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应用计算机手段分析植物病原细菌Ralstonia solanacearum的蛋白质序列被引量：4: 2007年; 应用SignalP 3.0,LipoP和TargetP对植物病原细菌Ralstonia solanacearum基因组中的3440个ORFs(openreading frames)进行了信号肽分析,同时系统分析了信号肽的类型及结构。结果表明,3440个ORFs中有462个ORFs所编码蛋白质具有N-端有信号肽序列,其中348个分泌类信号肽、100个信号肽具有RR-motif信号肽,14个脂蛋白类信号肽,未发现Prepilin-like信号肽和Bacteriocin and Pheromone信号肽。在这462个具有可切割信号肽的分泌蛋白中,有84.0%蛋白质为胞外分泌型(S型),13.2%为线粒体分泌型(M型),另外有2.8%为其它类型的分泌蛋白。通过LipoP分析该菌的全基因组预测具有4种类型蛋白质,其中其中SpI有425个,占12.3%;SpII有80个,占2.3%;CYT有2 541个,占73.9%;TMH有414个,占12.0%。比较了Ralstonia solanacearum和Pseudomonas syringaepv.tomato信号肽的长度及氨基酸的组成,发现这两种菌在这些方面存在这很大程度的相似性。本研究通过对Ralstonia solanacearum进行分泌蛋白和信号肽结构的分析,为将来功能基因组和分泌型外源蛋白的利用提供理论基础。; 刘雅婷李成云李永忠李正跃; 关键词：SOLANACEARUM ORF 信号肽

烟草番茄斑萎病的研究进展被引量：5: 2007年; 烟草番茄斑萎病是一类在局部地区产生严重危害的烟草病害,由布尼亚病毒科番茄斑萎病毒属典型成员烟草番茄斑萎病毒系统侵染引起。目前该病在中国许多省均有发生的报道,在云南烟区广泛分布,在局部地区可造成60%以上的严重损失,烟草番茄斑萎病被认为是世界上对烟草最具潜在危险病害之一,较为系统全面的综述了烟草番茄斑萎病的发生与分布,病害症状学,病原物,致病机制,病毒基因组结构和功能以及病害的流行及控制等方面的研究进展。; 李丞李永忠文国松刘雅婷; 关键词：烟草番茄斑萎病毒

温室非洲菊上西花蓟马种群动态和空间分布被引量：10: 2012年; 通过对云南省昆明市某花卉基地大棚非洲菊不同花期、不同时间西花蓟马种群动态和空间分布的调查,运用聚集度指标、Iwao和Taylor回归方程进行了其空间分布图式的测定。结果表明:西花蓟马为非洲菊上蓟马优势种,盛花期共数量占蓟马总数的96%,成虫数量随非洲菊开放花朵的增加而增加,到盛花期达最高密度15头/朵,而若虫主要集中在即将凋谢的花朵中,最高密度达36头/朵。5月中旬为蓟马的危害高峰期,且蓟马的总量随温度的增减变化明显。西花蓟马成虫和若虫在非洲菊上的空间分布格局为聚集分布,且聚集度随种群密度的升高而增加,成虫的聚集原因主要是环境因素和自身的习性,而若虫的聚集原因主要是环境因素。利用Iwao回归法中的α,β参数计算出在允许误差范围内的理论抽样数,为田间调查取样提供了有效方法,并为西花蓟马的预测及防治提供了理论依据。; 陈雪娇字秋艳刘雅婷马泽勇桂富荣仵发静; 关键词：西花蓟马非洲菊种群动态

实时荧光定量PCR在植物病害中的应用被引量：21: 2009年; 实时荧光定量PCR技术作为一项新兴技术,越来越受到人们的重视。它以快速、准确定量、便捷等优点广泛应用于科学研究各个领域,近年来,实时荧光定量PCR技术在植物病害研究上不断深入,大大提高了植物病害的检测效率和监测防治水平。结合了最近几年来应用于检测和鉴定植物病原病害的实时荧光定量PCR过程中引物与探针的设计、反应过程、结果评价情况,综合论述了实时荧光定量PCR技术在由真菌、细菌、病毒、线虫引发的植物病害的检测与应用。; 徐小刚刘雅婷; 关键词：实时荧光定量PCR CT值植物病害引物设计灵敏度

