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教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-05-0502)
作品数:
2
被引量:16
H指数:2
相关作者:
徐辰武
许花
杨泽峰
顾世梁
陆鑫
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相关机构:
扬州大学
连云港职业技术学院
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发文基金:
教育部“新世纪优秀人才支持计划”
国家重点基础研究发展计划
江苏省普通高校研究生科研创新计划项目
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相关领域:
生物学
农业科学
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文献类型
2篇
中文期刊文章
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生物学
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农业科学
主题
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基因
1篇
蛋白酶抑制剂
1篇
性状
1篇
性状基因
1篇
生物信息
1篇
生物信息学
1篇
生物信息学分...
1篇
数量性状
1篇
数量性状基因
1篇
数量性状基因...
1篇
数量性状基因...
1篇
水稻
1篇
拟南芥
1篇
胚乳
1篇
胚乳性状
1篇
基因家族
1篇
基因座位
1篇
谷物
1篇
半胱氨酸
1篇
半胱氨酸蛋白...
机构
2篇
扬州大学
1篇
连云港职业技...
作者
2篇
徐辰武
1篇
顾世梁
1篇
杨泽峰
1篇
王亚民
1篇
汤在祥
1篇
许花
1篇
陆鑫
传媒
1篇
作物学报
1篇
扬州大学学报...
年份
1篇
2009
1篇
2007
共
2
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拟南芥和水稻cystatin基因家族的生物信息学分析
被引量:12
2007年
利用已经分离的植物半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因家族的成员进行分析;同时利用这些基因编码的蛋白质序列构建系统发生树,并对这些蛋白序列的保守序列进行分析;最后在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列。结果表明:1结合结构域的鉴定、多序列联配以及MEME分析最终确定了7个拟南芥和11个水稻的cystatin基因。2系统发生分析表明,cystatin基因的基本特征很可能是在拟南芥和水稻的分离之前就已经形成。3 cystatin结构域在蛋白质间高度保守。4拟南芥和水稻的cystatin基因主要在花、叶、根、种子和愈伤组织中表达,这有助于植物避免昆虫的侵害。
杨泽峰
顾世梁
许花
徐辰武
关键词:
拟南芥
水稻
半胱氨酸蛋白酶抑制剂
基因家族
基于贝叶斯统计的谷物胚乳性状QTL多区间作图方法
被引量:4
2009年
贝叶斯统计学已被广泛地应用在现代科学的各个研究领域。本研究将贝叶斯统计方法和谷物三倍体胚乳性状数量遗传模型相结合,以F2群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒自交种子胚乳性状的单粒观测值为数据模式,提出了胚乳数量性状基因座(QTL)多区间作图的贝叶斯方法。该方法首先构建胚乳性状的多区间多QTL遗传模型,然后通过基于Gibbs抽样和Metropolis-Hastings算法实现的马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法同时获得多个QTL效应和位置的估计。方法的有效性通过一条长染色体的模拟实验进行了验证,结果表明,本文提出的贝叶斯多区间方法能够准确地估计胚乳性状QTL的位置和效应,并可有效区分两种显性效应。
王亚民
汤在祥
陆鑫
徐辰武
关键词:
贝叶斯统计
胚乳性状
数量性状基因座位
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