云南省自然科学基金(1999C0026G)
- 作品数：4 被引量：2H指数：1
- 相关作者：董兴齐龙应欢张洪英何电王鹏更多>>
- 相关机构：大理学院云南省地方病防治所北京协和医学院更多>>
- 发文基金：云南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 鼠疫菌6kb质粒核酸序列同源性比对分析被引量：1
- 2008年
- 目的分析云南省鼠疫菌6kb（pYC）质粒核酸序列与GenBank中公开报道的多种细菌序列的同源性。方法通过美国国立图书馆网站序列比对搜索工具（BLAST），对鼠疫菌pYC质粒全序列和开放式读码框架（ORFs）以及翻译蛋白进行核酸与核酸、蛋白与蛋白比对分析。结果pYC质粒部分基因与宋内志贺菌质粒pKYM具有97．1％的同源性，与流感嗜血杆菌基因有92．1％的同源性，与伤寒沙门杆菌基因LT2和pIMVS1分别具有88.2％和87．2％的同源性，与大肠埃希菌O157：H7、K-12、ECOR31株局部基因分别具有81．4％、81．4％和84．7％的同源性。pYC质粒ORFs翻译蛋白ORF1与副鸡嗜血菌复制蛋白B具有47．2％的相似性，ORF4与大肠埃希菌推定蛋白具有52．7％的相似性，ORF5与假结核菌TriE蛋白具有48.3％的相似性．ORF6与大肠埃希菌Pilx5／VirB5相似蛋白具有42．3％的相似性、与小肠结肠炎耶尔森菌TriD蛋白具有38．5％的相似性，ORF10与伤寒沙门杆菌LT2细胞质蛋白具有83．1％的相似性，与大肠埃希菌O157：H7推定蛋白具有81．9％的相似性，ORF11与大肠埃希菌K12诱导损伤蛋白J具有81．4％的相似性。结论pYC质粒DNA序列与肠杆菌科部分基因具有高度同源性，可能编码类似埃希菌属和耶尔森菌属推定蛋白、诱导损伤蛋白、TriD和TilE蛋白、Pilx5／VirB5相似蛋白。
- 董兴齐张洪英王鹏尹家祥吴明寿
- 关键词：质粒
- 耶尔森氏菌低钙反应质粒的研究进展被引量：1
- 2009年
- 龙应欢董兴齐
- 关键词：耶尔森氏菌鼠疫菌质粒自然疫源性疾病世界大流行毒力因子
- 鼠疫耶尔森菌外膜蛋白及其功能研究进展
- 2009年
- 鼠疫耶尔森菌和其他革兰阴性杆菌一样，其细胞结构由双层膜结构包绕．内层为内膜（亦称胞浆膜，外层是细胞与外环境的分界，称为外膜。鼠疫耶尔森菌外膜蛋白（Yesinia outer proteins，Yops）主要是与外环境联系的受体蛋白和转运蛋白，其种类与数量均较为恒定，具有重要的、较为稳定的生理功能。深入研究Yops对于探讨鼠疫耶尔森菌的致病机制、研制快速诊断试剂以及开发新型、
- 龙应欢董兴齐
- 关键词：耶尔森菌鼠疫
- 从密码子和16S核糖体分析鼠疫菌的进化被引量：1
- 2010年
- 目的 从密码子和16S核糖体的角度探讨鼠疫菌的突变和进化.方法 利用生物信息学工具对鼠疫菌的密码子偏好和16S核糖体进行分析.结果 密码子分析发现4株耶尔森菌的低钙反应质粒（PCD1）密码子偏好相似,古老型鼠疫菌的3个质粒中鼠毒素质粒（PMT1）和PCD1质粒密码子相似,而PCD1、鼠疫菌素质粒（PCP1）和云南鼠疫菌PYC（6 kb）质粒的密码子偏好有一定的差异.16S核糖体分析发现11株耶尔森菌的16S核糖体序列相似,其中假结核和鼠疫菌最接近,只有1个碱基的差别,经过分析发现鼠疫菌的这个位点的碱基发生了突变,由G变成T,相应的氨基酸也由甲硫氨酸（M）变成异亮氨酸（I）;而鼠疫菌的16S核糖体序列与大肠埃希菌、人蚤有一定的区别.结论 鼠疫菌获得PCP1的时间可能要比PMT1晚,或者说鼠疫菌与PMT1的亲缘性要比PCP1和云南6 kb质粒相近;鼠疫菌16S核糖体核苷酸位点的改变可能会导致16S rRNA功能和结构的改变,而鼠疫菌16S核糖体的序列与人蚤相似性很低,推断其协同进化时间很短,说明鼠疫菌的出现很晚.
- 何电龙应欢张洪英董兴齐
- 关键词：耶尔森菌鼠疫密码子核糖体进化
