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西北大学生命科学学院预防基因组医学研究所: 作品数：20 被引量：68H指数：6; 相关作者：杨莹贺红娟刘瑞涛王檬曾媛更多>>; 相关机构：西安交通大学医学部更多>>; 发文基金：国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划国际科技合作与交流专项项目更多>>; 相关领域：医药卫生生物学艺术水利工程更多>>

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西安交通大学医学部

大数据思维及其在生物医学领域的应用被引量：6: 2018年; 随着大数据时代的来临,大数据思维也逐渐兴起。大数据的特点可以用4V来总结：volume（大量化）、variety（多样化）、velocity（快速化）及value（价值）。大数据思维的特点可以总结为整体性、容错性、相关性和智能性,这些特点也是大数据思维与小数据思维的主要区别。大数据思维在生物医学领域的应用越来越多,最普遍常用的就是NCBI数据库,在NCBI数据库中挖掘有价值信息的过程本身就是大数据思维,还有Meta分析和TCGA数据库的兴起都说明了大数据思维在生物医学领域的巨大应用价值。; 赵晓娟朱子清李奇奇杨进; 关键词：大数据生物医学

结直肠癌基因组流行病学研究进展被引量：13: 2014年; 基因组流行病学的研究是近年来遗传流行病学与分子流行病学相互融汇交织而发展起来的新兴学科,它是从基因组学研究到医学实践的重要桥梁。全世界范围内,结直肠癌的发病率及死亡率有逐年上升的趋势,因此有必要从基因组流行病学的角度认清结直肠癌的流行病学及分子发病机制。本文重点围绕基因-基因以及基因-环境的交互作用对结直肠癌的影响作一阐述,旨在为结直肠癌基因的靶向治疗提供理论依据。; 陈尔飞徐晓娜杨进; 关键词：结直肠癌分子发病机制基因-环境交互作用

2型糖尿病与营养基因组学被引量：6: 2015年; 随着生活水平的提高,糖尿病及其并发症的发病率也呈逐年上升趋势,这给人们和社会带来了巨大的负担。因传统药物治疗的盲目性以及副作用,人们亟需去寻找更为安全、有效的治疗方案。随着对营养基因组学的深入研究,人们认识到通过营养素的干预可降低因个体易感基因缺陷所带来的2型糖尿病患病风险,这种个体化的非药物性治疗,有针对性且副作用小。本综述总结了主要以近年来已报道的2型糖尿病易感基因及其与营养素间的交互作用,旨在为2型糖尿病的健康干预方案提供理论依据。; 徐晓娜陈尔飞杨进; 关键词：2型糖尿病营养基因组学易感基因营养素

RASSF6在结直肠癌中的表达研究: 2015年; 结直肠癌是遗传因素与外界环境因素共同作用的结果,其中70%以上遗传倾向不明显,呈散发性。而目前已报道的散发性结直肠癌分子标识,如APC、KRAS以及TP53等对其发生的解释有限。新一代高通量的外显子测序技术是肿瘤候选基因筛查的有效手段。本研究在前期3例散发性结直肠癌外显子测序的结果中发现,RASSF6基因发生功能缺失突变。为了深入研究基因功能,我们对RASSF6基因在结直肠癌细胞系及结直肠患者组织的表达进行研究。结果为:相比于正常细胞NCM460,RASSF6在HT-29及SW480肠癌细胞系中呈高表达,而在Lo Vo细胞中并无统计学差异。RASSF6在结直肠癌组织中强阳性表达较高(32%),而正常组织中并未发现强阳性表达,两组间具有统计学差异(p<0.000 1)。结论:抑癌基因RASSF6在结直肠癌中表达升高可能是代偿性的结果,而其表达是如何调节的仍需进一步深入研究。; 陈尔飞贺红娟刘瑞涛王檬杨进; 关键词：结直肠癌

ONCOMINE、cBioPortal和UCSC Xena的介绍,以EGFR为例被引量：2: 2018年; 随着芯片和高通量测序技术的广泛应用,在肿瘤研究领域积累了越来越多的基因组学数据,这些数据库为生物学的研究提供了便利,为临床治疗奠定了基础。文中以EGFR在恶性胶质瘤中的研究为例来演示ONCOMINE数据库、c Bio Portal数据库和UCSC Xena数据库的使用过程及相关分析比较上述三个数据库的研究侧重点,为初学者介绍上述3个数据库以便更加快速的掌握并应用于科研工作中。; 朱子清李奇奇赵晓娟雷蕾

音乐治疗在生理心理疾病中的应用被引量：9: 2015年; 很多科学研究表明,复杂疾病是长期进化的结果,是由于内部遗传因素和外部环境因素共同作用而导致的。外部因素作用于内部遗传因素,导致了各种复杂疾病的发生。社会因素即是新发现的外部环境因素之一,而音乐是社会因素的重要组成部分。本篇综述旨在介绍音乐对健康的影响,以及如何将音乐治疗应用在生理和心理疾病中,来引起人们对音乐足够的重视,进而创建一个和谐的音乐鉴赏氛围。; 曾媛杨莹刘瑞涛杨进; 关键词：健康音乐治疗

