国家自然科学基金(81202713)
- 作品数：11 被引量：77H指数：6
- 相关作者：郑春松叶蕻芝徐筱杰刘献祥吴广文更多>>
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- 基于计算机模拟探讨海桐皮汤治疗骨性关节炎的多向药理学行为被引量：10
- 2013年
- 目的探讨海桐皮汤治疗骨性关节炎潜在的多向药理学行为。方法利用分子对接、生物网络等计算机模拟方法,构建治疗骨性关节炎的海桐皮汤分子集配体-靶作用网络,研究海桐皮汤的作用特点。结果虚拟筛选出215个潜在的活性化合物,其中,94个化合物与2个或2个以上的蛋白质有相互作用;所构建网络中配体-靶的作用关系曲线遵循幂函数规律。结论海桐皮汤中化合物与骨性关节炎靶标的作用具有"一对多,多对一"的非线性特点,提示海桐皮汤存在多向药理学行为,为海桐皮汤的骨性关节炎临床应用提供了科学依据。
- 郑春松徐筱杰叶蕻芝吴广文刘国强刘献祥
- 关键词：海桐皮汤分子对接骨性关节炎
- 川芎活血化瘀和行气止痛作用的计算机模拟研究被引量：12
- 2015年
- 目的:从分子层面研究川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征,为其临床应用提供实验依据。方法:利用配体聚类和化学空间研究川芎所含化合物的物理化学性质;利用分子对接和生物网络研究川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征。结果:川芎中的化合物分为10类,在化学空间具有很好的分散性;所建的网络模型中,活血化瘀与行气止痛作用网络的特征分布存在部分的相似之处,其网络中每个化合物的平均靶点数分别为2.67和2.22,而且,网络中化合物的总数为30,反映川芎的多成分-多靶点作用。结论:计算机模拟直观显示了川芎活血化瘀与行气止痛的作用特征异同点,从分子层面揭示川芎的多靶点作用,为其具有不同功效提供解释。
- 郑春松徐筱杰叶蕻芝刘献祥
- 关键词：川芎活血化瘀行气止痛分子特征计算机模拟
- 透骨消痛胶囊中补肾柔肝药和活血祛风药治疗骨关节炎作用方式的计算机模拟比较被引量：14
- 2015年
- 目的:从分子层面比较透骨消痛胶囊中补肾柔肝药和活血祛风药治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用方式。方法:分别以透骨消痛胶囊中的补肾柔肝药和活血祛风药所含化合物及OA靶点蛋白质作为研究对象,利用描述符计算、分子对接、生物网络等计算机模拟方法,分析二者的化合物化学空间特征及中药-化合物-靶点网络特征。结果:补肾柔肝药和活血祛风药的化学成分在化学空间中有较大的重叠区域,但前者分布更广;在中药-化合物-靶点网络中,补肾柔肝药和活血祛风药的作用网络特征分布仅存在部分相似之处,其网络中每个化合物的平均作用靶点数分别为4.3和1.9,平均每个靶点分别与2.7个和1.5个化合物相关联。结论:在治疗OA时,透骨消痛胶囊中补肾柔肝药主要是通过混杂药物的作用方式起作用,而活血祛风药主要是通过组合药物的作用方式起作用。
- 郑春松叶蕻芝李西海叶锦霞吴广文徐筱杰刘献祥
- 关键词：骨关节炎透骨消痛胶囊计算机模拟活血祛风
- 透骨消痛胶囊及其拆方对退变软骨细胞Wnt/β-catenin信号通路的影响被引量：6
- 2016年
- 背景:前期研究表明,透骨消痛胶囊能调控软骨细胞Rho/Rock信号通路、抑制软骨细胞线粒体凋亡通路的信号转导、改变软骨下骨重塑的速率和模式、改善软骨下骨胶原纤维和钙磷结晶的排列等对骨性关节炎发挥治疗作用。目的:进一步观察透骨消痛胶囊及其拆方含药血清对大鼠退变软骨细胞Wnt/β-catenin信号通路的影响,揭示方中治疗骨性关节炎的主要治法。方法:(1)取SD大鼠40只随机分为透骨消痛胶囊组、补肾柔肝组、活血祛风组和生理盐水组,按照药理试验中动物间和动物与人体间的等效剂量换算,前3组分别灌服等效剂量的透骨消痛胶囊、补肾柔肝药、活血祛风药,生理盐水组灌服生理盐水,制备含药血清用于细胞实验。(2)体外培养SD大鼠软骨细胞并分为5组:空白对照组、模型组、透骨消痛胶囊组、补肾柔肝组和活血祛风组。模型组及各给药组用白细胞介素1β干预软骨细胞24 h后,加入各组血清干预软骨细胞72 h,空白对照组用盐水血清培养,同一时间收集空白对照组软骨细胞。(3)采用实时定量反转录-聚合酶链反应和Western blot法分析Wnt 4、β-catenin、基质金属蛋白酶13的表达。结果与结论:(1)与空白对照组相比,模型组Wnt 4、β-catenin、基质金属蛋白酶13表达均明显增加。(2)与模型组相比,透骨消痛胶囊组、补肾柔肝组和活血祛风组的Wnt 4、β-catenin、基质金属蛋白酶13表达均明显降低,且降低程度为透骨消痛胶囊组>补肾柔肝组>活血祛风组。(3)结果提示透骨消痛胶囊对白细胞介素1β诱导的软骨细胞具有协同保护作用,补肾柔肝为透骨消痛胶囊治疗骨性关节炎的主要治法。
