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湖南省研究生创新基金(CX2009B159)
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
相关作者:
陈延伟
谭晓风
王楚正
何伟
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立命馆大学
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湖南省研究生创新基金
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陈延伟
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2010
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基于PCA和BP神经网络的O—糖基化位点的预测和模式分析
被引量:3
2010年
糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一。传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增加了计算运行成本。为了解决这一问题,提出了主成分分析和BP神经网络相结合的新方法对O—糖基化位点进行预测和分析,用PCA提取主成分构造子空间以降低输入的蛋白质序列的维数,再用BP神经网络预测一个特定的蛋白质序列是否被糖基化。实验表明,提出的新方法能大大缩短计算时间,并能提高预测的准确性。
王楚正
谭晓风
陈延伟
何伟
关键词:
主成分分析
BP神经网络
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