耐低氮
  • 3篇胁迫
  • 2篇氮素
  • 2篇氮胁迫
  • 2篇蛋白基因
  • 2篇低氮胁迫
  • 2篇转运
  • 2篇转运蛋白
  • 2篇转运蛋白基因
  • 2篇相关基因
  • 1篇叶片
  • 1篇叶片氮素
  • 1篇再循环
  • 1篇生长素
  • 1篇生理变化
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学

机构

  • 7篇东北农业大学

作者

  • 7篇武涛
  • 6篇秦智伟
  • 3篇冯卓
  • 2篇周秀艳
  • 2篇何红梅
  • 1篇辛明
  • 1篇李慧园
  • 1篇郑玉莹
  • 1篇郭冬雪
  • 1篇郝宁
  • 1篇王悦

传媒

  • 2篇中国农业科学
  • 2篇江苏农业科学
  • 1篇中国蔬菜
  • 1篇东北农业大学...
  • 1篇Journa...
  • 1篇分子植物育种
  • 1篇中国园艺学会...

年份

  • 3篇2017
  • 1篇2015
  • 4篇2013
  • 1篇2012
8 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
低氮胁迫下黄瓜钙依赖蛋白激酶基因的克隆及表达分析被引量:1
2013年
在低氮胁迫下,以黄瓜品种津研4号叶片为供试材料,以cDNA为模板,依据黄瓜基因组数据库中Csa002986基因编码区全序列,应用Primer Premier 5.0软件设计引物,克隆得到黄瓜钙依赖蛋白激酶基因(calcium-dependent protein kinase,CDPK)。该基因全长1584bp,编码527个氨基酸。预测该基因编码的蛋白是一个稳定的亲水蛋白,无跨膜结构,无信号肽,存在蛋白激酶结合区、EF手型钙结合区、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点、N酰基化位点等多个位点。CDPK基因在不同氮浓度处理下黄瓜各部位表达分析结果显示,在无氮条件下,CDPK基因在茎尖表达量最高,其次为叶和茎;在低氮条件下,CDPK基因在茎中表达量最高,其次为茎尖和叶;在正常及高氮条件下,CDPK基因在茎尖表达量最高,其次为茎和叶。CDPK基因在叶中的表达模式分析结果显示,在无氮及低氮胁迫下CDPK基因表达量增加,随着氮浓度的降低,CDPK基因的表达量增加并明显高于对照;在高氮胁迫条件下,CDPK基因的表达量低于对照。
何红梅秦智伟冯卓武涛辛明周秀艳
关键词:黄瓜克隆低氮胁迫
黄瓜硝酸盐转运蛋白基因CsNRT1.5的克隆及表达分析被引量:4
2013年
结合黄瓜基因组数据和生物信息学分析,采用PCR技术从黄瓜津研4号叶片中获得一个与衰老相关的基因,命名为CsNRT1.5。该基因全长1 764 bp,编码588个氨基酸,与拟南芥硝酸盐转运蛋白基因NRT1.5同源性最高(71%)。系统进化树分析表明,CsNRT1.5与拟南芥硝酸盐转运蛋白基因NRT1.5亲缘关系最近。RT-PCR以及qRT-PCR表达分析表明,CsNRT1.5是一个与黄瓜衰老相关的基因,在黄瓜幼嫩叶片表达量最高,其次为中部叶片,在下部衰老叶片检测到痕量表达。研究结果为下一步分析其在黄瓜氮代谢过程中的功能验证奠定理论基础。
秦智伟冯卓武涛周秀艳
关键词:黄瓜耐低氮RT-PCR
黄瓜细胞质型谷氨酰胺合成酶基因(GS1)的克隆及其在低氮条件下的表达被引量:16
2012年
【目的】分离和克隆黄瓜谷氨酰胺合成酶GS1基因,分析其序列特征,了解其在低氮条件下的表达情况。【方法】依据黄瓜基因组数据库中Csa015274基因编码区全序列,应用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物,从黄瓜叶片cDNA中克隆该基因,用生物信息学方法对获得的cDNA序列及推定氨基酸序列进行分析鉴定,并用实时荧光定量PCR法研究GS1基因在不同氮素浓度下的表达变化。【结果】分离到GS1基因,GenBank登录号为JQ277263。该基因长1 071 bp,编码356个氨基酸,与甜瓜(Cucumis melo L.)GS1基因同源性高达97%。该基因编码的蛋白是1个不稳定的疏水蛋白,无跨膜结构,无信号肽,存在蛋白激酶C磷酸化位点,酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,N-十四酰化位点,酪氨酸激酶磷酸化位点等活性位点。GS1基因表达模式分析显示,在低氮条件下,该基因下调表达,随着氮素浓度的增高GS1基因的表达量增加。在高浓度的氮素水平下,该基因的表达同样受到抑制。【结论】成功从黄瓜叶片中分离克隆到GS1基因,该基因具有已知物种GS1基因的特征,可用于该基因的功能研究。
