全球变化研究国家重大科学研究计划(2012CB910604)
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
- 相关作者:张丽华周愿张玉奎袁辉明张珅更多>>
- 相关机构:中国科学院中国科学院大学河北大学更多>>
- 发文基金:全球变化研究国家重大科学研究计划国家自然科学基金国家重大科学仪器设备开发专项更多>>
- 相关领域:理学生物学更多>>
- 基于质量亏损的准等重二甲基化标记蛋白质组定量方法
- 蛋白质参与生命活动的全部过程,并且体现生命活动过程的变化。研究蛋白质的表达量的变化对于发现具有重要生物功能的蛋白质、筛选与疾病相关的生物标志物以及寻找药物的靶标具有重要意义[1]。因此,蛋白质组样品的高准确度、精密度和宽...
- 周愿单亦初张丽华张玉奎
- 关键词:定量蛋白质组学生物质谱
- 文献传递
- 集成化蛋白质组定量分析平台的构建及应用被引量:1
- 2014年
- 为提高蛋白质组定量分析的准确度、通量和自动化程度,构建了由微升级混合离子交换色谱、亲水型固定化酶反应器(hIMER)和纳升级反相色谱-电喷雾串级质谱(nanoRPLC-ESI-MS/MS)组成的集成化蛋白质定量分析平台。该平台实现了二甲基化标记蛋白质样品在线分离、酶解、肽段分离鉴定和定量分析。采用质量比为1∶1的轻、重标记的蛋白质样品考察该平台的定量性能,发现蛋白质水平二甲基化标记效率为90%;蛋白质经hIMER在线酶解10 min产生的漏切及酶解产物在hIMER柱上的非特异性吸附对定量准确度的影响较小,所有定量到的重/轻标记的蛋白质质量比的平均值为1.01。最后将该平台应用于小鼠腹水型肝癌淋巴道高、低转移细胞系差异蛋白质的分析,发现了12种蛋白质在高转移细胞系中低表达,15种蛋白质在高转移细胞系中高表达。以上结果证明了该平台可以实现高准确度和高通量的蛋白质组定量分析。
- 周愿张珅袁辉明张丽华张玉奎
- 关键词:定量蛋白质组学
- 质谱兼容的蛋白质组样品预处理技术
- 蛋白质组样品的高度复杂性使得样品预处理已成为必不可少的关键环节。而质谱技术的不断发展也为深入开展蛋白质组学研究提供了重要技术支撑。为确保基于生物质谱的蛋白质组分析策略的高效性和高灵敏度。近年来,我们针对膜蛋白质组的增溶、...
- 赵群夏思敏袁辉明张丽华张玉奎
- 关键词:质谱蛋白质组膜蛋白离子液体
- 文献传递
- 溴化1-丁基,3-(3-氨丙基)咪唑用于羧基衍生:潜在应用于肽段的高灵敏度质谱鉴定
- 2013年
- 本文发展了阳离子衍生化试剂溴化1-丁基,3-(3-氨丙基)咪唑(BAPI),并应用于肽段的羧基衍生化.以合成肽段RVYVHPI(RI-7)作为样品,其衍生化标记效率可接近100%.此外,肽段衍生物在含0.1%的三氟乙酸水溶液或乙腈/水(体积比1︰1)溶液中至少可稳定保存1周.进一步研究了BAPI衍生对肽段离子化效率的影响.结合基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析,模式肽段RI-7的检测灵敏度可提高42倍以上,优于商品化哌嗪试剂的衍生效果.此外,衍生肽段在电喷雾质谱(ESI MS)中的离子带电荷数也得到显著提高.上述结果表明,BAPI是一种具有潜在优势的衍生化试剂,有望应用于肽段的高灵敏度质谱鉴定研究.
- 乔晓强周愿侯春彦张晓丹杨开广张丽华张玉奎