番茄斑萎病毒属ssRNA-M序列比对分析被引量：3: 2009年; 番茄斑萎病毒属(Tospovirus)是布尼亚病毒科唯一的植物病毒属,在热带、亚热带以及温带地区引起许多作物和花卉严重病害的发生.该研究利用DNAstar、DNAman等软件对其RNA-M编码G1G2蛋白和NSm非结构蛋白的核酸和蛋白质序列进行分析,发现Tospovirus属病毒的G1G2蛋白和NSm非结构蛋白序列的长度和GC含量在不同病毒种间变异不大,同时得出序列比对图和一致性(Identity)的值、同源性(Homolog tree)的值和系统进化树(Phylogenetic tree)的值,并发现根据NSm蛋白质序列划分的2个相似性组与前人划分的血清组非常接近.; 刘雅婷李鑫李永忠李正跃李成云朱有勇; 关键词：番茄斑萎病毒属非结构蛋白

云南烟草上出现番茄斑萎病毒(Tospovirus)属病毒被引量：6: 2008年; 2004-2007年间对云南省烤烟种植区进行调查，在云南省楚雄和文山2个地区，获得3份疑似Tospovirus属病毒的样本。通过Tospovirus组引物（Tospovirus Group Primer）进行RT-PCR扩增、克隆和测序，获得500nts核酸片段，通过NCBI BLAST网络数据库比对，确定这3份样品为Tospovirus属的病毒；通过DNAman软件比对分析所得到的核酸序列和已经公布的Tospovirus属病毒RNA L同位点序列，从得到的系统进化图可以看出，云南3个样品明显分为2簇，即YN-1和YN-2，分别与血清组I和Ⅵ的Tospovirus属病毒聚为一簇。; 刘雅婷卢秀萍郑元仙李永忠李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒属

番茄斑萎病毒在烟草植株上症状学特征被引量：5: 2009年; 通过2006年间在美国北卡罗来那州烟草主要生产区的田间调查,系统的描述了番茄斑萎病毒侵染烤烟后,在烤烟叶片上产生的叶片畸形、镶脉、叶脉坏死、坏死斑、同心环纹、叶面皱缩,且整株出现矮化异常生长;将番茄斑萎病毒采用人工摩擦接种到本生烟上,植株被系统侵染,并产生褪绿斑坏死斑、同心环纹、皱缩等症状,植株一般4～5周内死亡。通过比较两种寄主,发现番茄斑萎病毒侵染两种寄主均出现系统症状,症状相似,但也有不同。; 刘雅婷郑元仙李永忠徐小刚孙文涛李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒症状学烟草

TSWV抗性破坏株系进化机制研究初报: 斑萎病毒抗性破坏株系是TSWV病毒与抗性寄主长期协同进化形成的,它能系统侵染具有抗性基因(Sw-5或Tsw)植物寄主,使寄主丧失抗性.本研究选取采自美国不同地区番茄、辣椒和烟草田间的10个TSWV株系,通过摩擦接种7种不...; 刘雅婷郑元仙李永忠徐小刚孙文涛李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒

Tospovirus属病毒的ssRNA-S链的比对分析: Tospovirus属引起多种农作物和花卉的严重病害。本研究应用生物信息学软件DNAstar、DNAman对Tospovirus属所有成员的RNA-S中的外壳蛋白（NC）和非结构蛋白（NSs）的编码核酸和氨基酸序列进行了...; 刘雅婷李正跃郑元仙徐小刚李永忠; 关键词：番茄斑萎病毒属非结构蛋白; 文献传递

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云南省自然科学基金(2005C0036M)