冯卓秦智伟武涛何红梅
关键词:黄瓜克隆
Cloning and Expression Analysis of Sucrose Non-fermenting-1 Related Protein Kinase (SnRK) in Cucumis sativus L. Under Low Nitrogen Conditions
2013年
The sucrose non-fermenting-1 related protein kinase(SnRK), whose expression is induced by kinds of hyperosmotic stresses, plays a key role in improving stress resistance of plants. In order to investigate the molecular mechanism of low nitrogen resistance in cucumber, the full-length cDNA of SnRK gene was cloned in this study. The result showed that SnRK gene was 1 548 bp in length, encoded 515 amino acids, and had more than 80% homology with other crops. The protein encoded by this gene was an unstable and hydrophilic protein with no transmembrane structure and no signal peptide. Under nitrogen-free conditions and low nitrogen conditions, the expression pattern analysis of SnRK gene showed that this gene was up-regulated and its expression increased and was significantly higher than the normal level as the nitrogen concentration decreased. In addition, the expression of SnRK gene was also inhibited in the high nitrogen level and was significantly lower than the normal level. The result of this study would help us understand the molecular mechanism of low nitrogen resistance in cucumber.
He Hong-meiQin Zhi-weiFeng ZhuoWu Tao
关键词:CUCUMBERCLONE
黄瓜耐镉相关基因CsNAC019的克隆及表达分析被引量:5
2017年
【目的】研究黄瓜耐镉(Cd)分子机制,结合生物信息学分析获得一个NAC转录因子家族基因CsNAC019,对其进行克隆和表达分析,为进一步将该基因用于黄瓜耐Cd品种的改良与选育提供试验基础。【方法】通过PCR技术扩增CsNAC019全长;利用NCBI和DNAMAN进行序列比对和保守结构域分析;利用Expasy、TMHMM等在线软件进行氨基酸组成、稳定系数、亲水系数分析;通过Plant CARE在线工具进行启动子序列分析;采用MEGA 6.0软件根据NJ方法,构建系统进化树;采用q RT-PCR技术检测Cd胁迫后黄瓜CsNAC019在叶中的表达情况,并用DPS 7.05数据处理系统软件进行方差及显著性分析。【结果】CsNAC019含有典型的NAC保守结构域。通过BLAST分析比对,该基因在氨基酸序列上与拟南芥NAC019存在60%的同源性,两者在从N端到C端有A、B、C、D、E 5个氨基酸相对保守区的序列高度一致。该基因CDS序列全长为960 bp,编码319个氨基酸,编码蛋白质分子量为35.66 k D,理论等电点为8.72,不稳定系数为68.18,平均亲水系数为-0.483。启动子分析表明,除含有真核生物启动子固有的TATA和CAAT元件外,CsNAC019的启动子序列还存在G-box、ABRE、W-box、P-box、TCA-element、TC-richrepeats、HSE等多种响应逆境胁迫的顺式元件。系统进化分析表明,CsNAC019与甜瓜、桃、苹果、柑桔、葡萄、大豆等15种植物NAC转录因子有64%—96%的同源性,其中与甜瓜的NAC蛋白同源性最高,为96%。通过q RT-PCR分析发现,与对照相比,CsNAC019在Cd胁迫条件下表达量明显上调(8.2倍)。【结论】CsNAC019为黄瓜Cd胁迫诱导表达基因,推测其可能通过调节下游基因的表达调控黄瓜对Cd胁迫的应答。
