福建省自然科学基金(C0510006)
- 作品数：6 被引量：60H指数：3
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- 相关领域：生物学自动化与计算机技术理学化学工程更多>>
- 脂肪酶催化扁桃酸乙酯酯交换反应的研究被引量：14
- 2006年
- 利用脂肪酶Novozym435在正丁醇体系中催化酯交换反应，对（R，S）．扁桃酸乙酯进行了动力学拆分，考察了系统初始加水量，反应温度，振荡速度，底物浓度等因素对脂肪酶催化活性和对映体选择性的影响．研究结果表明，最适初始加水量为0．4％；在20℃-60℃范围内，酶催化活性随温度升高而增加，酶选择性随温度先升高后下降，最适温度45℃；底物扁桃酸乙酯浓度达5000mmol／L时，未观察到底物抑制现象，反应初速度为2．78mmol·L^-1·min^-1．
- 董亚琴孟春石贤爱李泳宁郭养浩
- 关键词：脂肪酶对映体选择性酯交换反应
- 一种基于Petri网的代谢流分析方法被引量：3
- 2008年
- 基于Petri网理论构建生物代谢网络模型,提出一种新的采用不等式的代谢流分析方法。以克鲁斯假丝酵母分批发酵,生产甘油的代谢网络为例,验证这种分析方法。结果表明,新分析方法,在前提假设和分析性能两方面均比采用方程式的传统方法明显优越。首先,方法允许实验数据有一定误差,使模型更加接近真实的实验系统。其次,新方法还可以做代谢模型更详细的分析:代谢流分裂比分析、敏感性分析。实际上,分析结果还可直接用于校正代谢物浓度、酶活力的边界值,为进一步研究代谢途径优化提供约束条件。
- 黄佳良孟春郭红
- 关键词：代谢网络代谢流分析PETRI网不等式
- 基因组改组技术选育耐高温、耐高乙醇酿酒酵母菌株的研究被引量：38
- 2007年
- 当以f4、f5、f6作为出发菌株,用酵母菌原生质体紫外诱变的方法,在不同温度下,用含有不同浓度乙醇的平板筛选,分别获得了在耐高温和耐乙醇性状有较大提高的f4.2、f5.1、f6.2、f4.5等正突变菌株。以这些菌株作为出发菌株,进一步用硫酸二乙酯诱变,获得了f5.1.1、f4.2.1两个乙醇耐受性能较高的菌株。在建立了上述不同突变株后,通过基因组改组(genome shuffling)的方法,将上述不同特性的菌株经过两轮genome shuffling,获得了耐高温性能和耐乙醇性能都较好的酵母菌株。经过摇瓶发酵后证明,R24株在35℃发酵过程中,发酵液中的最高乙醇浓度12.93%(W/V),比原始出发菌株f4在35℃的发酵液中最高乙醇浓度8.11%提高了近5%。
- 王灏王航孟春郭养浩
- 关键词：酿酒酵母基因组改组耐高温
- 非水相固定化酵母催化的(S)-2-辛醇的不对称合成被引量：4
- 2006年
- 研究固定化面包酵母FD-12对不同水/有机溶剂两相体系的耐受性及不对称合成(S)-2-辛醇的还原反应。结果表明,固定化面包酵母FD-12在水/正十二烷两相体系中的耐受性最好,糖代谢活性保留值可达99.59%。不同的水/有机溶剂两相体系对生物转化影响较大。对反应条件进行优化,在水/正十二烷相体积比为20/5,固定化细胞用量为15.0 g,初始底物2-辛酮浓度为200 mmol/L的条件下转化96 h,(S)-2-辛醇产物得率可达29.59%,ee(S)值达98.81%。
- 李泳宁石贤爱孟春董亚琴郭养浩
- 关键词：非水相固定化酵母
- 基于Petri网的基因调控网络建模与分析
- 2008年
- 如何有效描述与分析复杂的基因调控网络(GRN)是生物学家研究基因表达调控机制的关键步骤.现有大部分方法在建模过程中忽略了生物中广泛存在的协同作用,模型预测结果与实际生物行为之间存在误差.基于混合函数Petri网(HFPN)理论提出了一种对基因调控网络进行定量分析的新方法.首先简要介绍GRN与HFPN的基础理论,然后为HFPN引入两类新元素:逻辑库所与逻辑变迁,描述基因调控网络的逻辑规则以及转录因子间的协同作用,最后构建海胆endo16基因调控网络的Petri网模型,并预测模型在不同位点发生突变时的基因表达水平变化.分析结果与文献实验数据相一致,验证了方法的正确性.
- 黄佳良郭红孟春
- 关键词：基因调控网络逻辑规则
- 基因表达数据的频繁模式挖掘算法被引量：1
- 2009年
- 使用关联规则的方法来挖掘基因表达数据,在研究分析经典关联规则挖掘算法优缺点的基础上,立足于基因表达数据所呈现的新特征,提出一种基于BSC_tree的分段与运算基因表达数据频繁模式挖掘新算法BSC-AND.实验结果表明,与FP-growth和FIS算法相比,所提出的算法具有更低的时间复杂性.
- 寇晨艳郭红
- 关键词：基因表达数据关联规则
