陕西省教育厅科研计划项目(12JK0833)
- 作品数：4 被引量：35H指数：3
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- 相关机构：陕西学前师范学院陕西师范大学教育部更多>>
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- 葡萄等植物DFR基因家族生物信息学分析
- 2013年
- 二氢黄酮醇4-还原酶(Dihydroflavonol 4-reductase,DFR)是花青素合成途径的关键酶之一,也是该途径的关键调控位点之一。该文以葡萄DFR家族为例,对多个物种DFR基因及编码蛋白在基因结构、编码氨基酸基本理化性质、疏水性、功能域、亚细胞定位和进化关系等方面进行了比较分析。为葡萄等富含花青素植物中花青素合成及调控研究提供基础资料。
- 化文平
- 关键词：DFR花青素生物信息学葡萄
- 秦艽香叶醇-10羟化酶(G10H)基因的克隆及序列分析被引量：10
- 2013年
- 香叶醇-10羟化酶(geraniol 10-hydroxylase,G10H)是中药秦艽中龙胆苦苷等环烯醚萜苷类成分合成途径的限速酶。本研究克隆了秦艽G10H基因,并对其基因及编码蛋白序列的特征进行了生物信息学分析,结果显示:秦艽G10H基因包含一个完整的长1491bp的ORF框,编码496个氨基酸;GmG10H与长春花、川西樟牙菜等植物G10H蛋白具有很高的同源性(≥69%),无跨膜结构域、信号肽等结构,可能定位于细胞质中。定量PCR结果显示,GmG10H主要在秦艽的花和根中进行表达。
- 化文平王喆之
- 关键词：秦艽高通量测序
- 丹参SmGGPPS3基因的克隆及表达分析被引量：19
- 2014年
- 香叶基香叶基焦磷酸合酶(Geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)是植物细胞二萜类物质合成的重要调节靶点。本研究从药用植物丹参中克隆了一条新的GGPPS基因(SmGGPPS3),基因全长2908 bp,包含一个931 bp的内含子和一个960 bp的编码序列。推测的氨基酸序列与蓖麻、橡胶、拟南芥等植物GGPPS一致性达到67%以上。实时定量PCR结果显示,SmGGPPS3基因在丹参不同发育时期不同器官中表达差异显著,同时受茉莉酸甲酯和病原菌的诱导。遗传互补实验也表明,SmGGPPS3编码蛋白具有GGPP合酶的活性。
- 化文平宋双红智媛王喆之
- 关键词：丹参基因克隆基因表达
- 秦艽HMGR基因家族的克隆及序列分析被引量：8
- 2012年
- 研究克隆了秦艽3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)家族成员的两条基因,并对其序列进行了生物信息学分析.结果显示,两条HMGR基因都包含完整的开放读码(ORF)框,编码蛋白含有HMGR蛋白特有的4个保守的活性位点,与其他植物HMGR蛋白序列具有较高的一致性,都具有跨膜结构域,高级结构类同;GmHMGR1和GmHMGR2分别定位于细胞质膜和线粒体中.表达分析显示,GmHMGR1主要在根和花中表达,而GmHMGR2主要在叶中表达.
- 郑鹏化文平王喆之
- 关键词：秦艽高通量测序
