国家高技术研究发展计划(2006AA01A117)
- 作品数:7 被引量:57H指数:3
- 相关作者:迟学斌肖海力曹荣强武虹武永卫更多>>
- 相关机构:中国科学院中国科学院研究生院清华大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学政治法律更多>>
- InsPecT的千核并行及优化
- 2010年
- 蛋白质翻译后修饰(PTMs)在复杂的生命过程中起到极其重要的调控作用,对蛋白质翻译后修饰的研究是对蛋白质结构及其功能分析的深入,也是当前蛋白质组学的重要方向。InsPecT软件由于具备盲搜索功能,在蛋白质翻译后修饰鉴定领域备受关注,但极高的计算复杂度是阻碍其广泛应用的主要障碍。本文对InsPecT软件进行并行化,并在千核环境下进行测试;此外,还在负载平衡方面和GPU加速方面进行优化。结果显示,并行效率突出,加速效果显著。
- 涂强郎显宇陆忠华迟学斌
- 关键词:INSPECT负载平衡
- 基于RMI的高性能计算网格二次开发模型被引量:6
- 2010年
- 根据高性能计算和网格的特点,提出一种网格二次开发模型(GRM)。结合RMI和SSL/TLS技术,该模型提供了访问中间件的一致性接口,屏蔽了通过网络访问网格的繁杂问题,解决了敏感数据在不安全的广域网中传输的问题。以科学计算网格的中间件为基础,实现了GRM。多个基于GRM的用户接口开发经历和实验结果表明,GRM为开发人员提供了一个简单易用和功能全面的开发模型,而且具有良好的性能和可移植性。
- 曹荣强曹宗雁迟学斌肖海力
- 关键词:网格用户接口JAVARMI数据安全
- 基于“魔方”的不同编程模型下科学应用性能比较被引量:2
- 2009年
- 本文基于魔方(曙光5000A)"超并行"系统架构比较了不同并行编程模型下NAS Parallel Benchmark Multi-Zone的性能。结果表明,在单节点共享内存存储架构下OpenMP编程模型能获得更好性能,跨节点采用混合编程模型能获得更好性能,测试结果为百万亿次系统的使用及应用性能的提升起到指导作用。
- 张丹丹徐磊徐莹
- 关键词:NPB
- 网格资源描述模型GLUE+在ACCENT中的应用被引量:1
- 2008年
- 基于GLUE模型,建立网格应用资源描述模型,与GLUE模型中原有的计算资源描述模型和存储资源描述模型集成在一起,形成面向多站点、多应用的网格资源描述模型GLUE+,以GLUE+模型中的计算资源服务、存储资源服务和应用资源服务所提供的数据为基础,实现了网格的计费服务系统ACCENT。
- 吴凌江武虹肖海力张宏海迟学斌
- 关键词:网格资源资源描述
- 基于Portlet的高性能计算Portal被引量:12
- 2009年
- 提出基于Portlet的高性能计算Portal——HPCP,提供一个简单、通用、安全、可定制的Web作业管理系统,支持作业提交、查询、终止、目录列表及文件内容实时查看、大文件的数据流无缓存下载等功能。理论分析和实际测试表明,HPCP具有类似桌面应用程序的用户友好、交互性等特点,且有良好的可扩展性和安全性。
- 曹荣强迟学斌武虹肖海力
- 关键词:作业管理AJAX技术
- 基于网格环境的指纹自动识别系统
- 2011年
- 为了能够适应公安系统的行政结构,达到充分利用资源和实现资源的合理化配置,在分析现有的两层架构的指纹自动识别系统的基础上,加入了网格服务层(Grid Service),形成一个三层架构的指纹自动识别系统,即基于网格环境的指纹自动识别系统。本系统将全国的指纹比对系统作为整体来统一考虑,利用网格技术,对其进行整合,从而形成一个比对资源池,对外提供高性能、稳定、可靠的服务。最终建立起至少覆盖有部、省、地市或更多级别的指纹自动识别系统。
- 吴响肖海力王彦棡迟学斌冯才刚吴春生
- 关键词:网格环境指纹识别资源整合
- 一种保护云存储平台上用户数据私密性的方法被引量:40
- 2011年
- 近年来,云存储被研究者和IT厂商广泛关注,许多应用程序都用云存储来存储数据.但是用户和厂商都对于云存储的安全性和私密性问题表示忧虑.云存储安全的核心是分布式文件系统的安全性和私密性.基于SSL安全连接和Daoli安全虚拟监控系统可以充分保护分布式文件系统中用户数据的安全性和私密性.安全虚拟监督系统可以阻止传统攻击及来自云管理员的攻击.针对用户的不同需求和数据存储系统的特点,有2种解决方案,分别针对分布式文件系统中用户文件的每一块进行保护,保障用户文件每一块的私密性及对整个用户文件进行保护,保证用户文件整体私密性.对于用户数据的私密性而言,SSL安全连接和虚拟监控系统引入的性能损失是可以被接受的.
- 侯清铧武永卫郑纬民杨广文
- 关键词:分布式文件系统虚拟机