中美新发和再发传染病合作项目(U10-GH000004)
- 作品数：6 被引量：26H指数：4
- 相关作者：付士红梁国栋李铭华冯云姜红月更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心云南省地方病防治所江西省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：中美新发和再发传染病合作项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2009年江西省新分离流行性乙型脑炎病毒株全基因组分子生物学特性研究被引量：2
- 2010年
- 目的对2009年分离自江西省蚊虫标本的流行性乙型脑炎(乙脑)病毒JX0939株进行全基因组序列测定,分析其基因组特征。方法使用针对乙脑病毒全基因组测序引物进行PCR扩增基因组片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因组序列。利用生物信息学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒JX0939株基因组全长10965个核苷酸,从97位到10392位,共10296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸。与GenBank中登录的所有59株乙脑病毒全基因组序列比较发现,其核苷酸总体差异率为1%～17%,氨基酸总体差异率为0.1～5%。与目前使用的减毒活疫苗株SA-14-14-2株相比较,只有88%的核苷酸同源性,全基因组共存在1237个核苷酸差异,83个氨基酸差异。提取GenBank登录的及本实验室测定的不同省份的乙脑病毒全基因组序列,进行全基因组序列系统进化分析显示JX0939株属于基因1型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒JX0939株属于基因1型,与2007年中国分离株SH17M-07进化关系最接近,与疫苗株SA-14-14-2相比关键位点氨基酸未见变异。
- 王力华李铭华付士红姜红月陈维欣唐松戴新平应彩霞詹漫华施勇梁国栋
- 关键词：乙型脑炎病毒全基因组系统进化分析
- 辽宁省丹东市鸭绿江沿岸2007年虫媒病毒分离鉴定
- 2012年
- 目的了解辽宁省丹东市鸭绿江沿岸虫媒病毒的种类和分布情况。方法使用诱蚊灯捕蚊,通过组织培养法分离病毒,并对病毒分离物进行血清学和分子生物学鉴定。结果 2007年7月在辽宁省丹东市鸭绿江沿岸6个采集点采集到3属3种共3359只蚊虫标本,从中分离到11株病毒分离物,鉴定结果显示有5株为版纳病毒,3株为环状病毒样病毒,其余3株分离物有待进一步鉴定;版纳病毒新分离株序列分析结果显示,5株版纳病毒之间第12片段序列高度同源,核苷酸同源性为92.1%～99.8%;氨基酸同源性为92.8%～99.5%;并且与北京分离株和云南分离株同源性较高,核苷酸同源性为91.3%～98.7%;氨基酸同源性为90.8%～100%;系统进化分析提示,版纳病毒新分离株与北京、云南分离株位于同一个进化分支中。结论在辽宁省丹东市鸭绿江沿岸首次分离到版纳病毒和环状病毒样病毒,新分离版纳病毒与北京、云南分离株进化关系较近。
- 孟维珊孟维珊李铭华付士红张稷博陈哲丁俊丁俊
- 关键词：虫媒病毒种系发生
- 贵州省不同地区2008年虫媒病毒调查被引量：10
- 2012年
