国家自然科学基金(30860048)
- 作品数：9 被引量：48H指数：4
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- 黄河裸裂尻鱼细胞色素C氧化酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚基基因的克隆及序列特征分析被引量：3
- 2011年
- 采用RT-PCR技术克隆获得了黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)COⅠ、Ⅱ、Ⅲ基因的编码序列,并对此进行了初步分析。结果表明,黄河裸裂尻鱼COⅠ基因全长为1 551 bp,开放阅读框(ORF)由基因全长组成,编码516个氨基酸;COⅡ基因全长为691 bp,开放阅读框为690 bp,编码230个氨基酸;COⅢ基因全长为786 bp,其开放阅读框也是由基因全长组成,编码261个氨基酸。序列同源性分析显示,黄河裸裂尻鱼与其他9种鲤科鱼类3个亚基在基因和氨基酸序列上均有较高的同源性,虽然不同物种亚基基因间存在序列差异,但是所编码的氨基酸序列却趋于一致,揭示了鲤科鱼类细胞色素C氧化酶在线粒体呼吸链电子传递中的功能稳定性。黄河裸裂尻鱼与滇池金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)在COⅠ和COⅡ亚基上均存在相同位置、相同种类和相同数量的功能位点,而且在基于COⅠ亚基基因和氨基酸序列、COⅡ及COⅢ亚基基因序列的系统发育树中聚在同一支上,表明两者具有较近的亲缘关系,该结论与裂腹鱼亚科鱼类起源于晚第三纪广泛分布于青藏地区的喜温性原始鲃类的观点相一致。
- 晁燕祁得林申志新王国杰杨成
- 关键词：系统发育
- 黄河鮈Cytb基因克隆及其在鮈属中的系统发育被引量：2
- 2009年
- 采用聚合酶链式反应克隆黄河鮈线粒体细胞色素b基因(Cytb),首次报道了该基因的全长序列(1140bp,FJ904648),并与鮈属中其他6个物种的Cytb基因进行同源性比较,分析了碱基组成和变异情况,以马口鱼属的马口鱼和鯝属的云南鯝作为外群构建了ML和NJ系统发育树。遗传距离和分子系统学分析表明,黄河鮈与犬首鮈具有较低的遗传距离(6.30%),在系统发育树上两者聚在一起,提示黄河鮈与犬首鮈存在较近的亲缘关系。
- 祁得林杨成
- 关键词：线粒体细胞色素B基因克隆系统发育分析
- 川陕哲罗鲑Cyt b基因克隆及其在鲑亚科中的系统发育关系被引量：5
- 2009年
- 采用聚合酶链式反应克隆川陕哲罗鲑Hucho bleekeri线粒体细胞色素b基因(Cyt b),首次报道该基因的全长序列(1140bp,GenBank登录号FJ597623),并与鲑亚科中其他5属14个物种的Cyt b基因进行同源性比较,分析了碱基组成和变异情况,以白鲑亚科的白鲑Coregonus lavaretus作为外群构建了ML、NJ和MP系统发育树。遗传距离和分子系统学分析表明,川陕哲罗鲑与细鳞鲑属的细鳞鱼Brachymystax lenok之间的遗传距离相对较小(8.47%),在系统发育树上两者聚在一起,提示川陕哲罗鲑与细鳞鱼存在较近的亲缘关系,该结果与以往的形态学分类不相符。
- 祁得林晁燕杨成申志新唐文家
- 关键词：线粒体细胞色素B基因克隆系统发育分析
- 黄河上游花斑裸鲤Cyt b基因的序列变异和遗传多样性被引量：17
- 2009年
- 花斑裸鲤(Gymncypris eckloni)主要分布于黄河上游高原宽谷河段深水缓流处或静水湖泊中,在高原淡水生态系统的食物链中具有重要的地位。本文获得了黄河上游花斑裸鲤5个种群共68个个体线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b基因的全序列(1140bp),分析了序列变异和种群遗传多样性。68个序列经比对后,发现30个(2.63%)多态性位点,共定义了18个单倍型。结果显示,花斑裸鲤种群单倍型多样度和核苷酸多样度均低于其它鲤科鱼类,这可能与青藏高原经所经历的地质变迁和古气候环境的改变有关,由此生活在高原水域中的鱼类或多或少经历过瓶颈效应。AMOVA分析结果显示,遗传差异主要发生在种群之内,而不是来自不同地理组群间或组群内种群间。单倍型网络图和系统发育分析均没有显示出单倍型与地理位置的对应关系,提示黄河上游花斑裸鲤自然种群未出现分化,应作为一个整体进行保护。单倍型歧点分布呈现为单峰以及中性检验Fu’sFs(-15.3400,P<0.001)和Tajima’sD(-0.6254,P=0.3080)结果综合表明,花斑裸鲤可能经历过近期的种群扩张事件。
- 祁得林
- 关键词：线粒体细胞色素B基因种群扩张黄河
- 利用Cyt b基因序列探讨柴达木裸裂尻鱼的分类学地位被引量：11
