国家自然科学基金(81100619)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
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- 相关机构：南京医科大学南京医科大学第二附属医院更多>>
- 发文基金：南京市科技发展计划项目国家自然科学基金江苏省自然科学基金更多>>
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- 人miR-146b慢病毒载体构建及人脂肪细胞中表达验证
- 2013年
- 目的构建人miR-146b慢病毒表达载体,包被病毒并检测其在人脂肪细胞中过表达效果。方法以人基因组DNA为模板,PCR高保真扩增包含miR-146b区域上下游各100bp左右的基因组DNA,亚克隆入慢病毒表达载体,与包装质粒共转染HEK-293T细胞,包装病毒,收取病毒上清,纯化后感染人脂肪前体细胞,36h开始观察荧光标记,72h收取细胞,抽提RNA,Realtime PCR检测慢病毒感染下miR-146b的相应表达量。结果成功构建人miR-146b慢病毒表达载体,包装获得的病毒感染人脂肪细胞的效率可达到85%以上,miR-146b过表达水平可接近4倍。结论本研究成功构建了人miR-146b慢病毒表达载体,包被的慢病毒可以在人脂肪细胞中实现过表达效果,为后续功能研究奠定了基础。
- 陈玲史春梅杨蕾朱璐徐广峰季晨博郭锡熔张春梅
- 关键词：慢病毒
- miR-146b靶标预测及功能分析被引量：2
- 2013年
- 目的通过对miR-146b进行系统的生物信息学分析,预测miR-146b的靶基因及其功能。方法应用miRBase获取并分析miR-146b的序列特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测miR-146b的靶基因,进行功能注释和信号转导通路分析;应用PubMed、Google等信息搜索工具综述miR-146b已有功能研究。结果 miR-146b在各物种之间具有高度保守性。功能注释显示预测靶基因主要富集于促细胞增殖、转录调控、调控细胞分化等生物学过程。信号转导通路分析显示预测靶基因显著富集于白血病、ErbB信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶通路等。结论生物信息学分析提示,miR-146b可能与细胞分化、代谢密切相关。
- 朱玲玲史春梅徐广峰张春梅陈玲季晨博郭锡熔鲁一兵
- 关键词：MIRNA生物信息学
