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国家自然科学基金(31372064)

作品数:5 被引量:27H指数:3
相关作者:徐良龚义勤柳李旺王娟娟沈虹更多>>
相关机构:南京农业大学全国农业技术推广服务中心更多>>
发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金江苏省自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 5篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 6篇农业科学

主题

  • 5篇萝卜
  • 2篇基因
  • 1篇多态性
  • 1篇性状
  • 1篇遗传图
  • 1篇遗传图谱构建
  • 1篇指纹
  • 1篇指纹图
  • 1篇指纹图谱
  • 1篇逆转座
  • 1篇逆转座子
  • 1篇铅胁迫
  • 1篇转座
  • 1篇转座子
  • 1篇硝酸还原酶
  • 1篇胁迫
  • 1篇芥子酶
  • 1篇扩增多态性
  • 1篇还原酶
  • 1篇基因表达

机构

  • 5篇南京农业大学
  • 2篇全国农业技术...

作者

  • 4篇柳李旺
  • 4篇龚义勤
  • 4篇徐良
  • 2篇王娟娟
  • 1篇何玲莉
  • 1篇王燕
  • 1篇赖德强
  • 1篇沈虹
  • 1篇谢洋
  • 1篇武悦
  • 1篇李芳
  • 1篇贺晓燕

传媒

  • 2篇南京农业大学...
  • 1篇江苏农业学报
  • 1篇核农学报
  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2018
  • 3篇2015
  • 1篇2014
  • 1篇2013
5 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
萝卜IRAP技术体系建立与品种指纹图谱构建被引量:4
2015年
为建立萝卜逆转座子间扩增多态性(IRAP)技术体系,基于萝卜Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守序列设计引物,对IRAP-PCR反应主要因素进行分析。建立的萝卜IRAP标记技术体系(20μl)为:20 ng基因组DNA模板,1×PCR buffer,0.25 mmol/L d NTPs,2.0 mmol/L Mg2+,0.4μmol/L引物,1 U Taq DNA聚合酶。将所建立的IRAP标记技术体系应用于14个萝卜品种指纹图谱分析,结果显示,筛选出的2个特异引物Rs Ty1F5和Rs Ty1F10在14份萝卜材料中共扩增得到了16个多态性条带,可以将14份萝卜材料完全区分开,每份种质都有独特的指纹图谱,表明IRAP技术可以有效地应用于萝卜种质鉴定和指纹图谱的构建。
李芳徐良魏美甜龚义勤柳李旺
关键词:萝卜逆转座子IRAP指纹图谱
铅胁迫下萝卜基因组DNA甲基化分析被引量:15
2015年
利用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术,分析不同浓度铅(Pb)处理下萝卜基因组DNA甲基化水平的变化,探讨DNA甲基化在植株对Pb胁迫反应中的作用。结果表明,经100、400和800 mg·L-1Pb(NO3)2处理后,MSAP比率分别为12.7%、14.2%和17.0%,均高于对照;全甲基化率分别为9.7%、10.2%和12.8%,而其对照为9.5%,表明重金属铅胁迫后,某些位点发生了重新甲基化。萝卜肉质根中总甲基化水平随Pb处理浓度上升而提高。甲基化变异可分为重新甲基化、去甲基化、不定类型以及与对照相同等甲基化类型。萝卜Pb胁迫处理引起的植株基因组甲基化程度的提高主要是重新甲基化。研究为从DNA水平揭示重金属Pb毒害机理及植物对Pb胁迫的响应机制提供了理论依据。
何玲莉沈虹王燕王娟娟龚义勤徐良柳李旺
关键词:萝卜铅胁迫DNA甲基化甲基化敏感扩增多态性
萝卜高密度遗传图谱构建与红皮性状基因鉴定
高密度遗传图谱是提高参考基因组组装、基因定位、比较基因组研究的重要工具。萝卜(Raphanus sativus L.)是一种重要的一、二年生十字花科根菜类蔬菜作物。萝卜肉质根营养丰富,药用食疗价值高,不同基因型萝卜品种品...
罗小波
关键词:萝卜基因鉴定
文献传递
Molecular Characterization and Expression Profiles of Myrosinase Gene(RsMyr2) in Radish(Raphanus sativus L.)被引量:1
2014年
Myrosinase is a defense-related enzyme and is capable of hydrolyzing glucosinolates into a variety of compounds, some of which are toxic to pathogens and herbivores. Many studies revealed that a number of important vegetables or oil crops contain the myrosinase-glucosinolate system. However, the related promoter and genomic DNA sequences as well as expression profiles of myrosinase gene remain largely unexplored in radish(Raphanus sativus). In this study, the 2 798 bp genomic DNA sequence, designated