- 2009年
- 长期以来,柴达木裸裂尻鱼(Schizopygopsis kessleri)的分类学地位存在争议。为此,测定了柴达木裸裂尻鱼格尔木河及托素湖种群24个个体及黄河裸裂尻鱼(S.pylzovi)黄河及大通北川河种群12个个体的Cytb基因全序列。通过遗传距离和系统发育分析,探讨了柴达木裸裂尻鱼的分类学地位。结果显示,柴达木裸裂尻鱼与黄河裸裂尻鱼在系统进化树上并未形成相应的单系群;柴达木裸裂尻鱼与黄河裸裂尻鱼种间平均遗传距离为0.54%,明显低于裂腹鱼亚科其他属鱼类的种间遗传距离及本属其他种间遗传距离,表明来自柴达木盆地格尔木河和托素湖的裸裂尻鱼与黄河裸裂尻鱼之间没有达到种级水平的显著分化。综合地质学资料和柴达木水系与黄河水系现今的隔离格局,建议将柴达木裸裂尻鱼作为黄河裸裂尻鱼的一个亚种,即S.pylzovi kessleri。
- 祁得林李太平晁燕杨成
- 关键词：线粒体细胞色素B基因分子系统学
- 齐口裂腹鱼基于Cyt b基因序列多态性研究被引量：5
- 2010年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法获得了齐口裂腹鱼玛柯河和大渡河2个种群25个个体线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cyt b)基因的全序列(1140 bp),分析了种群遗传多样性和遗传结构。25个序列经比对后,发现12个(1.05%)多态性位点,共定义了8个单倍型,其中有一个单倍型(hp2)为2个种群所共享。遗传多样性分析结果表明,齐口裂腹鱼玛柯河种群的单倍型多样度(h=0.5606±0.1540)和核苷酸多样度(π=0.0007±0.0005)均明显偏低,这可能与近年来自然环境的恶化及人为活动的影响有关。系统发育分析和AMOVA分析结果综合表明,齐口裂腹鱼玛柯河种群与大渡河种群的基因交流受到一定程度的限制,自然种群出现明显的分化现象。
- 晁燕杨成申志新唐文家王国杰祁得林
- 关键词：齐口裂腹鱼线粒体细胞色素B基因基因流
- 混菌发酵降解燕麦秸秆及不同属真菌间的协同和拮抗作用研究被引量：3
- 2011年
- 对四株不同属的真菌进行单独培养及两两混合培养,观察其长势,分别测定其粗酶液的木聚糖酶活性、纤维素酶活性、燕麦秸秆降解能力,比较不同混合菌组合发酵后,菌之间、酶之间存在的协同作用和拮抗作用.试验结果表明:单菌发酵长势优于混菌发酵;单菌FQ7-31、P647生长最佳,组合FQ7-31与P647生长中拮抗作用最强.单菌发酵产木聚糖酶活性明显高于混菌发酵,T537单菌发酵后木聚糖酶活性最高达49.3U/g,组合P647与T537拮抗作用最强,木聚糖酶活性与长势之间呈负相关.单菌发酵后纤维素酶活性明显低于混菌,因此混菌发酵后纤维素酶活性存在着协同作用,协同作用最强的组合是P647与T537.粗酶液对秸秆的降解作用中,FQ7-31与其他三属真菌之间存在着明显的协同作用.发酵120小时后,A3.3567培养基中还原糖产量最高.
- 高海燕谢占玲汤易兰王欢
- 关键词：混菌纤维素酶活性拮抗作用
- 黄河裸裂尻鱼消化道与肝胰脏淀粉酶的分布与特性研究被引量：2
- 2011年
- [目的]探究黄河裸裂尻鱼胃肠道及肝胰脏淀粉酶的分布与特性。[方法]采用碘—淀粉比色法,测定黄河裸裂尻鱼胃、肠道、肝胰脏淀粉酶的活性及其最适反应pH和温度。[结果]黄河裸裂尻鱼淀粉酶活性的大小依次为后肠、前肠、胃、中肠、肝胰脏;胃、肝胰脏、肠道淀粉酶最适pH分别为6.0、7.0、6.0,最适反应温度均为20.0℃。[结论]黄河裸裂尻鱼整个消化道都对淀粉表现出较强的消化能力,尤其是后肠。与其他鱼类相比,黄河裸裂尻鱼淀粉酶最适反应温度偏低,这与黄河裸裂尻鱼所处的生态环境相适应。
- 蒋涛申志新王国杰杨成祁得林
- 关键词：淀粉酶
- 分离自青藏高原七株镰孢菌进化树及其木聚糖酶与酶学性质比较
- 本研究将分离自青藏高原土壤、羊肚菌、及青海湖水样的7株产木聚糖酶的真菌,结合形态学及分子生物学将七株鉴定为镰孢菌属5个种分别为：F.Tricuictum QH101(AccessionNo(JF911785).F.Tri...
- 谢占玲白占菊赵朋余静姚阳春李颖
- 关键词：木聚糖酶酶学性质
- 石爬(鱼兆)属2种鱼线粒体DNA细胞色素b基因序列的比较研究
- 2010年
- 对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(2.54%),其中23个(79.3%)突变位点为转换,6个(20.7%)突变位点为颠换。2种鱼类序列差异偏低,提示分化较晚,致使物种间在Cyt b基因上未能积累丰富的碱基变异。黄石爬(鱼兆)遗传多样度较低,可能与其栖息环境的改变有关。
- 杨成晁燕申志新祁得林唐文家王国杰
- 关键词：系统发育