- 目的调查贵州省不同地区虫媒病毒分布状况,对采集的蚊虫标本进行病毒分离与鉴定。方法 2008年7月在贵州省黔西、德江、榕江和从江县的4个标本采集点使用诱蚊灯采集蚊虫标本,通过组织培养法分离病毒,并对病毒分离物进行血清学和分子生物学鉴定;利用生物信息学技术对新分离病毒的序列进行分析,完成同源性和系统发生分析。结果采集到3属4种共计9160只蚊虫标本,从中分离到9株病毒,鉴定结果显示8株为盖塔病毒,1株为流行性乙型脑炎病毒(JEV);贵州省新分离盖塔病毒与原型株相比,核苷酸同源性为94.5%～94.9%,氨基酸同源性为97.4%～97.6%;新分离JEV与基因Ⅰ型JEV的同源性最高,系统进化分析结果显示属于基因Ⅰ型JEV。结论在贵州省分离到盖塔病毒和基因Ⅰ型JEV。盖塔病毒新分离株与我国其他省份分离株进化关系较近;JEV新分离株与四川省分离株进化关系较近。
- 李铭华付士红冯云叶绪芳赵苏晔刘淳婷梁国栋
- 关键词：虫媒病毒盖塔病毒流行性乙型脑炎病毒种系发生
- 江西省流行性乙型脑炎病毒的分离与鉴定被引量：4
- 2012年
- 目的调查江西省的虫媒病毒分布状况,在当地采集蚊虫标本进行病毒分离与鉴定。方法 2008-2009年夏季在江西省共选择8个标本采集点,使用诱蚊灯采集蚊虫标本,通过组织培养法分离病毒,并对病毒分离物进行血清学和分子生物学鉴定;利用生物信息学技术对新分离病毒的序列进行分析,完成同源性和系统发生分析。结果 2008年采集到3属3种共计11916只蚊虫标本;2009年采集到4属5种共计5905只蚊虫标本;共分离到4株病毒,经鉴定均为流行性乙型脑炎(乙脑)病毒;新分离乙脑病毒与基因Ⅰ型乙脑病毒的同源性最高,系统进化结果显示,4株乙脑病毒均属于基因Ⅰ型。结论在江西省分离到基因Ⅰ型乙脑病毒,与上海市和浙江省分离株进化关系较近。
- 李铭华付士红姜红月陈维欣唐松施勇梁国栋
- 关键词：虫媒病毒流行性乙型脑炎病毒种系发生
- 在内蒙古蚊虫中分离到版纳病毒被引量：8
- 2009年
- 目的鉴定内蒙古通辽市分离的虫媒病毒。方法使用血清学及分子生物学方法鉴定内蒙古蚊虫标本分离的病毒，对毒株的部分核苷酸序列进行测定，应用Clustal X软件做碱基配对分析，MEGA软件完成病毒进化分析，DNAStar软件包中的MegAlign完成核苷酸和氨基酸同源性分析。结果在内蒙古通辽市采集凶小库蚊标本分离的病毒经过血清学和分子生物学实验鉴定为版纳病毒（Banna virus，BAV），与版纳病毒部分中国分离株位于同一进化分支中，病毒第12片段核苷酸同源性为89．6％～98．4％，氨基酸同源性为90．4％～98．6％。结论在内蒙古凶小库蚊标本中分离到版纳病毒。
- 曹玉玺付士红田兆丰何英王焕琴王环宇杨红梅涛波梁国栋
- 关键词：种系发生
- 2008年甘肃省部分地区虫媒病毒调查被引量：4
- 2010年
- 目的调查甘肃省部分地区虫媒病毒分布状况,为虫媒病毒病防治提供依据。方法2008年7-8月在甘肃省嘉峪关、张掖、酒泉、白银和平凉市采集蚊虫标本,用细胞培养法分离病毒,用血清学和分子生物学方法对病毒分离物进行鉴定;利用生物信息学技术对新分离病毒的序列进行同源性和系统发生分析。结果采集到3属280批共13839只蚊虫标本,从中分离到6株病毒,血清学和分子生物学鉴定结果显示6株病毒(GSBY0801、GSBY0804、GSBY0810、GSBY0816、GSBY0827、GSBY0861)均为基因Ⅰ型乙脑病毒。新分离株与减毒活疫苗株SA14-14-2相比,E基因核苷酸同源性为87.5%～87.9%,氨基酸同源性为96.8%～97.2%。结论甘肃省东部地区存在基因Ⅰ型乙脑病毒的流行,流行病毒株与中国四川省乙脑病毒分离株进化关系较近。
- 李铭华付士红冯云高晓艳翟友刚于德山李国太贾玉新梁国栋
- 关键词：虫媒病毒乙型脑炎病毒种系发生
