福建省自然科学基金(X0750052)
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
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- 相关机构：厦门大学复旦大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生理学更多>>
- 蛋白质中三联氨基酸数与二级结构数的模型研究被引量：1
- 2009年
- 蛋白质的一级结构或序列与二级结构的关系在蛋白质结构研究中是很重要的,通过建立模型的方法来研究这种关系.在文献中已有的模型(蛋白质一级结构中的二联氨基酸与蛋白质二级结构的模型)的基础上,建立了蛋白质一级结构中的三联氨基酸个数与蛋白质二级结构个数模型.该模型能够较准确地反映蛋白质的一级结构或序列与蛋白质的二级结构的关系,比较适合应用于氨基酸序列长度变化较大的建模数据,同二联氨基酸与二级结构模型比较,由于三联氨基酸含有更多氨基酸之间的耦合信息,该模型的拟合精度更高.由于蛋白质一级结构中的三联氨基酸的种类数很大(为4200),用以建模的变量数就很大,同时从DSSP数据库得到的样本量也很大(为11600),用以建模的数据量很大.研究结果表明,PLS变量筛选法是一种建立大数据模型有效的方法,可有效地处理变量数为4200,样本数为11600这样大数据量的建模问题.
- 朱尔一
- 关键词：蛋白质二级结构预测
- 由质谱分析数据建立乙肝病人与健康人的分类模型被引量：3
- 2009年
- 建立运用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱获取乙肝病人和健康人血清蛋白指纹图谱数据,并用偏最小二乘(PLS)变量筛选法建立乙型肝炎(HBV)病人和健康人的分类模型,最终得到分类模型的交叉检验相关系数达0.97以上,判别准确率显著提高。对模型进行分析,找出对乙型肝炎病人和健康人的差异有重要影响的因素或变量。这些变量为某些质荷比区间内特定蛋白的峰强度值,反映这些质荷比区间内蛋白量的增加或减少,与乙肝病的形成有密切关系,可作为重要的生物标志物,进一步加以研究。本研究采用所得模型的拟合值等一些信息来做分类图,能较好地表达回归模型的分类效果。
- 徐琨朱尔一杨芃原刘银坤
- 关键词：乙型肝炎
