国家自然科学基金(21175064)
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 相关作者：施绍萍邱建丁更多>>
- 相关机构：南昌大学中国人民解放军南昌陆军学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”江西省教育厅科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 赖氨酸酰化位点的计算预测及功能分析
- 蛋白质翻译后修饰是一种动态、可逆的过程，在原核生物和真核生物的多种生理和病理功能中扮演着重要角色。尽管目前已经发现的蛋白质翻译后修饰有600多种，且主要发生在赖氨酸和精氨酸中，然而很多修饰底物在病理和生理中的作用仍然很大...
- 王佑淦
- 关键词：蛋白质翻译后修饰支持向量机
- 文献传递
- GlutPred:一种新型蛋白质戊二酰化位点的在线预测工具被引量：1
- 2018年
- 蛋白质戊二酰化是一种新型的蛋白质翻译后修饰(PTM),它可以协调各种生物过程。计算预测方法可以提供快速、准确和有效的方法识别各种类型的PTM位点。然而,目前尚未见赖氨酸戊二酰化的在线预测工具报道。一个氨基酸可以由多个mRNA密码子编码,因此mRNA序列比蛋白质序列更为复杂,这种信息与戊二酰化的PTM的关系是什么?为了构建在线预测工具并回答此问题,本文收集了来自小鼠的蛋白组织的实验验证的蛋白质戊二酰化位点,在NCBI数据库中搜索这些位点的蛋白名对应的mRNA序列。通过蛋白质或mRNA序列信息,利用一个简单的矩阵构建了蛋白质戊二酰化位点的预测算法,并开发了蛋白质戊二酰化位点的在线预测工具GlutPred。
- 周志友邱建丁
- 关键词：蛋白质翻译后修饰MRNAGSM
- 基于信息熵和残基电荷性的酪氨酸硝基化位点预测
- 2012年
- 采用氨基酸残基信息熵优化窗口,结合氨基酸的电荷性构建了蛋白质酪氨酸硝基化位点的预测模型。基于10-倍交叉验证,该模型的预测准确率和马氏相关系数分别达到了84.80%和69.69%。同时,对信息熵优化窗口和传统连续窗口进行了探讨,结果表明,信息熵窗口能够有效捕获酪氨酸硝基化肽段上的重要位点,克服短肽序列易丢失信息而单纯增大肽段长度又会引入冗余信息的矛盾,并最终提高模型的预测性能。特征分析揭示酪氨酸残基的局部静电环境、邻近的进化保守位点和长程位点对酪氨酸硝基化均有重要影响。
- 施绍萍揭志勇邱建丁
- 关键词：信息熵
- 组合二级结构信息预测赖氨酸甲基化和乙酰化
- <正>甲基化和乙酰化是发生在赖氨酸残基上的两种主要的蛋白翻译后修饰。它们对细胞的代谢、分化、凋亡和复制等生理过程具有重要的调控作用,还与衰老和许多重大疾病紧密相关,是当今表观遗传学研究的
- 施绍萍索生宝邱建丁
- 关键词：赖氨酸甲基化乙酰化
- 文献传递
- 多特征提取预测蛋白质酪氨酸硫酸化修饰位点
- <正>酪氨酸硫酸化是一种广泛存在于不同种类和细胞中的蛋白质翻译后修饰。据估计,在有机体的总蛋白中约有1%的酪氨酸残基被硫酸化。催化蛋白质中酪氨酸残基硫酸化反应的是酪氨酰蛋白硫酸基转移酶。该酶为膜内在蛋白质,这种酶能够催化...
- 黄淑云索生宝邱建丁
- 文献传递
