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国家大宗蔬菜产业技术体系建设项目(CARS-25-G-16): 作品数：11 被引量：111H指数：7; 相关作者：阮美颖杨悦俭王荣青周国治姚祝平更多>>; 相关机构：浙江省农业科学院南京农业大学浙江师范大学更多>>; 发文基金：国家大宗蔬菜产业技术体系建设项目国家自然科学基金浙江省自然科学基金更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

浙江省2010-2011年番茄品种比较试验被引量：4: 2012年; 针对目前番茄黄化曲叶病毒病发生严重,2010-2011年选择6个番茄品种在浙江省进行多点品种比较试验,根据植株、果实、产量等性状指标,番茄品种浙杂502表现较好。; 姚建平王荣青周国治叶青静阮美颖姚祝平杨悦俭吴志伟; 关键词：番茄

番茄查尔酮合成酶基因的鉴定及生物信息学分析被引量：15: 2013年; 类黄酮(Flavonoids)是植物体内一类重要的次生代谢产物,它以结合态(黄酮苷)或自由态(黄酮苷元)形式存在于水果、蔬菜、豆类和茶叶等许多植物中,对植物的生长发育有着重要的调节作用。查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS,EC2.3.1.74)是植物类黄酮合成途径的第一个关键酶,在调控类黄酮的生物合成以及类黄酮的成分起着决定作用。本研究基于番茄全基因组测序数据,利用生物信息学方法,鉴定了查尔酮合成酶基因家族成员,分析其内含子-外显子的结构特征、系统发育关系,序列结构的保守性以及染色体上的分布。研究表明:查尔酮合成酶(SlCHS)是含有8个成员的多家族基因,蛋白质序列编码位于160(SlCHS05)～438(SlCHS08)个氨基酸之间;相似性在33.7%(SlCHS02和SlCHS06)～92.0%(SlCHS04和SlCHS07)之间,表明这些序列之间具有较高的遗传多样性;此外,结构分析发现这些基因均含有较少的内含子(0～2个);序列比对表明这些基因具有较高的保守性;它们不均匀分布在番茄的1、5、6、9和12号染色体上。该研究不仅有助于未来了解该基因家族的进化起源提供参考,而且可为我们进一步分析该基因家族成员的功能奠定基础。; 阮美颖万红建叶青静王荣青姚祝平周国治俞锞袁伟刘云飞杨悦俭; 关键词：番茄查尔酮合成酶生物信息学

番茄热激蛋白90的全基因组鉴定及分析被引量：16: 2014年; 热激蛋白90（Heat shock protein 90，Hsp90）是植物应对不良环境胁迫产生的一类特定的抗逆蛋白。文章以番茄（Solanum lycopersicum L.）基因组数据为平台，借助生物信息学方法对Hsp90基因家族进行鉴定与分析。结果表明，番茄至少含有7个Hsp90基因，不均匀分布在6条染色体上，氨基酸序列长度为267~794aa，内含子数目为2~19；共线性分析发现两对基因（Hsp90-1和 Hsp90-3，Hsp90-5和 Hsp90-7）以片段重复形式存在。MEME（Multiple Em for Motif Elicitation）分析显示，番茄Hsp90基因编码的氨基酸序列具有多个保守基序；聚类分析揭示番茄、水稻（Oryza sativaL.）和拟南芥（Arabidopsis thaliana L.）Hsp90基因可以分为5组，存在3对直系同源基因和4对旁系同源基因；基于RNA-seq数据库表达分析发现，3个基因（Hsp90-5、Hsp90-6和Hsp90-7）在营养器官和生殖器官中表达量较高，4个基因（Hsp90-1、Hsp90-2、Hsp90-3和Hsp90-4）除在番茄转色后10 d的果实中表达量较高外，其余组织中表达量均较低；对Hsp90基因启动子序列进行分析，发现了多个参与植物对逆境胁迫的顺式作用元件，如 HSE、CCAAT-box。此外，qRT-PCR 检测结果表明，在叶片热胁迫条件下，番茄Hsp90基因的表达量均存在增强趋势，表明这些基因参与了番茄叶片应对高温胁迫的反应。研究结果为鉴定番茄Hsp90基因的功能和进化起源奠定了基础。; 刘云飞万红建杨悦俭韦艳萍李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治; 关键词：番茄热激蛋白基因重复

微卫星DNA标记在番茄亲子鉴定中的应用被引量：2: 2011年; 采用242对微卫星DNA标记引物分析了29份番茄自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的34对引物,34对引物的平均等位基因数为4.53,平均多态信息量(PIC)为0.5141,累积鉴别力(CDP)达0.999999。利用其中的11对SSR引物对杂交种‘浙杂210’、母本‘01-199-1-1-0’及7个疑似父本进行了亲子鉴定。结果表明,11个分子标记的三联体累积非父排除概率(CPE1)达0.9999999;二联体累积非父排除概率(CPE2)达0.999984,‘01-230’的累计PI达5024.3946,RCP为0.9998,大于99.73%,鉴定出‘01-230’是杂交种‘浙杂210’的真实父本。说明所选34对引物可用于番茄亲权鉴定,其判断成功率和准确率较高,结果可靠。; 姚祝平叶青静王荣青阮美颖周国治万红建杨悦俭; 关键词：番茄微卫星引物亲子鉴定