古人类基因组与健康被引量：1: 2015年; 随着第二代测序技术的发展,古人类基因组的研究进展迅速,各个古人类种群的起源与基因流向逐一揭晓,从中找出了对现代人基因有贡献的古人类种群,由此引发了对人类起源的重新思考与探究。更为重要的是古人类基因存在与疾病相关的序列信息,不仅为现代人医疗保健研究提供了参考,还有助于研究现代人疾病的发生。本文就近年来具有代表性的古人类基因组研究成果及其中与健康相关的重要发现作简要介绍。; 刘瑞涛王檬贺红娟杨进; 关键词：健康

α-SMA与瓣膜性心房颤动患者心房纤维化的关系: 2017年; 目的研究α-SMA在瓣膜性心房颤动(AF)患者心房组织中的表达及其与心房纤维化的关系。方法选择因风湿性心脏瓣膜病住院并行瓣膜置换手术的患者84例(AF组39例、窦性心律组45例),收集整理患者的临床资料,并于手术中获取右心房组织(0.3~0.5cm3)。Masson染色观察两组患者右心房纤维化程度;Western blot及RTqPCR技术测定心房组织中α-SMA蛋白及mRNA的表达,相关分析探讨α-SMA与心房纤维化的关系。结果两组患者的性别构成比、年龄、血压、血常规、生化指标等差异无统计学意义(P>0.05),AF组左、右心房直径明显大于窦性心律组(P<0.05);Masson染色结果提示,AF组心房组织存在明显纤维化,且胶原容积分数与胶原含量显著高于窦性心律组(P<0.05);AF组患者心房组织α-SMA的mRNA及蛋白表达均显著高于窦性心律组(P<0.05);84例患者右心房组织中α-SMA的mRNA及蛋白表达量均与胶原含量呈正相关(相关系数分别为0.587、0.607;P值分别为0.029、0.014)。结论瓣膜性AF患者心房组织存在明显的心房纤维化,与α-SMA基因转录水平上调密切相关。; 潘军强张殿新孙超峰杨进; 关键词：风湿性心脏瓣膜病心房颤动心房纤维化

黏蛋白在结直肠癌中的表达及基因调控被引量：1: 2017年; 黏蛋白(MUCs)是一类高度糖基化、高分子量的糖蛋白,分布于许多腺上皮细胞表面及其分泌物中,根据其结构和功能的不同可分为膜结合型粘蛋白和分泌型粘蛋白。MUCs对结直肠具有保护作用,当其形成肿瘤时,MUCs的表达也会发生变化,并且与结直肠癌的发生和发展密切相关,是结直肠癌的重要标志物之一。本综述重点研究讨论结直肠癌中不同MUCs的表达变化及基因调控情况,旨在为结直肠癌致病机理研究提供新的思路和突破口,为疾病早期预警、预防、诊断和干预提供有效的方法和措施。; 赵晓娟杨莹雷蕾; 关键词：结直肠癌黏蛋白基因调控

微纤维蛋白1在瓣膜性心房颤动患者心房组织中的表达及其与心房纤维化的关系: 2017年; 目的:观察微纤维蛋白1(FBN-1)在风湿性心脏瓣膜病并发心房颤动(AF)患者心房组织中的表达,探讨FBN-1与心房纤维化的关系。方法:选择因风湿性心脏瓣膜病住院并行瓣膜置换手术的患者84例,分为AF组39例和窦性心律(SR)组45例;收集整理患者的临床资料,并于手术中获取右心房组织(0.3~0.5mm3)。Masson染色观察2组患者右心房纤维化程度;Western blotting法测定各组患者心房组织中FBN-1蛋白的表达,相关分析探讨FBN-1与心房纤维化的关系。结果:2组患者在性别构成比、年龄、血压、血常规和生化指标等方面比较差异无统计学意义(P>0.05)。AF组患者左和右心房直径明显大于SR组(P<0.05);Masson染色,AF组患者心房组织存在明显纤维化,AF组患者胶原容积分数和胶原水平明显高于SR组(P<0.05);AF组患者心房组织中FBN-1的蛋白表达水平明显高于SR组(P<0.05);瓣膜性AF患者右心房组织FBN-1蛋白表达水平与胶原水平呈正相关关系(r=0.544,P=0.021)。结论:瓣膜性AF患者心房组织存在明显的心房纤维化,与FBN-1基因转录水平上调有关联。; 潘军强张殿新孙超峰杨进; 关键词：风湿性心脏瓣膜病心房颤动心房纤维化

西北大学生命科学学院预防基因组医学研究所

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