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犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析被引量：12: 2016年; 犬圆环病毒(Dog circovirus,DogCV)是近年来新发现的一种哺乳动物圆环病毒。为研究DogCV中国流行毒株基因组特性和遗传进化,以犬血清样品提取的DNA为模板,采用重叠PCR技术首次获得DogCV中国流行毒株的全基因组序列,命名为JZ98/2014。序列分析表明JZ98/2014全基因组长度为2063nt,编码3个主要开放阅读框:ORF V1(Rep蛋白,303个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,270个氨基酸)和ORF C2(106个氨基酸)。同源性比较显示JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株的全基因组序列同源性为82.1%-89.5%,而Rep和Cap基因同源性分别为82.1%-89.5%和84.6%-89.1%。遗传进化树分析显示,目前世界流行的DogCV存在多个分支,而JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株处于不同分支。; 孙文超曹慧慧郑敏徐素萍张红云韦显凯苏姣秀何杰勇; 关键词：基因进化分析

羊凋亡细胞因子Fas、FasL、TNFR1和TNF-α实时荧光定量检测方法的建立被引量：1: 2018年; 为探讨羊痘病毒感染后机体的凋亡细胞因子mRNA表达水平的变化,深入探讨羊痘病毒免疫机制,本研究设计针对羊凋亡细胞因子Fas、FasL、TNFR1和TNF-α特异性引物,建立羊凋亡细胞因子实时荧光定量方法。分别建立荧光定量PCR反应体系并进行优化。结果表明:Fas、FasL、TNFR1和TNF-α的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR各基因的溶解曲线均呈单一溶解峰。组内变异系数均小于2.00%。本研究建立的羊凋亡细胞因子SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法为凋亡细胞因子mRNA表达水平提供了技术平台。; 易驰喆孙文超汪伟张红云韦显凯韦显凯郑敏闭璟珊; 关键词：SYBR

鸭圆环病毒基因序列测定与分析研究被引量：4: 2012年; 应用PCR方法从临床健康鸭脾脏样品中分段扩增获得鸭圆环病毒(Duck circovirus,DuCV)TD/41/09株全长基因组。测序结果表明,TD/41/09基因组全长为1994bp,含有4个开放阅读框(ORF),其中V1和C1是主要的2个ORF,分别编码Rep蛋白和Cap蛋白;在V1和C1的5′端之间存在与启动滚环复制有关的1个茎环结构和2个正向重复序列。遗传进化分析发现,TD/41/09与Ger(德国分离株)、LZ1109(广西分离株)、MH25(福建分离株)、33753-52(美国分离株)同处一个进化分支,而与PT07(福建分离株)、WS-GD010(广东分离株)和TC1/2002(台湾分离株)关系较远。; 陆文俊施开创邹联斌胡杰莫胜兰屈素洁李军郑敏; 关键词：鸭圆环病毒基因组

广西鸭圆环病毒的流行病学调查被引量：5: 2016年; 为了解广西鸭圆环病毒(Du CV)流行情况,试验采用PCR技术对2010—2014年间采自南宁、柳州、桂林等10个城市活禽市场的2 897份临床健康鸭内脏组织样品进行检测,同时对采自83个鸭群的187份发病或死亡鸭组织样品分别进行Du CV、大肠杆菌(E.coli)、鸭疫里氏杆菌(RA)、禽流感病毒(AIV)、鸭肝炎病毒(DHV)、副黏病毒(AMPV)、鸭坦布苏病毒(DTUMV)检测。结果表明:10个城市均检测出Du CV阳性样品,其平均检出率为8.01%(232/2 897);187份鸭组织样品中Du CV样品阳性率为20.32%(38/187),其中Du CV单纯感染仅占18.42%(7/38),而二重感染和三重感染的比率分别为50.00%(19/38)和31.58%(12/38)。说明Du CV在广西大部分地区鸭群中呈不同程度的流行,感染率逐年升高,且Du CV感染往往造成其他病原继发感染而引起鸭群发病甚至死亡。; 粟艳琼郑敏曹慧慧梁晟张步娴屈素洁莫胜兰; 关键词：PCR 流行病学调查阳性率

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广西省自然科学基金(2012GXNSFAA053073)