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基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系: 2013年; 在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P450 1A2抑制剂的两变量线性QSAR模型,结果表明:所选的2个分子结构描述符与50个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系(相关系数r2=0.907 0)和内部预测能力(留多法交叉验证相关系数q2=0.751 7)。同时,将50个化合物分成奇数集和偶数集各自进行筛选建模,并彼此进行外部预测,对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了y-Randomization检验,结果表明描述符EHOMO和Vm建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。; 易忠胜叶廷文刘红艳莫凌云; 关键词：细胞色素P450 抑制剂定量结构-活性相关

基于对接的植物激素3D-QSAR和分子动力学模拟被引量：2: 2014年; 采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究植物雌激素类化合物与雌激素受体的相互作用机制,对接结果表明,雌激素受体活性位点的疏水和氢键作用是影响植物雌激素化合物活性的主要原因,植物雌激素类化合物主要与氨基酸残基GLU353、ARG394、HIS524和LEU525之间形成氢键.然后以对接后的分子构象进行分子结构叠合,结合比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法建立了3D-QSAR模型.CoMFA模型的交叉验证相关系数(Q2)和非交叉验证相关系数(R2)值分别为0.676和0.994,标准估计误差SEE和F统计量分别为0.143和342.115;CoMSIA模型的Q2=0.565,R2=0.972,SEE=0.286和F=111.480.结果表明,CoMFA和CoMSIA模型具有良好的稳定性和预测能力,可为植物雌激素的雌激素效应研究提供有力的支持.采用MD模拟研究了小分子和受体蛋白的动力学情况,为对接结果的合理性提供了验证.; 蒙延娟易忠胜艾芳婷张爱茜; 关键词：植物雌激素三维定量构效关系比较分子力场分析分子动力学模拟

2,3,3'-三氯联苯与人血清白蛋白之间相互作用的计算模拟及光谱研究: 2014年; 利用分子对接、分子动力学模拟、荧光光谱、紫外光谱及同步荧光光谱法研究了2,3,3'-三氯联苯(PCB-20)与人血清白蛋白(HSA)的相互作用。分子对接结果表明,PCB-20与HSA通过疏水作用力稳定结合于HSA的疏水空腔内。光谱法实验结果表明,PCB-20通过与HSA形成HSA-PCB20复合物从而对HSA具有荧光猝灭作用,猝灭原因是静态猝灭和非辐射能量转移,热力学参数也表明两者结合的主要驱动力为疏水作用力,计算模拟与实验结果吻合度较高。分子动力学模拟结果表明,PCB-20能够与HSA稳定结合,且与同步荧光光谱实验共同证明其对HSA的构象变化产生了一定影响。; 艾芳婷易忠胜蒙延娟张爱茜; 关键词：HSA 分子对接分子动力学模拟光谱法

环境雄激素的QSAR研究基于变量相互作用的变量筛选新方法应用: 本文采用E-dragon描述子表征146个结构多样的天然、合成和环境污染化合物分子结构,以基于变量相互作用的变量筛选方法(VSMVI)结合留多法交互验证选择最优子集,分别建立了146和118个化合物雄激素效应的7变量多元...; 易忠胜艾芳婷徐铭泽刘红艳莫凌云张爱茜; 关键词：雄激素定量结构活性相关; 文献传递

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环境化学与生态毒理学国家重点实验室开放基金(KF2011-21)