番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析被引量：23: 2014年; NBS-LRR(nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat)是植物中最大类抗病基因家族之一。番茄基因组测序完成为全基因组水平上分析NBS-LRR抗病基因家族提供了机遇。利用生物信息学方法对番茄NBS-LRR抗病基因家族成员数目进行鉴定,并对其染色体定位和系统发育关系进行了分析。随后,将番茄和马铃薯NBS-LRR抗病基因进行了比较基因组学分析。结果表明:番茄基因组共包括252个NBS-LRR抗病基因,分布于番茄12条染色体上;63.5%的基因成簇存在,大部分为串联重复;系统发育关系分析表明番茄CC-NBS-LRR(CNL)亚家族较其他亚家族扩展程度大;同线性分析发现番茄中共79个NBS-LRR抗病基因与马铃薯基因具有同源关系。结果将为番茄NBS-LRR抗病基因家族的深入研究提供依据,同时也为利用番茄NBS-LRR基因进行基因定位以及相关抗病基因克隆等奠定基础。; 刘云飞万红建韦艳萍李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治杨悦俭; 关键词：番茄 NBS-LRR 抗病基因

WRKY转录因子在植物逆境应答中的功能被引量：11: 2016年; WRKY转录因子是高等植物中最重要的转录因子基因家族之一,在植物应对生物胁迫(病原菌和病毒等)和非生物胁迫(干旱,盐害,冷害和热害等)等一系列逆境应答进程中发挥重要作用。目前高等植物中WRKY转录因子在调控植物应答生物胁迫和非生物胁迫中的相关功能进行了总结。在目前已经报道的WRKY转录因子功能基础上,分析了不同植物中WRKY转录因子的的逆境应答模式和功能特征,为未来探索作物WRKY转录因子的逆境应答调控机理奠定基础。; 程远姚祝平阮美颖李志邈叶青静王荣青周国治杨悦俭万红建; 关键词：植物 WRKY转录因子胁迫应答

番茄SBP基因家族的全基因组鉴定、结构特征及表达分析被引量：10: 2013年; SBP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导。为了揭示番茄SBP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定番茄SBP转录因子家族,分析其结构特征,系统发育关系以及表达模式。结果表明,番茄全基因组共编码17个SBP转录因子成员,分布在8条染色体上;系统发育关系表明SBP基因家族的结构特征变异发生在番茄、拟南芥和水稻分化之前;且它们在番茄、拟南芥和水稻中按照物种特异性的方式进行了扩张。不同芯片分析发现,SlSBP03基因在番茄叶片、子叶和下胚轴中表达量较高,SlSBP13基因果肉中表达量较高,这两个基因在果皮和根中表达量都较低;在大多数非生物胁迫处理条件下,SlSBP11、SlSBP13和SlSBP16的表达量均较低;而SlSBP01基因在干旱和热处理条件下有较高的表达量。; 万红建袁伟俞锞刘云飞李志邈叶青静王荣青阮美颖周国治姚祝平杨悦俭; 关键词：番茄生物信息学水稻拟南芥

TaqMan探针实时荧光定量PCR检测番茄黄化曲叶病毒被引量：3: 2012年; 根据番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)外壳蛋白(CP)基因序列上的保守序列,设计特异性的引物和Taqman探针,建立荧光定量PCR方法。结果表明,试验建立的标准曲线循环阈值(Ct值)与模板浓度具有良好的线性关系,相关系数为0.9941;能检测到1 000个病毒拷贝,灵敏度比普通PCR高100倍;与番茄花叶病毒和黄瓜花叶病毒无交叉反应,特异性强、重复性佳,为TYLCV检测提供了一种特异、灵敏、快速的定量检测方法。; 阮美颖叶青静王荣青周国治姚祝平李志邈万红建杨悦俭; 关键词：番茄黄化曲叶病毒实时荧光定量PCR TAQMAN探针

茄科作物WRKY转录因子全基因组鉴定、进化及功能: 2015年; WRKY转录因子是存在于高等植物基因组内最重要的转录因子基因家族之一,在植物生长发育、应对生物胁迫(病菌和病毒等)和非生物胁迫(冷害、热害、高盐及干旱等)等一系列生物学进程中发挥重要作用。本文对茄科蔬菜作物(番茄、马铃薯、茄子和辣椒)WRKY转录因子的相关研究进行了综述。在全基因组水平上,分析了WRKY转录因子的数量、分类、基因表达模式以及功能等特征,为未来解析茄科作物WRKY转录因子的分布特征、进化关系以及功能奠定基础。; 程远李志邈姚祝平叶青静李鑫王荣青周国治杨悦俭阮美颖万红建; 关键词：茄科植物 WRKY转录因子进化

植物NBS-LRR抗病基因的结构、功能、进化起源及其应用被引量：22: 2014年; NBS-LRR(nucleotide binding site-leucine rich repeat)是植物中所含抗病基因数目最多的基因家族,也是植物基因组中最大的基因家族之一。本文全面综述了国内外植物NBS-LRR抗病基因家族的研究进展,主要包括植物NBS-LRR抗病基因的克隆、结构、功能及其起源进化;进一步阐述了该基因家族在抗病基因同源序列克隆、分子标记开发、基因定位等方面的应用,同时对植物NBS-LRR抗病基因家族研究中存在的问题及未来研究方向进行了探讨。本文旨在为进一步开发和利用NBS-LRR抗病基因提供理论依据,为其他抗病基因的研究提供参考。; 刘云飞万红建李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治韦艳萍杨悦俭; 关键词：植物 NBS-LRR 抗病基因

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