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国家自然科学基金(31370813)

作品数:10 被引量:20H指数:3
相关作者:陶生策张雨晨陈建伟邵宁杨立桃更多>>
相关机构:上海交通大学教育部更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:医药卫生生物学理学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 5篇医药卫生
  • 2篇生物学

主题

  • 3篇SARS-C...
  • 2篇血清
  • 2篇冠状
  • 2篇冠状病毒
  • 2篇病毒
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白-蛋白相...
  • 1篇蛋白相互作用
  • 1篇蛋白质相互作...
  • 1篇新型冠状病毒
  • 1篇血清抗体
  • 1篇血清学
  • 1篇血清学检测
  • 1篇乙酰
  • 1篇乙酰化
  • 1篇乙酰化酶
  • 1篇质谱
  • 1篇生物学
  • 1篇生物学检测
  • 1篇噬菌体

机构

  • 5篇上海交通大学
  • 1篇教育部

作者

  • 2篇陶生策
  • 1篇杨立桃
  • 1篇涂顺
  • 1篇郭书娟
  • 1篇邵宁
  • 1篇李华
  • 1篇陈建伟
  • 1篇张雨晨
  • 1篇胡传圣

传媒

  • 2篇生命的化学
  • 1篇生命科学
  • 1篇遗传
  • 1篇Cellul...
  • 1篇上海交通大学...
  • 1篇Curren...

