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教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-05-0502)

作品数:2 被引量:16H指数:2
相关作者:徐辰武许花杨泽峰顾世梁陆鑫更多>>
相关机构:扬州大学连云港职业技术学院更多>>
发文基金:教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家重点基础研究发展计划江苏省普通高校研究生科研创新计划项目更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 2篇基因
  • 1篇蛋白酶抑制剂
  • 1篇性状
  • 1篇性状基因
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇数量性状
  • 1篇数量性状基因
  • 1篇数量性状基因...
  • 1篇数量性状基因...
  • 1篇水稻
  • 1篇拟南芥
  • 1篇胚乳
  • 1篇胚乳性状
  • 1篇基因家族
  • 1篇基因座位
  • 1篇谷物
  • 1篇半胱氨酸
  • 1篇半胱氨酸蛋白...

机构

  • 2篇扬州大学
  • 1篇连云港职业技...

作者

  • 2篇徐辰武
  • 1篇顾世梁
  • 1篇杨泽峰
  • 1篇王亚民
  • 1篇汤在祥
  • 1篇许花
  • 1篇陆鑫

传媒

  • 1篇作物学报
  • 1篇扬州大学学报...

年份

  • 1篇2009
  • 1篇2007
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
拟南芥和水稻cystatin基因家族的生物信息学分析被引量:12
2007年
利用已经分离的植物半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因家族的成员进行分析;同时利用这些基因编码的蛋白质序列构建系统发生树,并对这些蛋白序列的保守序列进行分析;最后在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列。结果表明:1结合结构域的鉴定、多序列联配以及MEME分析最终确定了7个拟南芥和11个水稻的cystatin基因。2系统发生分析表明,cystatin基因的基本特征很可能是在拟南芥和水稻的分离之前就已经形成。3 cystatin结构域在蛋白质间高度保守。4拟南芥和水稻的cystatin基因主要在花、叶、根、种子和愈伤组织中表达,这有助于植物避免昆虫的侵害。
杨泽峰顾世梁许花徐辰武
关键词:拟南芥水稻半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因家族
基于贝叶斯统计的谷物胚乳性状QTL多区间作图方法被引量:4
2009年
贝叶斯统计学已被广泛地应用在现代科学的各个研究领域。本研究将贝叶斯统计方法和谷物三倍体胚乳性状数量遗传模型相结合,以F2群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒自交种子胚乳性状的单粒观测值为数据模式,提出了胚乳数量性状基因座(QTL)多区间作图的贝叶斯方法。该方法首先构建胚乳性状的多区间多QTL遗传模型,然后通过基于Gibbs抽样和Metropolis-Hastings算法实现的马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法同时获得多个QTL效应和位置的估计。方法的有效性通过一条长染色体的模拟实验进行了验证,结果表明,本文提出的贝叶斯多区间方法能够准确地估计胚乳性状QTL的位置和效应,并可有效区分两种显性效应。
王亚民汤在祥陆鑫徐辰武
关键词:贝叶斯统计胚乳性状数量性状基因座位
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