- 吴追乐陈星强陈春蓉于超朱晓勤庄志强
- 关键词：软骨软骨细胞WNT/Β-CATENIN信号通路透骨消痛胶囊活血祛风
- 应用计算机模拟研究牛膝在骨关节炎中的痿痹同治作用被引量：3
- 2020年
- 目的:从分子水平探讨牛膝在骨关节炎中痿痹同治的药效物质基础、作用靶点及作用方式。方法:①从中国知网和PubMed等数据库中,检索73个牛膝的化学成分,构建牛膝的化学成分数据集;从DrugBank数据库中搜索与骨关节炎治疗相关的药物分子,其中,刺激关节软骨中蛋白多糖合成的药物分子3个,用于构建治痿的药物分子数据集,以及抗炎镇痛的药物分子28个,用于构建治痹的药物分子数据集;依托定量构效关系及主成分分析平台,分析牛膝化学成分数据集和药物分子数据集的化学空间。②以治痹直接相关的白介素-1β、白介素-6、肿瘤坏死因子-α,以及治痿直接相关的基质金属蛋白酶-1、基质金属蛋白酶-3、转化生长因子-β1为靶点,利用分子对接和生物网络等平台,研究其与牛膝中化学成分的相互作用,并构建牛膝治痿和治痹的化合物-靶点网络,分析牛膝治疗骨关节炎的药效物质基础、靶点和作用方式。结果:①相对于药物分子数据集,牛膝化学成分数据集在化学空间上具有更好的分散性,且在后方存在与治痿的药物分子数据集相似或相近的化学空间,在底部存在与治痹的药物分子数据集相似或相近的化学空间,揭示了牛膝具有治痿和治痹作用的可能性。②化合物-靶点网络显示了牛膝的药效物质基础主要为皂苷类、植物甾酮类、黄酮类和生物碱化合物,且治痹和治痿的化合物个数分别为37和26,同时具有治痹和治痿作用的化合物个数为20,能作用的靶点最大数目达到6。其中,牛膝治痹化合物-靶点网络的重要化合物节点为黄酮类物质葛根素、黄芩苷、槲皮素-3-O-芸香糖苷和山柰酚-3-O-葡萄糖苷,其重要靶点节点为白介素-1β和肿瘤坏死因子-α;牛膝治痿化合物-靶点网络的重要化合物节点为黄酮类物质黄芩苷,其重要靶点节点为基质金属蛋白酶-1。结论:计算机模拟直观地显�
- 郑春松叶蕻芝叶锦霞付长龙
- 关键词：骨关节炎牛膝计算机模拟
- 补肾壮筋汤延缓关节软骨退变多靶点作用计算机模拟研究被引量：5
- 2018年
- 目的:从分子水平探讨补肾壮筋汤延缓关节软骨退变的多靶点作用,为临床上"从本治痿"理论治疗骨关节炎做出药效学阐释。方法:利用分子对接、生物网络等计算机模拟平台,以与关节软骨退变相关的基质金属酶-1、基质金属酶-2、基质金属酶-3、基质金属酶-7、基质金属酶-8、基质金属酶-9、基质金属酶-11和基质金属酶-13为靶点,以其原配体建立活性位点,研究其与补肾壮筋汤分子集中化合物的相互作用,构建延缓关节软骨退变的补肾壮筋汤分子集化合物-靶点作用网络,分析补肾壮筋汤的作用特点。结果:从补肾壮筋汤分子集中虚拟筛选出106个潜在的活性化合物,主要为苷类化合物,其中,能作用1个靶点、2个靶点和>2个靶点的化合物数目分别为33、40和33。所构建的化合物-靶点作用网络中,每个化合物的平均靶点数为2.3个,平均每个靶点与13.2个化合物相关联,且大部分化合物只能作用于少数的靶点,仅有3个化合物最多能作用于7个靶点。其化合物-靶点的作用关系曲线遵循幂函数p(k)=k^(-1.6429)规律,体现补肾壮筋汤中化合物与靶点的作用具有"一对多,多对一"的非线性特点。结论:补肾壮筋汤延缓关节软骨退变存在多靶导向作用,主要是通过类似混杂药物的方式起到多靶作用。这为"从本治痿"理论治疗骨关节炎提供了解释,也为从补肾壮筋汤中寻找治疗骨关节炎的新型药物提供参考与借鉴。
- 郑春松徐筱杰黄绥心叶蕻芝
- 关键词：补肾壮筋汤关节软骨退变多靶点计算机模拟
- 从Wnt/β-catenin信号通路探讨透骨消痛胶囊对关节软骨的保护作用被引量：6
- 2015年
