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元码基因科技(北京)股份有限公司
作品数:
80
被引量:14
H指数:2
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中国医学科学院肿瘤医院
黑龙江八一农垦大学
湖南工业大学
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发文基金:
黑龙江省农垦总局科技计划项目
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中国医学科学院肿瘤医院
黑龙江八一农垦大学
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王锡山
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王玉凤
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王志
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克力木·阿布...
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杨克军
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张翼飞
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10篇
2021
20篇
2020
10篇
2019
8篇
2018
1篇
2017
共
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确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针组
本发明公开一种确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针组。该方法为使用肿瘤单个样本且基于二代测序技术的方法,其包括以下步骤:(1)初步筛选得到由多个微卫星位点组成的候选位点集;和(2)计算候选位点集中各微...
杨洲
张吉娜
刘金洋
张美俊
孙雪
王伟伟
田埂
文献传递
基于二代测序技术检测无对照样本的微卫星不稳定的方法、组合物和用途
本发明公开基于二代测序技术检测无对照样本的微卫星不稳定的方法、组合物和用途。本发明的方法包括利用扩增引物组合物对组织样本进行建库并测序;从测序数据中提取出样本数据,并进一步提取所需的测序序列;计算该测序序列的长度,并统计...
郎继东
田埂
用于检测EGFR突变的组合物、试剂盒和方法
本发明公开用于检测EGFR突变的组合物、试剂盒和方法。组合物包含正向引物、反向引物和野生型EGFR基因结合分子,且正向引物和反向引物的组合能够得到包含EGFR突变位置的扩增产物。正向引物包括5’端区域、3’端区域和中间区...
陈含
梁羽
文献传递
基于RNA靶向测序和机器学习的癌症组织溯源方法
本发明公开基于RNA靶向测序和机器学习的癌症组织溯源方法。本发明通过RNA靶向测序技术,高效富集目标基因区域,经过反转录、建库、测序步骤,得到目标区域的二代测序数据,并利用随机森林算法在TCGA数据集上训练得到肿瘤溯源预...
杨家亮
王博
郎继东
梁乐彬
张燕香
孙雪
张海鹏
王伟伟
田埂
文献传递
基于二代测序技术精确检测液体活检个体突变的方法和试剂盒
本发明公开一种基于二代测序技术精确检测液体活检个体突变的方法,其包括(1)根据从受试者采集的液体样品中的细胞游离DNA的长度对细胞游离DNA进行分类,得到两个以上具有不同长度范围的细胞游离DNA组;(2)从两个以上具有不...
郎继东
田埂
基于机器学习和大数据挖掘的药物重定位算法综述
被引量:2
2020年
药物重定位(又称药物重使用或药物重配置)是将现有治疗方法应用于新的疾病的过程的一种药物研发方法。新药研发成本高、失败率高,使得对现有药物进行重新定位成为目前研究的热点。在高通量测序技术的帮助下,许多有效的算法被提出并应用于药物的重新定位。目前用于药物和化合物重定位的算法可分为基于特征的方法、基于矩阵分解的方法、基于网络的方法3大类。分别对这3类常用方法进行综述,总结这些方法的优缺点,并对未来药物重新定位方法的发展方向进行剖析,以期达到帮助我国科研工作者开发更加有效的药物重定位算法,增加我国社会经济效益的目的。
彭超
胡永祥
陈龙飞
叶紫璇
田埂
关键词:
基因表达
药物靶点
跨平台组织溯源模型的构建方法、系统及存储介质
本发明公开跨平台组织溯源模型的构建方法、系统及存储介质。当前大多数肿瘤溯源方法是基于一平台数据进行建模,然后再到另一平台数据上进行测试。往往会导致在同一平台测试结果良好,在另一平台进行测试结果会有所下降。本发明的方法很好...
杨家亮
王博
黎芮希
刘志秋
用于检测HPV在宿主基因组的整合位点的方法
本发明公开一种用于检测HPV在宿主基因组的整合位点的方法,包括以下步骤:从来自受试者的生物样本中提取宿主基因组DNA,并将其打断至主峰为800bp‑4kb的片段;利用探针组对得到的片段中进行第一检测获得目标序列;对获得的...
孟博
田埂
王伟伟
董如一
杨文娟
文献传递
用于检测结核杆菌及其耐药性的方法
本发明公开用于检测结核杆菌及其耐药性的方法,其包括使预混液和油在微滴发生器内生成含有众多微滴的反应体系,然后在能够进行PCR反应的条件下处理反应体系,随后使处理后的反应体系中各微滴依次分别通过双色检测器来检测荧光,基于获...
陈含
高建勇
王伟伟
田埂
文献传递
用于完整端粒扩增子测序的组合物、预文库及其构建方法
本发明公开用于完整端粒扩增子测序的组合物、预文库及其构建方法。本发明设计了一种端粒特异性温控锚定接头,为端粒添加该接头时,能够区分和富集完整端粒末端,并避免非完整末端被建库。此外,本发明在端粒序列附近的基因组序列上还设计...
纪鑫
倪守峰
王伟伟
田埂
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