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湖南省自然科学基金(03jjy3095)
作品数:
2
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骆嘉伟
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基于隐马尔可夫模型的二次k-均值基因序列聚类算法
2007年
本文提出了一种基于隐马尔可夫模型的二次k-均值聚类算法并实现了对基因序列数据的建模与聚类。算法首先引入了同源基因序列核苷酸比率趋向于一致的生物学特征来对基因序列数据进行初次k-均值聚类,然后利用第一次聚类结果训练出表征序列特征的隐马尔可夫模型,最后采用基于模型的k-均值方法再次聚类。实验结果表明,该算法是可行的,并且具有较好的聚类质量。
吴君浩
骆嘉伟
王艳
杨涛
杨旭
关键词:
隐马尔可夫模型
基因序列
K-均值聚类
利用遗传特征实现微生物基因序列聚类分析
2006年
文章提出了一种使用微生物遗传特征来进行基因序列聚类的方法。该方法首先从每条基因序列中划分出若干个等差长度的采样片断,然后利用各采样片断的遗传特征DNA(G+C)mol%值来作为基因序列聚类的依据。试验结果表明该方法是可行的,并且具有较好的聚类质量。
吴君浩
骆嘉伟
赵蕊
关键词:
微生物
基因序列
K-均值聚类
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