- 目的:从Wnt/β-catenin信号通路观察透骨消痛胶囊对大鼠膝骨关节炎关节软骨的保护作用。方法:60只健康清洁级2月龄雄性SD大鼠,随机分为正常对照组、模型对照组和透骨消痛胶囊组,每组20只。模型对照组和透骨消痛胶囊组采用质4%木瓜蛋白酶双膝关节腔注射,成功复制骨关节炎模型后,透骨消痛胶囊组给予透骨消痛胶囊287.5 mg·kg^(-1),正常对照组和模型对照组给予相同剂量的生理盐水。给药2个月后,采用Western blot法观察各组关节软骨中含Ⅰ型血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶-5(ADAMTS-5)、Wnt-4、β-catenin和基质金属蛋白酶-13(MMP-13)的表达。结果:与正常对照组比较,模型对照组ADAMTS-5、Wnt 4、β-catenin和MMP-13表达升高(P<0.05);与模型对照组比较,透骨消痛胶囊组ADAMTS-5、Wnt 4、β-catenin和MMP-13表达降低(P<0.05)。结论:透骨消痛胶囊对关节软骨的保护作用与其降低Wnt/β-catenin信号通路表达相关。
- 吴追乐曾建伟陈星强陈春蓉吴广文庄志强林如辉尤玉莹郑春松
- 关键词：透骨消痛胶囊WNT/Β-CATENIN信号通路
- 基于计算机模拟乌头汤治疗疼痛的药效物质基础与分子作用机制被引量：19
- 2016年
- 目的:探讨乌头汤治疗疼痛的药效物质基础与分子作用机制。方法:借助Discovery Studio模拟平台,构建乌头汤分子数据集,比较其与Drug Bank数据库中抗炎镇痛药物分子的化学空间,在此基础上采用基于分子对接的网络药理学方法,构建乌头汤中化合物-靶点作用网络,探讨其与治疗疼痛靶点的相互作用。结果:乌头汤中分子与药物分子在化学空间上具有良好的重叠性,其主要药效物质基础为生物碱、黄酮类、皂苷类化合物,可作用于诱导型一氧化氮合酶、p38、c-Jun氨基末端激酶1、肿瘤坏死因子-α、磷酸二酯酶4A和Kappa阿片受体。结论:乌头汤可作用于p38 MAPK、JNK等信号通路,抑制NO释放,减弱机械痛敏,阻止痛觉冲动的传导和传递等途径,起到多成分、多靶点、多途径治疗疼痛的效果。
- 郑春松林洁付长龙叶锦霞徐筱杰叶蕻芝
- 关键词：乌头汤网络药理学分子对接
- 基于Wnt/β-catenin信号通路探讨透骨消痛胶囊含药血清对经TNF-α诱导的软骨细胞多靶点保护作用被引量：3
- 2015年
- 目的观察透骨消痛胶囊含药血清对经TNF-α诱导的软骨细胞Wnt/β-catenin信号通路的影响,探讨其对关节软骨细胞的多靶点保护作用。方法将4周龄SD大鼠关节分离软骨细胞进行体外培养、传代,用免疫组化法鉴定第三代软骨细胞。以第3代软骨细胞为靶细胞,分为正常组、模型组和治疗组,模型组和治疗组用TNF-α诱导软骨细胞凋亡后,分别给予生理盐水血清和透骨消痛胶囊含药血清作用24 h,Western blot法观察各组软骨细胞中Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白Wnt 4、β-catenin和GSK-3β的表达。结果 (1)细胞鉴定结果为Ⅱ型胶原免疫细胞化学染色阳性,由此说明分离细胞为软骨细胞。(2)与正常组相比,模型组Wnt 4和β-catenin表达升高(P<0.05),而GSK-3β的表达降低(P<0.05);与模型组相比,治疗组Wnt 4和β-catenin表达降低(P<0.05),而GSK-3β的表达升高(P<0.05)。结论透骨消痛胶囊能多靶点调控Wnt/β-catenin信号通路,对软骨细胞具有保护作用,为其治疗骨关节炎提供依据。
- 隋利强陈星强陈春蓉庄志强
- 关键词：软骨细胞透骨消痛胶囊WNT/Β-CATENIN信号通路多靶点
- 基于计算机模拟探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用被引量：6
- 2013年
- 目的:探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用。方法:以六味地黄丸所含的183个化合物和与骨关节炎相关的13个靶点蛋白质为研究对象,利用描述符计算、主成分分析、分子对接等计算机模拟方法,分析六味地黄丸所含化合物的物理化学性质及其作用的靶点,并据此构建六味地黄丸多成分-多靶点作用网络。结果:六味地黄丸所含化合物具有多样的物理化学性质,这些化合物与治疗骨关节炎药物分子、类药分子具有相似的化学空间。六味地黄丸多成分-多靶点网络模型中每个化合物的平均靶点数为2.24,平均每个靶点与5个化合物相关联。结论:六味地黄丸治疗骨关节炎具有多成分、多靶点作用的特点,可能在治疗骨关节炎方面具有良好的应用前景。
- 郑春松叶蕻芝蔡亮亮陈加守魏磊生刘献祥
- 关键词：六味地黄汤骨关节炎
