云南大学生命科学学院现代生物学研究中心 作品数:29 被引量:105 H指数:6 相关作者: 曹槐 冯宇 张春娟 张希 周文彦 更多>> 相关机构: 中国科学院昆明动物研究所 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所 云南农业大学农学与生物技术学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 云南省应用基础研究基金 云南省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 生物学 理学 医药卫生 农业科学 更多>>
烤烟矿质营养分布的因子分析 被引量:23 2001年 为了研究烤烟的B营养及B K交互作用 ,进行了烤烟生长期间不同施K、施B肥的盆栽试验。在两个生育期测定根、叶不同部位 1 0种矿质营养元素含量 ,并对试验结果作了因子分析和方差分析。分析结果表明 ,一个四因子模型解释了试验数据总方差的 92 1 % ,1 0种矿质元素划分为有确切意义的公因子—微量元素营养因子、常量元素营养因子、磷因子和硼因子。矿质营养分布方式主要受植株部位、施K量及两者交互效应的显著影响。根部有较高的微量元素浓度分布 ,叶部有较高的常量元素浓度分布。多施K肥可适当提高烟叶含K量 ,也可抑制叶片中的Ca、Mg、S含量 ,减小P营养。K充足时 ,多施B肥有可能增加根部微量元素营养。高B、高K会影响植株对P、B的吸收。 曹槐 张晓林 刘世熙 和丽忠 陈锦玉 樊永言关键词:烤烟 矿质营养 D-苯丙氨酸与Cu^+(~1S_0,3d^(10))气相反应理论研究 被引量:2 2007年 用量子化学密度泛函(DFT)方法研究D-苯丙氨酸与一价基态金属阳离子Cu+在气相中反应的机理.在B3LYP/6-31G*水平上,优化了反应包含的4个反应通道的反应物、中间体、过渡态和产物的几何构型,并采用B3LYP/DZVP,B3LYP/[6-311+G**(C,H,O)+Lanl2dz(Cu)],B3LYP/6-311+G**,MP2/6-311+G**等方法对各驻点进行了单点能计算.通过对计算结果的分析,获得了其单重态反应势能面的一般轮廓、各驻点几何构型优化参数,明确了其反应机理. 程伟贤 陈鸿雁 张义平 冯宇 李涛洪 曹槐关键词:D-苯丙氨酸 CU^+ 密度泛函 反应机理 痂囊腔菌素A的结构 被引量:5 2000年 对实验室生物合成方法制得的痂囊腔菌素A做X射线晶体衍射测定,与文献对照,所属品系及空间群相同,晶胞参数接近,但发现苝醌母体外的侧基构型有明显差异,主要表现在两个手性碳原子是R-R型而非S-S型,分别以衍射数据和分子力学优化数据为起始结构,进行STO-3G水平上的结构全优化.计算结果表明所制得的痂囊腔菌素A是一种新的光学活性对映体,由此推测痂囊腔菌素A的高光敏活性可能与手性结构特征有关. 曹槐 李聪 刘世熙 邵丹 陈远腾 汪汉卿关键词:晶体结构 量子化学计算 铜、锌、铬与胆固醇的相互作用 进行了水溶液中Cu<'2+>、Zn<'2+>、Cr<'3+>三种金属离子共同存在时与胆固醇的吸附实验,获得与单独一种离子存在时相类似的吸附模型.根据实验结果,对理论计算和医学现象作了阐述. 王林 宋仲容 刘世熙 曹槐关键词:铜 锌 铬 胆固醇 相互作用 高胆血症 几种化学计量学方法在放线菌及其次生代谢产物抗肿瘤活性筛选中的应用 被引量:1 2006年 当今肿瘤的诊断与治疗对人类健康非常重要.在放线菌次生代谢产物内寻找抗肿瘤抗生素的过程中,如何从种类多、数量大的土壤放线菌株中确定目标菌株,筛选是关键.将化学计量学方法用于大批量的放线菌及其次生代谢产物的筛选数据分析,首先通过主成分分析获得具有抗肿瘤活性菌株对6种肿瘤细胞抑制作用的一些关系与特异性,其次在进行菌株次生代谢产物的分子模型筛选数据分析时,利用比较分析发现有较好肿瘤抑制作用者,基本与细胞筛选结果吻合.