年份

  • 2篇2021
  • 3篇2020
  • 1篇2017
  • 1篇2014
10 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
细菌蛋白质乙酰化研究进展被引量:1
2014年
在真核生物和原核生物中,蛋白质乙酰化行使重要的功能。过去几十年,在细菌中发现了大量的新的乙酰化蛋白。聚焦于蛋白质Nε的乙酰化。首先介绍蛋白质乙酰化的发现和发展史,其次概述了ACS、CheY等乙酰化后的功能,乙酰化和泛素化、磷酸化之间的关系。在技术层面,讨论了蛋白质芯片用于发现新的乙酰化酶、去乙酰化酶以及新的乙酰化蛋白的优势和可能性;详细讨论了免疫沉淀富集结合高分辨率质谱和生物信息学分析来高通量发现乙酰化蛋白的有效性,并且提出了改进措施。最后,展望了细菌乙酰化有待研究的关键问题以及与其他酰化之间的关系。
刘诚喜涂顺郭书娟陶生策
关键词:细菌乙酰化乙酰化酶去乙酰化酶质谱
Systematic profiling of SARS-CoV-2-specific IgG epitopes at amino acid resolution
2021年
There is a worldwide pandemic of COVID-19 caused by SARS-CoV-2.1 By January 28,2021,more than 100 million cases had been diagnosed,and more than 2 million deaths had been reported(https://coronavirus.jhu.edu/map.html).The comprehensive and in-depth elucidation of SARS-CoV-2-specific IgG responses will help us to better understand COVID-19 immunity and facilitate the precise development of neutralizing antibodies and vaccines.
Huan QiMing-liang MaHe-wei JiangJian-ya LingLing-yun ChenHai-nan ZhangDan-yun LaiYang LiZi-wen GuoChuan-sheng HuShu-juan GuoQing-feng MengYan RenXiao YangWei WangJie ZhouXiao-dong ZhaoHua LiSheng-ce Tao
关键词:PRECISENEUTRAL
一种载样简单的多重可视化PCR微芯片被引量:3
2017年
在核酸检测领域急需一种能够经济、快速、操作简便且同时检测多个靶标的新技术。常规多重PCR能够同时扩增多个靶标,但由于在一个试管中引物间的相互作用和竞争,重数往往受到限制。本研究设计了一种操作简单的多重PCR芯片,可以同时进行54个靶标的扩增。芯片结构简单,一条微通道将正下方平行排列的多个微孔连接在一起,微通道只留加样口和出样口。同时整个微通道呈疏水状态,微孔呈亲水状态。将不同的引物对和低溶点琼脂糖提前固定于不同的微孔中,通过一次加入PCR mix,并加入矿物油推动PCR mix进入到每个微腔室中,同时微孔也被矿物油相互隔离避免交叉反应。加样后将芯片放置于平板PCR仪上进行扩增,在整个反应过程中低溶点琼脂糖呈液态,反应结束后凝固成固体,便可引入核酸染料进行染色,最后利用自制小型的紫外照射仪上进行可视化检测和拍照记录。利用此平台成功实现了对7种非常重要和常用的转基因作物靶标的并行检测,结果显示此平台具有较高的灵活性和特异性。此技术经过进一步优化可应用于包括转基因检测在内的多重核酸检测领域。
陈建伟邵宁张雨晨朱元首杨立桃陶生策
关键词:多重PCR微芯片
基于噬菌体展示和高通量测序的血清抗体整体质量评估体系研究
2020年
目的·建立针对血清中抗体的整体质量评估体系,为血清自身抗体标志物相关研究提供量化的质控标准。方法·以50名健康者的血清为研究对象,分别经-80 ℃、-20 ℃、4 ℃、37 ℃、95 ℃处理后,与噬菌体随机肽展示库Ph.D.-12进行孵育,采用免疫沉淀方式获得噬菌体-IgG复合物。经高通量测序、生物信息学分析,统计每一种处理条件下血清结合肽的序列及频率,计算香农熵,评估血清中自身抗体的整体质量。结果·随着处理温度的升高,血清的香农熵逐渐降低;在同一温度条件下,血清的香农熵随着时间增长而逐渐降低,其中-20 ℃与-80 ℃处理的样品相比,香农熵波动不大;95 ℃处理10 min后的样品香农熵达到最低值。结论·联合噬菌体随机肽展示技术和高通量测序技术,可以用于解析血清中抗体的肽结合谱,并以香农熵为指征建立血清抗体整体质量评估体系。
赖丹昀胡传圣祁环马明亮李华陶生策
关键词:血清抗体噬菌体展示高通量测序
三种强致病性冠状病毒与人蛋白质相互作用研究进展被引量:7
2020年
2019年12月,新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的呼吸道疾病在中国武汉暴发并迅速席卷全球。截至2020年7月7日,在全球范围内感染人数超过1150万,死亡人数达到53万。导致严重疾病的冠状病毒还包括SARS-CoV和MERS-CoV。SARS-CoV-2与SARS-CoV在致病性、基因组和蛋白质组结构上高度同源,其感染及发病机制亦有较高的相似性。针对以上三种冠状病毒引起的呼吸道疾病临床上尚无有效的药物和疫苗,其中一个重要原因是对冠状病毒基本生物学机制的理解尚不充分。蛋白质在病毒的致病过程中发挥了重要作用,研究病毒与宿主的蛋白质相互作用有助于深入了解病毒的致病机制,为开发预防和治疗病毒感染的有效疫苗和高效药物提供指引。本文综述了SARS-CoV-2、SARSCoV及MERS-CoV三种冠状病毒蛋白与宿主蛋白的相互作用、病毒自身蛋白的相互作用,以及这些蛋白质相互作用所发挥的功能,如转录翻译、病毒组装、抑制免疫反应等,以期对SARS-CoV-2的机制研究及药物开发提供参考。
郑云萧江何伟陶生策
关键词:冠状病毒SARS-COV蛋白-蛋白相互作用
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的检测技术被引量:9
2020年
由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)导致的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)正在全球蔓延,给人类生命健康带来了极大的威胁,开发快速准确的检测方法对病毒的防控至关重要。至今,国内外多个实验室及生物公司已针对SARS-CoV-2病毒开发了一系列检测方法,主要分为病原学检测、分子生物学检测和血清学检测三类。病原学检测主要为病毒分离培养和鉴定。分子生物学检测包括基因测序技术、实时荧光定量PCR技术、环介导等温扩增技术、微流控芯片技术、微滴式数字PCR技术以及CRISPR核酸检测技术等。血清学检测包括酶联免疫吸附测定、胶体金免疫层析技术、侧流免疫层析技术以及蛋白质芯片技术等。本文试图就新冠病毒检测技术方面的研究进展进行归纳和简要介绍,以期为该病毒检测技术的进一步发展提供参考。
王雪宁朱元首江何伟陶生策
关键词:新型冠状病毒病原学检测分子生物学检测血清学检测
Epitope Analysis of Anti-SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies被引量:1
2021年
Coronavirus disease 2019 is threatening thousands of millions of people around the world.In the absence of specific and highly effective medicines,the treatment of infected persons is still very challenging.As therapeutics,neutralizing antibodies(NAbs)have great potential.Many NAbs have been reported,and most target various regions on the receptor-binding domain of the spike(S)protein,or the N-terminal domain.Several NAbs and NAb cocktails have been authorized for emergency use,and more arc in clinical trials or are under development.In this review,considering the angle of binding epitopes on the S protein,we summarize the functions and the underlying mechanisms of a set of well-recognized NAbs and provide guidance for vaccine design and the combinatorial use of these antibodies.In addition,we review the NAbs and NAb cocktails that have been approved for emergency use and discuss the effectiveness of these NAbs for combating severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 mutants.
Jun-biao XUESheng-ce TAO
关键词:EPITOPETHERAPEUTICSVACCINE
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