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国家自然科学基金(30970333)

作品数:1 被引量:0H指数:0
相关作者:孙世春时伟徐冬丽陈海霞更多>>
相关机构:中国海洋大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇纽虫
  • 1篇线粒体基因
  • 1篇线粒体基因组
  • 1篇密码子
  • 1篇密码子使用
  • 1篇基因
  • 1篇基因组

机构

  • 1篇中国海洋大学

作者

  • 1篇陈海霞
  • 1篇徐冬丽
  • 1篇时伟
  • 1篇孙世春

传媒

  • 1篇中国海洋大学...

年份

  • 1篇2012
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
白额纵沟纽虫(Lineus alborostratus Takakura)的线粒体基因组
2012年
通过PCR扩增、测序获得白额纵沟纽虫线粒体基因组全序列并进行了生物信息学分析。白额纵沟纽虫线粒体基因组全长15 476bp,包含后生动物线粒体基因组典型的13个蛋白质编码基因、22个转运RNA基因、2个核糖体RNA基因和1个747bp的非编码区。除tRNA-Thr和tRNA-Pro基因外,其他基因均编码在重链上。基因组碱基组成具有AT偏向性,蛋白质编码基因偏好使用富含T的密码子。蛋白质编码基因的起始密码子均为ATG,终止密码子多为TAA或TAG,nad1、nad2、cytb基因具有不完全终止密码子T。预测的22个tRNA均具有典型三叶草结构。非编码区未发现在其他纽虫所报道的特殊茎环结构,但在nad4基因上发现有37bp的发卡结构。白额纵沟纽虫的基因排列、起始密码子、tRNA反密码子与Lineus viridis完全一致,两者rrnL和非编码区长度差别较大,前者具有较少核苷酸插入。
徐冬丽陈海霞时伟孙世春
关键词:线粒体基因组密码子使用
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