二者结合建立了一种简便适当的分析模式,能较快地从大批量放线菌株的筛选中找到具有抗肿瘤活性的有研究价值的目标放线菌株. 高旭红 文孟良 曹槐 李一青 李铭刚关键词:放线菌 次生代谢物 抗肿瘤活性筛选 基于流形学习的基因表达谱数据可视化 被引量:8 2009年 基因表达谱的可视化本质上是高维数据的降维问题。采用流形学习算法来解决基因表达谱的降维数据可视化,讨论了典型的流形学习算法(Isomap和LLE)在表达谱降维中的适用性。通过类内/类间距离定量评价数据降维的效果,对两个典型基因芯片数据集(结肠癌基因表达谱数据集和急性白血病基因表达谱数据集)进行降维分析,发现两个数据集的本征维数都低于3,因而可以用流形学习方法在低维投影空间中进行可视化。与传统的降维方法(如PCA和MDS)的投影结果作比较,显示Isomap流形学习方法有更好的可视化效果。 肖传乐 曹槐关键词:基因芯片 流形学习 维生素E类化合物抗氧化活性的理论分析 被引量:6 2004年 用半径验方法AM1,对12种维生素E类化合物及2种单酚与羟基自由基反应的活化能、氧氢键离解能D进行了计算。发现Ea、D越低,其抗氧化活性愈高;Ea、D与化合物分子中芳环上烷基取代基的数目、种类及位置有关;14个化合物的反应活化能均小于56kJ·mol-1;从反应物到过渡态氧原子上的净电荷减少。 潘蓄林 曹槐 李聪 周春 邓芳轶关键词:抗氧化活性 过渡态 活化能 净电荷 构效关系 痂囊腔菌素A的光敏活性探讨 被引量:5 2000年 用人工发酵生物合成的方法制备得到痂囊腔菌素A简称EA。通过电子顺磁共振技术(EPR)对EA氮氧自由基的光敏化学反应,研究光生物活性的抑菌试验,EA光动力学对人Hce-8693盲肠癌细胞增殖周期、诱导凋亡的探讨及量子化学的计算,阐明了痂囊腔菌素的光敏活性。 台虹 兰莉 宋建新 刘海云 李聪 马岚 曹槐 陈远腾 谢金伦关键词:流式细胞术 EPR 主成分分析方法在核酸碱基量子化学计算数据处理中的应用 被引量:1 2002年 The quantum calculations on five nucleic acid bases,A,G,C,U,and T,were performed by six semiempirical methods,ab initio Hartree Fork method with twenty different basis sets,and ab initio MP2 method with three different basis sets.Combining with experimental geometry parameters,two steps of principal component analysis(PCA) were processed on a large amount of data obtained from calculations.According to the results of the PCAs,some important geometric parameters of the bases were selected out to represent all of the parameters to discuss the problem related to geometric structure. 刘世熙 曹槐 栗 谢小光 刘次全关键词:主成分分析方法 量子化学 数据处理 半经验方法 从头算 RNA的历史与未来 被引量:2 2004年 核酶的发现使得人们有理由相信生命起源于RNA,通过试管演化实验获得的各种各样的催化性RNA更使人们对地球历史早期的RNA世界有了越来越多的了解。同时,随着RNA结构和功能上非凡的多样性的日益被揭示,RNA在未来的临床应用研究中所具有的巨大潜力也正逐渐显现出来。 王传铭 王昕 曹槐 刘次全关键词:RNA分子 RNA世界 核酶