as RsMyr2, was isolated and analyzed in radish. The RsMyr2 consisting of 12 exons and 11 introns reflected the common gene structure of myrosinases. Using the genomic DNA walking approach, the 5′-flanking region upstream of RsMyr2 with length of 1 711 bp was successfully isolated. PLACE and PlantCARE analyses revealed that this upstream region could be the promoter of RsMyr2, which contained several basic cis-regulatory elements including TATA-box, CAAT-box and regulatory motifs responsive to defense and stresses. Furthermore, recombinant pET-RsMyr2 protein separated by SDS-PAGE was identified as myrosinase with mass spectrometry. Real-time PCR analysis showed differential expression profiles of RsMyr2 in leaf, stem and root at different developmental stages(e.g., higher expression in leaf at cotyledon stage and lower in flesh root at mature stage). Additionally, the RsMyr2 gene exhibited up-regulated expression when treated with abscisic acid(ABA), methyl jasmonate(MeJA) and hydrogen peroxide(H2O2), whereas it was down-regulated by wounding(WO) treatment. The findings indicated that the expression of RsMyr2 gene was differentially regulated by these stress treatments. These results could provide new insight into elucidating the molecular characterization and biological function of myrosinase in radish.
PAN YanXU Yuan-yuanZHU Xian-wenLIU ZheGONG Yi-qinXU LiangGONG Mao-yongLIU Li-wang
关键词:芥子酶SDS-PAGEDNA序列
萝卜硝酸还原酶基因的克隆与表达分析被引量:1
2015年
[目的]为揭示萝卜(Raphanus sativus L.)硝酸还原酶基因(RsNR)的分子特征,降低硝酸盐含量,对萝卜RsNR基因进行分离与表达特性研究。[方法]基于本实验室转录组测序所得unigene序列分离RsNR基因cDNA,利用生物信息学方法进行序列分析,采用RT-qPCR方法对不同浓度KNO3(0、5、20、30和50mmol·L^-1)和不同时间(0、4、8、12和24h)处理的萝卜中RsNR基因表达进行检测,并测定硝酸盐含量和硝酸还原酶活性(NRA)。[结果]获得萝卜RsNR基因cDNA序列(GenBank登录号:KM272859),开放阅读框为2742bp,编码913个氨基酸,RsNR与油菜NR基因(D38219)氨基酸序列相似性为95%。在30mmol·L^-1NO3^--N诱导下,萝卜叶片和根中RsNR基因表达量最高。在30mmol·L^-1NO3^--N诱导初期,叶片和根中RsNR表达量4h达到最大值,随后呈下降趋势;随着硝酸盐处理浓度升高,NRA、硝酸盐含量和RsNR基因表达量均呈先升后降趋势,0~4h内叶片和根中三者均上升,4~24h内NRA和RsNR基因表达下降,而硝酸盐含量呈上升趋势。[结论]NO3^--N可能在转录水平上调控萝卜RsNR基因表达,进而影响其硝酸盐含量和NRA。
武悦徐良王娟娟龚义勤谢洋柳李旺
关键词:萝卜基因表达
萝卜铁转运蛋白基因RsIRT1分子特征分析被引量:6
2013年
运用PCR和RT-PCR技术从萝卜中克隆出RsIRT1基因,其cDNA包含一个长度为1 038 bp的开放阅读框,编码345个氨基酸,蛋白质相对分子质量为36.37×103。TMHMM Server v2.0分析RsIRT1蛋白有8个跨膜结构域,推测为一种膜蛋白;蛋白序列同源分析表明,萝卜RsIRT1(AFJ05595)与拟南芥AtIRT1(XP-002869968)、遏蓝菜TcIRT1-P(CAL25151)的遗传距离最近。半定量RT-PCR表达分析表明,正常铁营养时RsIRT1基因在萝卜花瓣、花蕾、叶片和根中均不表达,缺铁胁迫及缺铁加镉(100 mg·L-1)胁迫下表达,且缺铁加镉胁迫下,叶片和根中RsIRT1的表达量均高于缺铁胁迫。研究结果表明RsIRT1基因受外源缺铁和镉胁迫所诱导,RsIRT1参与金属铁和镉的吸收和转运过程。
贺晓燕龚义勤徐良赖德强温天彩柳李旺
关键词:萝卜
共1页<1>
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