教育部科学技术研究重点项目(107070)
- 作品数：3 被引量：9H指数：2
- 相关作者：茅云翔孔凡娜王莉杨惠严兴洪更多>>
- 相关机构：中国海洋大学上海海洋大学淮海工学院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”教育部科学技术研究重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 条斑紫菜锰超氧化物歧化酶原核表达及多克隆抗体制备被引量：1
- 2010年
- 研究紫菜抗逆的分子机制,将本实验室克隆的条斑紫菜(Porphyra yezoensisUeda)锰超氧化物歧化酶(manganese superoxide dismutase,Mn SOD)基因全长cDNA克隆到质粒pET-30c(+)中,构建原核表达载体pET-S,转化大肠杆菌BL21(DE3)表达Mn SOD,表达产物的分子量约为30 KDa。利用不同浓度的Mn2+诱导重组Mn SOD的表达,可以检测到比活力随Mn2+浓度增高而上升的趋势。用重组Mn SOD免疫新西兰大白兔,制备了多克隆抗体,多克隆抗体的效价为1∶8 000。免疫印迹实验(Western Blot)表明该多克隆抗体具有很好的特异性。
- 邵林茅云翔阎斌伦孔凡娜王健
- 关键词：条斑紫菜原核表达多克隆抗体
- 条斑紫菜基因组Fosmid文库构建被引量：3
- 2009年
- 高分子量基因组文库是开展条斑紫菜基因组学研究的必备工具。构建了由23 040个Fosmid克隆组成的条斑紫菜孢子体无偏倚基因组文库。检测分析表明：文库克隆重组率为100%；插入DNA片段长度为28-40 kb，平均长度为35 kb，文库覆盖率约为条斑紫菜基因组的2.78倍；从超级池中筛查条斑紫菜18S rRNA、atpA、h2A、rbcL基因，至少能得到一个阳性克隆，印证了计算所推测的文库覆盖率；随机选取6个Fosmid克隆经100代传代后插入DNA片段未发生丢失或长度变化，表明克隆传代的稳定性。该文库的构建为开展条斑紫菜基因组特性分析和基因克隆奠定了基础。
- 茅云翔崔菁菁孔凡娜
- 关键词：条斑紫菜FOSMID文库基因克隆基因组学
- 坛紫菜EST-SSR筛选及其在遗传多样性分析中的实用性被引量：5
- 2009年
- 微卫星标记作为1种重要的分子标记,在分子标记辅助育种及遗传图谱构建中都起到重要的作用。EST文库搜索法是获得微卫星标记的途径之一,本研究对坛紫菜EST数据库中6035条序列进行搜索,发现340条EST包含SSR序列,其中三碱基重复最多,占总数45.95%;其次是两碱基重复,占总数的45.38%;再次是六碱基和五碱基,分别占总数的5.78%和2.02%;四碱基最少,仅占总数的0.87%。在两碱基中AG,GA,TC,CT类型数量最多,占所有两碱基SSR的82.8%;在三碱基中CCG,CGC,GCC,GGC,GCG,CGG类型数量最多,占所有三碱基SSR的52.83%;其它重复次数中,各种类型所占比例相差不大。进一步比较坛紫菜与条斑紫菜EST-SSR序列,发现2种紫菜SSR类型及比例存在明显差异。根据EST-SSR序列设计合成了10对引物,其中4个位点在8个不同来源坛紫菜叶状体间存在多态性,说明从坛紫菜EST中筛选的SSR标记可以用于进行坛紫菜遗传多样性分析。
- 杨惠茅云翔孔凡娜王莉严兴洪
- 关键词：坛紫菜微卫星序列EST-SSR
