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甲基苯并唑衍生物与HIV-1逆转录酶相互作用的分子模拟研究: 2012年; 对HIV-1逆转录酶(RT)与二氟甲基苯并唑甲基嘧啶硫醚(DFMMT)及甲基苯并唑甲基嘧啶硫醚(MMT)两个甲基苯并唑衍生物的复合物进行了分子动力学模拟,从分子整体、结合模式优化和水分子作用3个角度详细分析了甲基苯并唑衍生物与HIV-1 RT相互识别的机制。结果表明,DFMMT和MMT在RT中的结合位点几乎一致;但DFMMT与RT的π-π堆积作用更强。另外,RT的DFMMT结合口袋中有3个稳定的水分子存在,而MMT结合则没有水分子参与。3个水分子的协同使得DFMMT与RT的相互作用强于MMT,这可能是双氟促进抑制活性的作用机制之一。; 胡建平唐典勇孙国峰成英常珊; 关键词：HIV-1逆转录酶分子动力学模拟抑制活性

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教育部科学技术研究重点项目(211159)