国家自然科学基金(30560116)
- 作品数:7 被引量:16H指数:3
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- 相关领域:生物学理学农业科学更多>>
- 鲫鱼PKR-like Zα与d(GC)_(13)质粒的结合及其适应性进化被引量:6
- 2008年
- Zα是一类能特异性识别与结合左旋DNA(Z-DNA)的蛋白质结构域,分布于不同物种的多种蛋白质中,其结构保守并分化自一个共同的祖先Z-结构域。适应性进化分析显示Zα没有经历正达尔文选择,表明与其结构对应Zα的功能相当保守。凝胶阻滞试验表明原核表达的鲫鱼PKR-like Zα多肽(CaPZα)不与pMD18-T质粒结合,而却能与包含d(GC)13的重组质粒pMD18-T/(GC)13结合。同时,与ADAR1Zα相比,CaPZα与d(GC)13质粒的结合能力较弱,即CaPZα1和CaPZα2子域单独不能结合d(GC)13质粒。这表明Zα功能虽然没有异化,但有很大的不同。实验结果还表明负超螺旋和d(GC)n可能都是正常生理条件下,DNA形成潜在Z-DNA必不可少的因素。定点突变试验证实38N与60W两个氨基酸位点对于CaPZα结合Z-DNA非常关键。
- 陶敏吴初新杨攀胡成钰
- 关键词:适应性进化
- CaPKR-like在鲫鱼与草鱼组织中的表达特性分析被引量:8
- 2007年
- PKR是由干扰素诱导的最重要的抗病毒蛋白之一,能抑制细胞和病毒蛋白的合成。鲫鱼PKR基因(CaPKR-like)是鱼类第一个,也是非哺乳类脊椎动物第一个报道的PKR全长cDNA序列。本研究制备了CaPKR-like N-端包含Zα结构域的多克隆抗体,采用Western blots检验PKR-like在鲫鱼和草鱼组织中的表达特性。Western blots显示在未诱导的鲫鱼和草鱼中该基因表达水平非常低,但是经Poly I:C免疫一周后,在鲫鱼和草鱼等8种组织中有较强的PKR-like蛋白产生。结果暗示:CaPKR-like与哺乳类PKR有相同的组织表达特性。
- 彭悟汤雅男胡成钰
- 关键词:PKR鲫鱼草鱼
- 鲫鱼PKZ Zα结构域与d(GC)、d(TA)重组质粒的结合被引量:1
- 2009年
- Zα是能够特异性识别并结合左旋DNA(Z-DNA)的蛋白结构域,首先在人ADAR1中鉴定,随后又在ZBP-1(DLM-1)和E3L等蛋白质中发现了该结构域.鲫鱼PKZ是首次报道的具有Zα结构域的鱼类eIF2α激酶.为深入了解鲫鱼PKZZα的功能,原核表达并亲和层析纯化了3种多肽,即野生型PZα(Zα1Zα2)、替换型P(Zα1)2(Zα1Zα1)和点突变型(PZαK34A、PZαS35A、PZαR39A、PZαP57A).同时,构建了含有d(GC)6、d(GC)13、d(TA)13特殊插入序列的3种重组质粒,用于体外模拟Z-DNA.凝胶阻滞实验分析了3种多肽分别与重组质粒的亲和性.结果表明,PZα和P(Zα1)2能够与d(GC)重组质粒结合,并且随着多肽含量的增加,阻滞效应越明显.与野生型PZα相比,替换型P(Zα1)2结合d(GC)重组质粒的能力更强.PZα和P(Zα1)2还能微弱地与d(TA)13重组质粒结合.点突变型多肽都不能与重组质粒结合,暗示鲫鱼PKZZα结构域中这4个氨基酸残基在结合核酸分子的过程中非常关键.该文结果有利于进一步揭示鱼类PKZZα结构域与Z-DNA结合的分子机理.
- 杨攀吴初新李琴夏玉洁胡成钰
- 关键词:鲫鱼重组质粒
- Z-DNA及其生物学功能被引量:3
- 2009年
- Z-DNA是一种处于高能状态、不稳定的DNA分子构象。形成Z-DNA的原因有很多:首先,转录过程中,移动的RNA聚合酶在模板DNA的5'端产生负超螺旋扭曲力,导致Z-DNA的形成;其次,含有d(GC)n序列的核酸分子在高浓度的NaCl、[Co(NH3)6]2+盐溶液中也能够形成Z-DNA;最后,化学修饰也可以使DNA产生稳定的Z-DNA。Z-DNA是在体外首先发现的,但随着研究的不断深入,发现Z-DNA在体内也广泛存在并可能具有功能的多样性,包括参与基因表达调控、染色体断裂、基因重组、抗病毒、病毒发生等生物学过程。
- 汤雅男杨攀胡成钰
- 关键词:Z-DNA基因表达
- Z-DNA结合蛋白与Zα结构域被引量:1
- 2008年
- Z-DNA结合蛋白包括人、哺乳类和病毒中的ADAR1、DLM-1、E3L蛋白以及在鱼类中最新报道的PKR-like(PKZ),其共同点是都含有Zα结构域。本文简述了这几种蛋白质的结构与功能,并着重分析Zα结构域与Z-DNA、Z-RNA、B-DNA等核酸分子的识别机制和亲和性。
- 时俊华陶敏许丹胡成钰
- 关键词:Z-DNA
- 草鱼PKZ的表达差异性分析
- 鱼类PKZ的调控区域是由Z-DNA结合域组成。为了解PKZ的表达特性,采用RT-PCR对PKZ在草鱼各个组织差异性进行分析。结果表明:PKZ在草鱼所检的8种组织中都有微量的表达。在常温28℃为本底水平条件下,顺速升温至3...
- 汤雅男胡成钰
- 关键词:草鱼
- 文献传递