江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金(2006HS001)
- 作品数：2 被引量：19H指数：2
- 相关作者：董志国孟学平程汉良彭永兴夏德全更多>>
- 相关机构：淮海工学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏省海洋水产研究所更多>>
- 发文基金：江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金国家科技重大专项江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 帘蛤科4种养殖蛤群体遗传多样性和种间关系的fAFLP分析被引量：10
- 2008年
- 利用荧光标记扩增片段长度多态性（fAFLP）技术对文蛤（Meretrix meretrix）、青蛤（Cyclina sinensis）、菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）和硬壳蛤（Mercenaria mercenaria）4种帘蛤科贝类的群体遗传多样性和种间关系进行了研究。选择EcoRⅠ／MseⅠ进行酶切，使用6个E＋3／M＋3引物组合进行扩增，共获得1096个位点，多态位点比率95．1％，片段长度50-456bp。其中，文蛤、青蛤、菲律宾蛤仔和硬壳蛤分别得到681，715，702和694个位点，相应的多态位点比率为76．8％，81．7％，83．0％和75．1％，得到17个种特异性位点，可作为4物种特征标记。分析了群体遗传相似系数和遗传多样性指数以及种间遗传相似系数。结果表明，硬壳蛤群体遗传相似系数最高（0．6709），遗传多样性指数最低（0．2360）；菲律宾蛤仔群体遗传相似系数最低（0．5925），遗传多样性指数最高（0．2618）；根据遗传相似系数采用UPGMA法构建了4物种32个体的聚类图，表明文蛤与菲律宾蛤仔遗传关系最近，青蛤与其他3物种遗传关系较远。
- 彭永兴程汉良夏德全吴婷婷孟学平吉红九董志国
- 关键词：物种鉴定
- 6种帘蛤科贝类18SrRNA基因全序列比较分析
- 帘蛤科(Veneridae)在传统分类上隶属于软体动物门(Mollusca)、双壳纲(Bivalvia)、帘蛤目(Venerioda)。帘蛤科是双壳贝类中最大的一个科,约有500多种,广泛分布于世界海域,是潮间带区系的优...
- 程汉良彭永兴孟学平阎斌伦董志国
- 关键词：帘蛤科分子系统发育
- 文献传递
- 6种帘蛤科贝类18S rRNA基因全序列比较分析被引量：9
- 2008年
- 对文蛤（Meretrix meretrix）、青蛤（Cyclina sinensis）、江户布目蛤（Protothaca jedoensis）、薄片镜蛤（Dosinia corrugata）、紫石房蛤（Saxidomus purpuraus）和菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）6种帘蛤科（Veneridae）贝类的18S rRNA基因序列进行了PCR扩增并测序,以期获得这一序列的基本特征,评估其种间变异程度,探讨这一序列在种类鉴定和分子系统发育等研究中的应用价值。测序结果表明,文蛤、青蛤、江户布目蛤、薄片镜蛤、紫石房蛤和菲律宾蛤仔18S rRNA基因序列全长分别为1900bp、1838bp、1831bp、1831bp、1829bp和1833bp。序列中A、T、C和G碱基的平均含量分别为24.0%、24.0%、24.2%和27.8%。用MEGA软件对6种帘蛤18S rRNA基因全序列进行了分析,对位排列后的总长度1 906 bp,其中变异位点210个,简约信息位点28个,si/sv=1.4（46/32）。从GenBank下载了7种帘蛤科贝类18S rDNA全序列,与本研究实测的6种帘蛤一起用MegAlign软件对其18S rDNA序列进行了比对,物种间序列相似百分比为88.7%-99.7%。文蛤与其他12物种间序列差异较大,序列差异百分比均超过了10%,其他各物种间序列差异百分比不超过3%。以异韧带亚纲（Anomalodesmata）笋螂目（Pholadomyoida）的Lyonsia floridana和Cardiomya costellata为外群,采用相邻连接法（NJ）和最大简约法（MP）构建了帘蛤科贝类的系统发育树,其拓扑结构显示雪蛤亚科（Chioninae）、帘蛤亚科（Venerinae）和镜蛤亚科（Dosiniinae）的种类首先聚在一起,形成一个聚类簇;缀锦蛤亚科（Tapetinae）、卵蛤亚科（Pitarinae）、仙女蛤亚科（Callistinae）、青蛤亚科（Cyclininae）和文蛤亚科（Meretricinae）的种类先后分别单独聚成一枝;最后所有帘蛤科物种聚为一枝,与外群相区别,说明18S rDNA序列适合作为帘蛤科系统发育研究的分子标记。
- 程汉良彭永兴王芳孟学平阎斌伦董志国
- 关键词：帘蛤科RRNA基因分子系统发育
