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云南省教育厅科学研究基金(2012J074)
作品数:
4
被引量:17
H指数:2
相关作者:
郭文
郭华春
贾振华
肖继坪
白磊
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相关机构:
云南农业大学
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AFLP标记
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PSBA-T...
机构
4篇
云南农业大学
作者
4篇
郭华春
4篇
郭文
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李婉琳
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白磊
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西北植物学报
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2014
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4种薯蓣属植物的分子鉴别和亲缘关系研究
被引量:1
2014年
为揭示薯蓣属植物的亲缘关系,根据叶绿体matK、rbcL、trnL-F和psbA-trnH序列片段,对小花盾叶薯蓣(Dioscorea sinopatviflora)、盾叶薯蓣(D. zingibiernsis)、黄独(D. bulbifera)和山药(D. polystachya)进行种间分子鉴别研究,并探讨这4个片段在薯蓣属植物系统发育上的意义。结果表明,4种薯蓣属植物共22份材料的matK、rbcL、trnL-F和psbA-trnH序列片段的长度分别为1026-1142 bp、1156-1178 bp、744-822 bp和355-599 bp。用PAUP 4.0b10和贝叶斯推断构建的系统发育树分析表明,云南的黄独与盾叶薯蓣的亲缘关系较近;小花盾叶薯蓣与盾叶薯蓣的亲缘关系很近;而非洲的黄独与云南的黄独的亲缘关系很远。但仅用这4个cpDNA片段还不能完全区分小花盾叶薯蓣和盾叶薯蓣,这说明基于这4个序列片段的系统发育证据与4种薯蓣属植物属内的分类划分并不十分吻合。
郭文
郭华春
关键词:
薯蓣属
分子鉴别
亲缘关系
四种薯蓣属植物的SSR分析
被引量:6
2014年
本研究利用SSR分子标记研究薯蓣属(Dioscorea L.)四种植物:盾叶薯蓣(D.zingibiernsisC.Hwright.)、小花盾叶薯蓣(D.sinoparviflor0C.T.Ting)、黄独(D.bulbireraL.)和山药薯蓣(D.oppositaThunb)的遗传变异及亲缘关系,从21对引物中筛选出多态性在54.55%以上的引物11对。再利用这11对引物对17份分别为这四种薯蓣植物材料的基因组DNA进行扩增,共扩增出138条带,其中多态性条带数为136条,平均多态性比率为98.55%,参试材料的相似系数为0.41~0.90,平均相似系数为0.63。各样品间的遗传相似系数经UPGMA聚类分析,结果发现盾叶薯蓣与山药之间、小花盾叶薯蓣与盾叶薯蓣、盾叶薯蓣与黄独的平均相似系数分别为0.56、0.53和0.47。结果表明,四种植物的亲缘关系:盾叶薯蓣与山药较近,其次是小花盾叶薯蓣,最远是黄独。
郭文
黄贤兰
郭华春
关键词:
薯蓣属
SSR标记
利用AFLP标记构建4种薯蓣属植物的指纹图谱
被引量:9
2015年
本研究采用12对引物对4种薯蓣属(Dioscorea)植物,小花盾叶薯蓣(D.sinopatviflora C.T.Ting.)、盾叶薯蓣(D.zingibiernsis C.H Wright.)、黄独(D.bulbifera L.)和山药(D.polystachya Turczaninow)共22份材料进行AFLP多态性分析并构建指纹图谱。4种薯蓣属植物的22份材料种间及种内多态率分别为100%、84.06%、99.08%、72.87%和98.79%,表明4种薯蓣属植物种间、种内均存在较大差异。各样品间的遗传相似系数经UPGMA聚类分析,当遗传相似系数为0.76时分为两个大支,即小花盾叶薯蓣与盾叶薯蓣聚为一个大支;黄独与山药聚为一个大支。利用918个AFLP标记片段组合构建供试材料的指纹图谱数据库,为追踪薯蓣属植物血缘在野生种及栽培株系种的传递情况及这些植物材料在育种中的进一步利用提供科学依据。
郭文
李婉琳
肖继坪
白磊
贾振华
龙雯虹
郭华春
关键词:
薯蓣
AFLP
DNA指纹图谱
4种薯蓣属植物的psbA-trnH片段序列分析
被引量:2
2013年
对4种薯蓣属(Dioscorea)植物——小花盾叶薯蓣(D.sinoparviflora C.T.Ting.)、盾叶薯蓣(D.zingiberensis C.H Wright.)、黄独(D.bulbifera L.)和薯蓣(D.polystachya Turczaninow)共22个植物类群的叶绿体psbA—trnH基因区进行PCR扩增并测序,获得了该区间的完整序列,小花盾叶薯蓣的psbA—trnH片段全长589~593bp,盾叶薯蓣全长为575~599bp,黄独全长为372bp,薯蓣全长为355~368bp。将所得序列用Bayesian推断其系统发育关系,结果发现psbA—trnH片段不能够完全区分4种薯蓣属植物种间和种内的各个分类群(不同产地),且不能区分盾叶薯蓣与小花盾叶薯蓣;推测薯蓣的演变过程可能与人工驯化有关,黄独与栽培薯蓣的亲缘关系较近,而与野生薯蓣的亲缘关系较远。
郭文
郭华春
关键词:
薯蓣
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