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中央高校基本科研业务费专项资金(K50513100011)
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相关作者:
张小骏
陈昆
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AP聚类算法求解植入(l,d)模体识别问题
2015年
模体识别是运用计算机算法寻找一系列功能相近且形式相似的DNA序列片段,从而找出生物信息学中控制基因表达调控机制的转录因子结合位点,将这种问题转化为AP聚类算法可处理的模型,然后用AP聚类得到稳定的候选模体聚类,最终利用贪心算法对问题进行求精,得出一组候选模体集,利用相对熵测度对候选模体集合进行评价并且择优输出,从而构造出一种新的模体识别算法.实验结果分别从模拟数据和真实数据证明了所提算法的有效性.
陈昆
张小骏
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模体识别
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