河北省科学技术研究与发展计划项目(07276101D-114)
- 作品数：3 被引量：12H指数：3
- 相关作者：韩占英张艳波许永刚李琦齐顺祥更多>>
- 相关机构：河北省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：河北省科学技术研究与发展计划项目河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 河北省鼠携带汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析被引量：9
- 2009年
- 目的了解河北省肾综合征出血热（HFRS）疫源地宿主动物所携带汉坦病毒的基因型和基因亚型。方法根据76-118株和R22株的保守序列设计型特异性引物，用RT—nestedPCR从IFA筛选的阳性鼠肺中扩增部分M片段，经琼脂糖凝胶电泳进行基因分型，并从中选取部分扩增产物纯化回收后进行核苷酸序列测定，用DNAStar软件包进行基因分析。结果32份经IFA筛选阳性的鼠肺标本经RT-nestedPCR扩增出d18bp特异性目的片段，均为SEO型。10份扩增产物测序结果表明G2片段变异不大，同源性高达98．0％～100％，与R22株和76—118株的同源性分别为93．3％～94．3％和67．7％～69．0％。结论依据G2片段，河北省HFRS疫源地汉坦病毒基因型以SEO型病毒为主，主要为S3亚型，同亚型病毒基因高度同源，遗传物质相对稳定。不同鼠种可携带同亚型汉坦病毒。
- 黄晓霞李琦韩占英张艳波魏亚梅许永刚
- 关键词：汉坦病毒基因型逆转录聚合酶链反应
- 河北省肾综合征出血热主要流行区鼠携带汉坦病毒基因序列分析被引量：5
- 2013年
- 目的了解河北省肾综合征出血热（haemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS）主要流行区汉坦病毒主要流行株的基因型及其变异情况。方法收集2012年河北省东北部地区捕获的啮齿动物,均为褐家鼠,取鼠肺组织,用间接免疫荧光法（indirect immunofluorescence assay,IFA）检测,抗原阳性的标本进行汉坦病毒（Hantavirus,HV）M部分片段扩增并测序,与该地区以往序列及其他部分标准株进行系统发生树及同源性分析。结果收集164份鼠肺标本,经IFA检测26份阳性,挑选9份有代表意义的标本进行逆转录巢式PCR扩增,9份鼠肺标本经RT-PCR检测均为汉城（SEO）型HV,病毒间变异不大,同源性达95.2%~100.0%。以往测序株与新测序株比较同源性为99.0%~100.0%。系统发生树分析结果表明9份标本均为SEO型HV,且为S3亚型。结论河北省HFRS主要流行区HV以SEO型为主,亚型为S3亚型。同型HV基因相对保守,具有区域稳定性特征。
- 魏亚梅韩旭韩占英张艳波许永刚齐顺祥李琦
- 关键词：汉坦病毒肾综合征出血热PCR系统发生树
- 河北省人感染汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析被引量：4
- 2008年
- 目的了解河北省人感染汉坦病毒的基因型和基因亚型。方法根据76-118株和1122株的G2编码区设计型特异性引物，利用RT-nestedPCR技术对采集的HFRS患者中汉坦病毒抗体阳性的血清标本进行检测及基因分型，从中选取部分标本的扩增产物纯化回收后进行核苷酸序列测定，用DNAStar软件包进行基因分析。结果69份阳性血清标本经RT-nested PCR检测17份阳性，检出率为24．64％，其中≤7d的标本检出率为34．29％，8-14d的检出率为19．23％，≥14d的未能检出。17份阳性标本均为SEO型。对其中9份扩增产物的G2区测序后表明，9份血清标本的同源性为92．0％-100．0％，其中HeB7与其他8份标本的同源性为92．0％。95．0％，属不同亚型，与1122的同源性为97．7％，同属于S1亚型；除HeB7外其余8份标本同源性高达95．7％-100％，同属于S3亚型。9份标本与76-118株的同源性仅为70．3％-72．7％。结论河北省人感染汉坦病毒以SEO型为主，亚型以S3为主，也存在S1亚型。在一定范围内，同型汉坦病毒基因相对保守，具有区域稳定性特征。
- 李琦魏亚梅韩占英张艳波齐顺祥许永刚
- 关键词：汉坦病毒基因型逆转录聚合酶链反应