李慧园田春育郑玉莹武涛
关键词:黄瓜CD基因克隆
黄瓜耐低氮相关基因CsAOC3的克隆及表达分析
2017年
从黄瓜叶片中分离获得1个丙二烯氧化物环化酶基因,命名为CsAOC3。该基因c DNA全长为753 bp,编码250个氨基酸,与甜瓜的丙二烯氧化物环化酶(AOC)序列同源性最高。通过荧光定量PCR(qRT-PCR)分析发现,CsAOC3在低氮胁迫条件下只有在耐低氮黄瓜品系D0328中的表达量明显上调,在耐低氮能力弱的黄瓜品系D0422中的表达量并无明显变化。研究结果可为黄瓜耐低氮的基因功能研究提供理论依据。
薛存宝范莲雪张铅王悦郭冬雪秦智伟武涛
关键词:黄瓜耐低氮克隆
生长素正向调控低氮胁迫条件下黄瓜叶片氮素再循环
探索黄瓜耐低氮胁迫的生理与分子机制,以期为培育耐低氮胁迫能力较强的黄瓜品种提供理论依据。以东北农业大学黄瓜课题组提供的耐低氮能力强的黄瓜品种'D0328'和耐低氮能力弱的黄瓜品种'D0422&#3...
范莲雪薛存宝秦智伟武涛
关键词:黄瓜生长素耐低氮
低氮条件下黄瓜寡肽转运蛋白(OPT)基因的克隆及表达分析被引量:1
2013年
根据黄瓜基因组数据库中Csa020719基因编码区全序列设计引物,通过RT-PCR扩增的方法从黄瓜品种津研四号的叶片中克隆得到寡肽转运蛋白基因(oligopeptide transporter gene,OPT)。基因编码区全长为2 013 bp。该基因编码的蛋白由20种氨基酸组成,含有670个氨基酸残基,分子量和理论等电点分别为73 kD和8.65。预测由该基因转录的寡肽转运蛋白为疏水蛋白,有14个连续的疏水片断。预测该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,存在OPT家族保守结构域,亚细胞定位在细胞膜上,主要功能为参与转运和底物结合。同源性和进化树的预测分析显示,OPT蛋白与毛果杨和蓖麻寡肽转运蛋白同源性分别达到了81%和79%,所转运的底物除有寡肽外,还包含有金属离子-烟草胺的螯合物等。qRT-PCR分析同一氮浓度处理OPT基因在不同部位表达结果显示,在无氮及低氮条件下,OPT基因在茎中表达量最高,其次为叶和茎尖。在高氮条件下,OPT主要在茎尖和叶中表达量较高,其次为茎,说明OPT基因在氮胁迫下存在于植物各个部位,并主要集中在生长旺盛的部位,为黄瓜的生长提供所需的能量。不同氮浓度下OPT在茎中表达分析结果显示,OPT基因在无氮及低氮下表达量增加,明显高于正常水平,并且随着氮浓度的降低,OPT的表达量增加,说明黄瓜OPT基因参与低氮胁迫应答反应,增强黄瓜耐低氮能力。
何红梅秦智伟冯卓武涛辛明周秀艳
关键词:黄瓜克隆生物信息学分析
黄瓜耐低氮生理与分子机制被引量:2
2017年
为理解和阐述黄瓜耐低氮的生理与分子机制,以前期试验筛选出的耐低氮性强的黄瓜品种D0328和耐低氮性弱的黄瓜品种D0422为材料,于2014年4—7月对二者在低氮胁迫(3 mmol/L NO-3)和正常氮(14 mmol/L NO-3)下生理和分子指标的变化规律及差异进行研究。结果表明,在低氮胁迫下,耐低氮性不同的2个黄瓜品种D0328和D0422在整个生长发育的关键时期(苗期、抽蔓期、盛果期),氮素吸收相关生理指标,如地上和地下部分硝态氮含量,地上和地下部分总氮含量没有显著差异;氮素同化相关生理指标,如硝酸还原酶(NR)、谷氨酰胺合成酶(GS)活性也没有显著差异;同时,与氮素吸收和同化相关基因响应模式一致。然而,在低氮胁迫下的盛果期,D0328的可溶性蛋白质含量显著低于D0422,暗示其可能具有较高的氮素再循环效率;同位素示踪结果进一步证明,D0328具有比D0422高的氮素再循环效率。根据上述规律证明,氮素再循环效率是影响黄瓜耐低氮能力的关键因子之一。
范莲雪郝宁张天怡陈焕轩秦智伟武涛
关键词:黄瓜耐低氮低氮胁迫生理变化分子机制
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